RNA提取新手必读
RNA提取步骤
RNA提取步骤RNA(Ribonucleic Acid,核糖核酸)是细胞中一类重要的生物大分子,承担着重要的遗传信息传递和蛋白质合成的功能。
RNA提取是研究RNA生物学功能的基础,下面是RNA提取的基本步骤。
1.样本选择和收集:样本的选择和收集是RNA提取的第一步。
样本可以是任何含有RNA的细胞、组织或体液,如细菌、真菌、动物和植物组织。
在选择样本时,应注意保持样本的完整性和纯度,以最大限度地保留RNA的完整性。
2.细胞或组织破碎:细胞或组织破碎是RNA提取的关键步骤。
破碎细胞可以释放细胞质中的RNA,并使其易于提取。
通常有以下方式实现细胞或组织的破碎:-机械破碎:使用搅拌器或超声波浸没仪等设备将细胞或组织破碎。
-化学破碎:使用化学溶解剂如含有离子的缓冲液等破碎细胞。
-酶解:使用蛋白酶等酶类分解细胞或组织。
3.细胞或组织的裂解:细胞或组织裂解是破裂细胞膜和核膜,使RNA释放出来的步骤。
细胞或组织的裂解可以采取以下方法:-物理方法:如超声波、高温或高压等。
-化学方法:如使用制备裂解液溶解膜。
-酶解法:如使用蛋白酶等酶类裂解细胞膜。
4.RNA的纯化:在RNA提取过程中,纯化RNA以消除DNA、蛋白质和其他杂质是非常重要的。
以下是常见的纯化步骤:- DNase处理:用于降解DNA并消除其对RNA的干扰。
-蛋白酶处理:用于降解蛋白质并消除其对RNA的干扰。
-异丙醇沉淀:用来沉淀RNA,将其分离出其他溶液中的杂质。
-高盐沉淀:用来消除RNA的杂质。
5. 经过上述步骤后,可以使用RNA作为后续实验的模板,如逆转录PCR(Reverse Transcription PCR)进行mRNA的合成和扩增、Northern blotting进行RNA的检测等。
在RNA提取过程中,需要注意以下几点:-提取操作应注意消除污染源,严格遵守无菌技术,避免RNA的降解和污染。
- 所有操作和提取溶液都应严格遵守操作规范,使用无RNase的耗材和试剂。
RNA抽提
RNA抽提一、操作中需要注意的几点1.进行RNA抽提前,要将所有的塑料用品用0.1%的DEPC水浸泡过夜,之后装入容器以铝膜封口再进行高压灭菌(离心管最好使用Rnase-free的产品)。
2.所使用的组织最好是新鲜的,如果分离的组织不立即使用,可在-70℃或液氮条件下保存半年左右。
3.所需要的氯仿,酒精,异丙醇等都要使用新开封或RNA抽提专用的。
4.验过程中,为防止RNase从唾液、汗等途径混入,请使用口罩和手套等。
操作中每次双手离开超净超净台后,再进入时都应更换手套。
5.一定要注意冰上操作,低温离心。
操作尽量迅速以减少RNA抽提的时间。
二、RNA抽提步骤(使用上海生工的UNIQ-10柱式Trizol总RNA抽提试剂盒)1.如使用组织,请使用液氮在碾钵中将组织碾磨成粉末,趁液氮尚未挥发光时,将粉末转移到1.5ml离心管中,每50mg动物组织加0.5ml的Trizol。
其他种类样品的最大使用量参见下表:样品种类 动物细胞 动物组织 细菌 酵母 植物组织 丝状真菌 最大使用量 1×10750mg 1×1091×107100mg 100mg 2.用1ml的一次性注射器抽吸离心管中的匀浆两次以剪切基因组DNA,然后直接用注射器将样品转移到Rnase-free的离心管中。
3.加入100μl的氯仿/异戊醇(24∶1),剧烈震荡30s。
4.台式离心机上,12000rpm,4℃离心5 min。
5.将上清液小心转移到无菌1.5ml Rnase-free离心管中,加入150μl无水乙醇,混匀。
6.将上述混匀的溶液全部转移到放于2ml收集管内的UNIQ-10柱中,室温放置2min,之后8000rpm低温离心1min。
7.小心取出柱子,弃去收集管中的废液,将柱子放回收集管中,加入450μl RPE Solution,10000rpm低温离心30s。
8.重复步骤7一次。
9.小心取出柱子,弃去收集管中的废液,将柱子放回收集管中,10000rpm低温空转15s。
RNA提取步骤及注意事项
RNA分离纯化的原理、提取步骤及注意事项一、分离纯化的基本原理研究基因的表达和调控时,常常要从组织和细胞中分离和纯化RNA。
RNA质量的高低常常影响cDNA库,RT-PCR和Northern Blot等分子生物学的成败。
Trizol是一种新型总RNA提取试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,抑制细胞释放出的核酸酶。
二、需自备的试剂和材料无水乙醇、氯仿、1.5mlEP管(无RNase)、枪头(无RNase)、异丙醇、水(DEPC处理)低温离心机三、提取步骤1、从组织中提取总RNA①液氮研磨。
组织块直接放入研钵中,加入少量液氮,迅速研磨,待组织变软,再加少量液氮,再研磨,如此三次,按50-100mg组织/mlTrizol加入Trizol,转入离心管进行第二步操作。
②匀浆。
组织样品按50-100mg组织/mlTrizol加入Trizol,另外,组织体积不能超过Trizol体积的10%,否则匀浆效果会不好,用电动匀浆器充分匀浆约需1-2分钟。
2、从细胞中提取总RNA①培养贴壁细胞:不需消化,可直接用Trizol进行消化、裂解,操作步骤:吸尽培养液,用PBS洗涤细胞2-3次,按10cm2/mlTrizol比例加入Trizol,吹打,使细胞充分裂解。
②对于悬浮细胞,可直接收集、裂解,每mlTrizol可裂解5×106动物、植物或酵母细胞,或107细菌细胞。
操作步骤:收集细胞,600g离心5min,弃上清,PBS洗涤细胞2-3次。
③细胞或组织加入Trizol后,室温放置5min,使其充分裂解。
(此时可放入-70℃长期保存。
④12000rpm离心5min,弃沉淀,上清吸入到另一个RNase-free的EP管中,按200μL氯仿/mlTrizol加入氯仿,振荡混匀后室温放置15min。
(禁用涡旋振荡器,以免基因组DNA断裂)。
⑤4℃,12000rpm离心15min,吸取上层水相,至另一个离心管中(RNase-free)(千万不要吸取中间界面;若同时提取DNA和蛋白质,则保留下层酚相保存于4℃冰箱,如只提取RNA,则弃下层酚相。
rna提取的关键操作及注意事项
rna提取的关键操作及注意事项RNA提取是生物学研究和临床诊断中必不可少的操作之一,它能够从细胞、组织中提取RNA分子,并进行分析和检测。
RNA提取的关键
操作和注意事项如下:
1. 样本的选择和采集:生物样品是RNA提取的基础,样品的选择
和采集直接影响到提取效率和RNA的质量。
应选择新鲜的细胞和组织,采集后应立即转移到冰上并迅速进行下一步操作。
2. 细胞和组织的破碎:RNA是由核酸和蛋白质组成的,因此需要
将样品进行破碎,以释放RNA。
常用的破碎方法包括机械破碎和化学破碎。
机械破碎主要通过磨砂器、超声波等物理方法进行,而化学破碎
主要通过酚-氯仿法或三氯乙酸进行。
3. RNA的纯化:纯化是RNA提取过程中最重要的一步,目的是去
除杂质和提高RNA的纯度。
它常采用硅胶柱层析法、钠酸盐沉淀法等。
在纯化过程中需要注意避免RNA降解,因此要严格控制时间、温度和
pH值等因素。
4. RNA的定量和质量分析:为了确保RNA的质量和纯度,需要对
提取出来的RNA进行定量和质量分析。
定量可以使用紫外分光光度计,质量可以通过琼脂糖凝胶电泳、比色法和荧光标记等进行分析。
总之,在RNA提取过程中,样品选择和采集、细胞和组织的破碎、RNA的纯化以及RNA的定量和质量分析是关键步骤。
在实际操作中,还
应注意严格控制时间、温度、pH值等因素,避免RNA的降解和污染。
同时,在选择RNA提取方法时,也应根据需要选择合适的方法。
这些注意事项都能够提高RNA提取的效率和RNA的质量,有助于后续的研究和诊断。
Trizol法提取RNA实验步骤及原理(新手详细注释版)
Trizol法提取RNA实验步骤及原理(新手详细注释版)Trizol法提取RNA实验步骤及原理(新手详细注释版)一、实验步骤1. 涂布区域准备- 确保实验室台面干净整洁,并消毒工作区域。
- 准备所需的试剂和材料,包括Trizol试剂、异丙醇、70%乙醇、无菌乙酸纯水等。
2. 细胞样本处理- 从培养皿中收集所需的细胞样本,注意避免污染。
- 使用无菌PBS缓冲液洗涤细胞,以去除培养基和细胞碎片。
- 加入适量的Trizol试剂至细胞样本中,充分悬浮细胞。
- 注意:为了保护RNA的完整性,在细胞样本处理过程中尽量迅速操作,避免长时间接触Trizol试剂。
3. 提取RNA- 将含有细胞样本和Trizol试剂的混合物转移到无菌离心管中。
- 加入适量的氯仿,摇匀混合,并静置15分钟,使混合物体相分离。
- 低速离心10分钟,将上层的无色透明液体转移到新的无菌离心管中。
4. 分离RNA- 加入等体积的异丙醇,轻轻倾斜离心管,使RNA沉淀形成。
- 低速离心10分钟以沉淀RNA,上清液中通常含有DNA。
- 倒掉上清液,并加入70%乙醇洗涤RNA沉淀,轻轻颠倒离心管以洗涤RNA。
- 低速离心5分钟,倒掉乙醇。
5. 干燥RNA- 用洗涤过的无菌乙酸纯水溶解RNA沉淀,轻轻颠倒离心管以溶解RNA。
- 将溶解的RNA转移至无菌离心管中。
- 在室温或37摄氏度下迅速干燥RNA,避免长时间曝露。
6. 储存RNA- 使用RNase-free水溶解RNA沉淀,测定RNA的浓度和纯度。
- 分配等量的RNA至多个RNase-free离心管中,储存在-80摄氏度的冰箱中。
二、实验原理Trizol法是一种常用于提取RNA的方法,其原理如下:1. 细胞破裂- Trizol试剂能够迅速破坏细胞膜,使细胞释放出RNA。
- Trizol试剂中含有酚和氯仿,酚用于破坏脂质,氯仿用于改变混合物的密度,从而使RNA与其他细胞成分分离。
2. 分离RNA- 经过破裂后,细胞内的DNA、RNA和蛋白质等成分被混合在一起,形成上清液。
RNA提取方法_高等教育-生物学
总RNA的提取(Trizol法提取)在收集到生物材料之后,最好能即刻进行RNA制备工作。
若需暂时储存,则应以液氮将生物材料急速冷冻后,储存于-80℃冷冻柜。
在制备RNA时,将储存于冷冻柜的材料取出,立即以加入液氮研磨的方式打破细胞,不可以先行解冻,以避免RNase的作用。
1.提取组织RNA时,每50~100mg组织用1ml Trizol试剂对组织进行裂解;提取细胞RNA时,先离心沉淀细胞,每5-10 ╳106个细胞加1ml Trizol后,反复用枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞;2.将上述组织或细胞的Trizol裂解液转入EP管中,在室温15~30C下放臵5分钟;3.在上述EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.2ml氯仿的量加入氯仿,盖上EP管盖子,在手中用力震荡15秒,在室温下(15℃~30℃)放臵2~3分钟后,12000g(2℃~8℃)离心15分钟;4.取上层水相臵于新EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.5ml异丙醇的量加入异丙醇,在室温下(15℃~30℃)放臵10分钟,12000g(2℃~8℃)离心10分钟;5.弃上清,按照每1ml TRIZOL加1ml 75%乙醇进行洗涤,涡旋混合,7500g(2℃~8℃)离心5分钟,弃上清;6.让沉淀的RNA在室温下自然干燥;7.用Rnase-free water 溶解RNA沉淀。
PCR实验室常用DNA聚合酶有三种:TaKaRa Taq TM,TaKaRa E X Taq TM和Pyrobest TM DNA Polymerase。
TaKaRa Taq TM是一般的DNA聚合酶,保真性较差,但价钱便宜,一般用于基因表达的检测等。
TaKaRa E X Taq TM是具有Proof reading 活性的耐热性DNA聚合酶,具有一定的保真性,而且其扩增得到的PCR产物3’端附有一个“A”碱基,如果希望直接将产物克隆到T-vector可以用此酶。
Pyrobest TM DNA Polymerase也是具有Proof reading活性的耐热性DNA聚合酶,其特点是保真性极高,扩增得到的PCR产物为平滑末端。
rna提取过程中的关键步骤及注意事项
一、概述RNA提取是生物学研究中的重要步骤,它涉及到从细胞或组织中提取出RNA分子,为后续的分子生物学实验和分析提供基础数据。
在RNA提取过程中,有许多关键步骤和注意事项需要注意,才能确保提取到高质量的RNA样品。
本文将重点介绍RNA提取过程中的关键步骤及注意事项。
二、样品采集和保存1. 样品的采集要尽量避免受到外界环境的污染,采集器具要事先经过严格的消毒处理。
2. 采集后的样品应立即冷藏或置于液氮中保存,避免RNA降解。
三、细胞破碎1. 细胞破碎是RNA提取的第一步,直接影响到RNA的得率和质量。
常用的方法包括酚-氯仿法、超声波法和离心破碎法等。
2. 选择合适的细胞破碎方法,要充分破碎细胞膜,释放出RNA分子,同时避免RNA的降解。
四、蛋白质沉淀1. 蛋白质沉淀的目的是去除DNA和蛋白质,以纯化RNA。
常用的方法包括酚-氯仿法和硅胶柱法。
2. 在进行蛋白质沉淀时,要注意去除酚相和混合相中的DNA和蛋白质,以免对RNA纯化产生影响。
五、RNA沉淀和洗涤1. RNA沉淀的方法有乙醇沉淀法和硅胶柱法等,选择合适的方法要根据样品的特点和后续实验的需要进行。
2. 在RNA洗涤的过程中,要充分去除盐和其他杂质,以保证提取到干净的RNA样品。
六、RNA溶解和质量检测1. RNA溶解的过程要充分溶解RNA,并保证溶解液的质量纯净。
2. 对提取得到的RNA样品进行浓度和完整性的检测,以确保RNA的质量达标。
七、总结RNA提取是分子生物学研究中的重要步骤,本文介绍了RNA提取过程中的关键步骤和注意事项。
通过严格控制每个步骤,可以保证提取到高质量的RNA样品,为后续的实验和分析提供可靠数据。
希望本文能够帮助读者更好地理解RNA提取过程,并在实验操作中取得更好的效果。
八、RNA存储和稳定性1. 存储RNA样品时,应尽量避免反复冻融,因为这样容易导致RNA 降解。
合适的储存温度通常为-80摄氏度。
2. 另外,干燥的RNA样品更容易保存,因此可以考虑使用适当的稳定剂,如DEPC水或RNAlater等,来保护RNA在样品采集至提取过程中的稳定性。
RNA提取方法总结
RNA提取方法总结这篇文章主要讲的是几种常用的RNA提取方法。
1、异硫氰酸胍氯化铯超速离心法原理:使用蛋白质变性剂异硫氰酸胍有效抑制RNA酶的活性,经过起始密度为 1.78g/ml的氯化铯介质,进行密度梯度超速离心,RNA 沉淀于管底,而DNA与蛋白质在上清中。
使用这种方法,不但能得到高质量的RNA,而且能同时分离出细胞染色体DNA.本法对于冷冻时间长、细胞质和细胞核不易分离的组织标本以及富含RNA酶的组织细胞(如胰腺)的RNA提取尤其适合。
此法提取的RNA 的质量好和成功率高,已成为提取哺乳动物细胞RNA的常规方法。
其缺点是操作复杂、流程长,一次提取的样品数量有限。
2、盐酸胍-有机溶剂法本法有MacDonald 1987年在Strohman报道的方法基础上改进而成的,适用于没有超速离心及设备的情况下提取细胞总RNA。
它利用盐酸胍抑制RNA酶,匀浆裂解细胞,有机溶剂抽提去除蛋白质,通过选择性沉淀RNA分子而去除DNA,提取的RNA质量较好,但整个操作过程繁杂费时。
3、氯化锂-尿素法本法首先由Auffray报道,利用高浓度尿素变性蛋白质同时抑制RNA 酶,3mol/L LiCl选择性沉淀RNA。
其缺点是有时会存在DNA污染,LiCl 沉淀RNA会丢失一些小分子量的RNA,如5S RNA等。
优点是快速简捷,尤其适用于大量样品少量组织细胞的RNA提取,其质量可以满足Northern分析,Oligo(dT)提取mRNA,SI核酸酶或RNase保护实验等。
本法每提取107个细胞能提取总RNA约10 g。
4、热酚法本法主要用于少量细胞样品RNA提取,其产量不高,但简单易行。
5、快速提取法本法主要用于培养细胞,通过0.5%SDS裂解细胞,酚抽提去除蛋白质和DNA沉淀,快速纯化RNA。
6、细胞质RNA提取法本法主要适用于培养细胞,首先去除细胞核,然后用蛋白酶K消化蛋白质,酚/氯仿抽提去除蛋白质。
操作简单,同时能进行多个样品操作,多数步骤在室温下进行,提取的RNA质量较高,可满足体外无细胞翻译系统、cDNA合成、引物延伸以及核酸酶SI保护实验。
Trizol法提取RNA实验步骤及原理(新手详细注释版)
Trizol法提取RNA实验步骤及原理(新手详细注释版)RNA提取是一种常用的实验技术,它可以用于研究基因表达、蛋白质合成等方面。
而Trizol法是一种常用的RNA提取方法,下面我将详细介绍该方法的实验步骤及原理。
一、实验材料和设备1. 细胞样本:如洋葱、酵母等植物或动物细胞;2. Trizol试剂盒:包括Trizol reagent、DMEM/F12培养基、异丙醇、氯仿等试剂。
3. 离心机:用于分离细胞和RNA;4. 紫外分光光度计:用于测定RNA的浓度和纯度。
二、实验步骤1. 取适量的细胞样本,加入适量的DMEM/F12培养基中,用离心机离心去除细胞碎片和杂质。
2. 将上清液转移到新的管子中,加入2 mL异丙醇,轻轻摇匀,使其与细胞充分混合。
3. 加入1 mL Trizol reagent,混匀后室温下静置10 min;4. 离心管中液体分为4层,从上往下分别是黄色(含有RNA)、白色(含有蛋白质)、透明(上清液)和红色(含有DNA)。
取出黄色层进行下一步处理。
5. 用吸头将黄色层的RNA吸取到一个新的试管中,加入适量的氯仿,轻轻摇匀。
6. 离心试管,将RNA和氯仿分离。
7. 用吸头将上层的白色RNA溶液吸出一部分,加入等量的异丙醇,混匀后离心。
8. 将上清液倒掉,留下含RNA的沉淀物。
9. 用紫外分光光度计测定RNA的浓度和纯度。
三、实验原理Trizol法提取RNA的原理是利用Trizol reagent中的Trizol和氯仿对细胞进行裂解,使RNA释放出来。
具体来说,Trizol reagent中的Trizol是一种有机溶剂,它能够破坏细胞膜并将细胞内的RNA溶解在水中。
而氯仿则是一种脂溶性溶剂,它能够与RNA结合形成复合物,使得RNA更容易被提取出来。
在实验过程中,首先加入异丙醇的作用是破坏细胞膜,使RNA更容易释放出来。
然后加入Trizol reagent,使其与细胞充分混合并裂解细胞。
提rna步骤
提rna步骤RNA是一种重要的生物分子,它在细胞内起着传递遗传信息、调节基因表达等重要作用。
为了研究RNA的功能和机制,科学家们需要对RNA进行提取和纯化。
本文将介绍RNA提取的步骤和注意事项。
一、材料准备1.细胞样本:可以是组织、细胞培养物等。
2.离心管:用于分离样本中的细胞。
3.离心机:用于离心细胞。
4.细胞裂解液:可以是Trizol、RNAiso等商用试剂,也可以是自制的裂解液。
5.异丙醇:用于沉淀RNA。
6.洗涤液:可以是75%的乙醇、70%的乙醇等。
7.去离子水:用于稀释试剂和溶解RNA。
8.琼脂糖凝胶:用于纯化RNA。
二、提取步骤1.制备样品将细胞样本收集到离心管中,离心机离心10分钟,将上清液倒掉,留下细胞沉淀。
2.细胞裂解加入适量的细胞裂解液,使细胞完全裂解,释放RNA。
3.分离RNA加入等体积的异丙醇,混匀,离心10分钟,收集上清液,其中含有RNA。
4.沉淀RNA将上清液加入等体积的异丙醇,混匀,离心10分钟,收集沉淀,其中富含RNA。
5.洗涤RNA用75%的乙醇洗涤RNA沉淀,去除杂质。
6.溶解RNA用去离子水溶解RNA沉淀,制备1mg/ml的RNA溶液。
7.纯化RNA将RNA溶液加入琼脂糖凝胶管中,离心10分钟,收集上清液,其中含有纯化的RNA。
三、注意事项1.样品的处理要快速,避免RNA被降解。
2.细胞裂解液的选择要根据实验需要进行优化。
3.异丙醇的体积要与上清液相等,否则RNA沉淀不完全。
4.洗涤RNA时要用足够的乙醇,否则杂质无法完全去除。
5.制备RNA溶液时要使用去离子水,避免RNA被污染。
6.琼脂糖凝胶的选择要根据RNA大小和纯度要求进行优化。
7.操作过程中要注意无菌操作,避免RNA被污染。
总之,RNA提取是RNA研究的基础工作,正确的提取步骤和注意事项能够保证RNA的纯度和完整性,为后续实验提供可靠的基础。
rna的提取方法
rna的提取方法RNA的提取是从生物样品中获取RNA的过程,这个过程通常包括以下几个步骤:1. 样品收集:根据需求选择生物样品,如细胞、组织、血液等,并采用合适的方法收集。
2. 细胞破碎:通过细胞破碎,将细胞内的RNA释放到溶液中。
破碎方法包括机械破碎、超声波破碎、化学破碎等。
3. RNA分离:分离RNA和其他分子,如DNA、蛋白质等。
4. RNA纯化:将RNA纯化,去除杂质,获得高质量RNA。
纯化方法包括硅胶柱层析、离心管基质层析等。
下面详细介绍三种常用的RNA提取方法:1. 酚-氯仿法这种方法可用于组织和细胞的RNA提取。
首先使用酚将细胞或组织破碎,然后加入等体积的氯仿,混匀,使DNA和蛋白质沉淀于底部,RNA在上层水相中得到富集。
再通过异丙醇沉淀,将RNA分离出来。
最后,通过洗涤和纯化过程,得到高质量RNA。
酚-氯仿法是一种经济、简单和高收率的提取RNA的方法。
2. 硅胶柱纯化法该方法是一种高效、快速且高纯度的RNA提取方法,适用于多样品处理。
该方法使用硅胶柱将RNA分离,并消除DNA和酶的污染。
该方法能够从各种样本中提取高品质RNA,可用于测序、杂交和原位杂交等分子生物学应用。
3. 针头粘贴法这种方法是一种快速简单的RNA提取法,特别适用于某些免疫细胞和细胞样品。
利用针头从样品中取出细胞,将其粘贴在聚丙烯酰胺凝胶上,通过离心将RNA分配到凝胶上。
该方法提取RNA量小,但可以高度升质和纯化的RNA,是一种快速且相对简单的RNA提取方法。
总之,根据不同的实验目的,可选择适用于不同的RNA提取方法。
RNA提取实验操作步骤、注意事项及问题指南
RNA提取实验操作步骤、注意事项及问题指南RNA提取是一项重要的实验技术,也是分子生物学和基因表达研究的前提之一。
RNA提取的操作步骤、注意事项和可能出现的问题是影响实验结果的关键因素。
本文将介绍RNA提取实验的操作步骤、注意事项和问题指南,以便帮助读者更好地完成RNA提取实验。
RNA提取实验操作步骤1. 样本的准备在实验开始前,需要准备好样本。
样本可以是组织、细胞、菌落等,在RNA提取中通常使用 TRIzol 或 RNeasy 等试剂进行样品裂解和提取。
样本的数量和来源需要根据实验的需要来决定。
2. 细胞裂解样品准备好之后,需要进行细胞裂解,使细胞内部的 RNA 释放出来。
裂解的方法可以是机械裂解、化学裂解或声波裂解等。
3. RNA 的提取和纯化经过细胞裂解后,需要使用 RNA 提取试剂对 RNA 进行提取和纯化。
经过提取和纯化后,可以通过检测 A260/A280 值的比例来确定 RNA 的纯度和浓度。
4. 聚合酶链式反应(PCR)检测经过 RNA 的提取和纯化之后,需要进行 PCR 检测,确定 RNA 是否已经被成功提取和纯化。
PCR 检测需要使用适当的引物和探针,并遵守相应的反应条件和分析方法。
RNA提取实验注意事项1. 样品选择选择合适的样品,保证样品的活性和稳定性。
不同类型的样品需要使用不同的RNA 提取试剂,因此需要选择适当的试剂和方法。
2. 操作规范在 RNA 提取过程中,需要保持操作规范,如穿戴实验手套和实验衣服等,避免 RNA 受到污染。
在实验过程中要注意操作细节,如注射器和离心管应保证干净和无漏,对样品的取用和储存要进行标记和记录。
3. RNA 的质量控制在 RNA 提取的过程中,需要进行质量控制,如测定 RNA 的纯度和浓度等。
在进行下一步操作之前,必须检查 RNA 的质量和质量指标,如 A260/A280 值的比例要在 1.8 ~ 2.0 之间, RNA 的完整性要保证。
rna提取方法
rna提取方法
RNA提取方法。
RNA提取是分子生物学研究中的重要步骤,其质量和纯度直接影响到后续实验结果的准确性和可靠性。
在进行RNA提取时,我们需要注意以下几点:
1. 样本的收集和保存。
在进行RNA提取之前,首先要注意样本的收集和保存。
样本的收集要尽量避免污染和降解,可以使用RNAlater等稳定剂来保存样本。
另外,样本的数量也要足够,以确保提取得到足够的RNA。
2. 细胞破碎。
细胞破碎是RNA提取的关键步骤之一。
常用的方法包括机械破碎、化学裂解和超声波破碎等。
在选择破碎方法时,要根据样本的性质和实验的需要来确定。
3. RNA提取试剂盒的选择。
选择合适的RNA提取试剂盒也是非常重要的。
市面上有各种各样的RNA提取试剂盒,包括手工操作和自动化操作的。
在选择试剂盒时,要考虑到样本的种类、数量和纯度要求等因素。
4. RNA的纯化。
在提取RNA后,还需要进行纯化步骤,以去除DNA、蛋白质和其他杂质。
常用的纯化方法包括硅胶柱纯化、磁珠分离和乙醇沉淀等。
在纯化过程中,要注意避免RNA的降解和损失。
5. 质量检测。
最后,要对提取得到的RNA进行质量检测。
常用的方法包括紫外分光光度法(UV)和琼脂糖凝胶电泳等。
通过检测RNA的浓度和完整性,可以评估提取的质量和纯度。
总之,RNA提取是一个复杂而又关键的步骤,需要我们在操作过程中严格控制各个环节,以确保提取得到高质量的RNA。
希望本文的内容能够对您在RNA提取过程中有所帮助。
实验一RNA提取方法及原理
实验一RNA提取方法及原理RNA提取是从生物样本中提取RNA分子的一系列操作过程,其中包括细胞破碎、RNA与其他分子的分离和纯化。
RNA提取可用于研究基因表达、编码RNA功能等生物学研究领域。
一、RNA提取方法1.直接方法直接法是一种快速且简单的RNA提取方法,适用于较小的样本。
该方法不需要扩增RNA,并且避免了DNA污染。
主要步骤包括细胞破碎、蛋白质沉淀、RNA沉淀和洗涤。
直接方法可用于提取总RNA或其中一种特定类型的RNA(如mRNA)。
2.两步法两步法是RNA提取的常用方法之一,适用于大多数样本。
首先使用各种方法破碎细胞,使RNA释放出来。
然后通过蛋白质沉淀、RNA沉淀和洗涤来纯化RNA。
两步法具有更好的RNA纯度和更高的产量。
3.树脂结合法树脂结合法是一种通过RNA与树脂结合来纯化RNA的方法。
树脂有很强的亲和力,可以选择性地结合RNA。
树脂结合法适用于小样本量或从混合样本中纯化特定RNA的情况。
4.直接PCR法直接PCR法是一种将RNA直接用于PCR扩增的方法。
它通过添加DNA合成酶和逆转录酶,将RNA转录成cDNA,并立即进行PCR扩增。
二、RNA提取原理RNA提取的原理是利用物理和化学方法破坏细胞膜,使RNA释放出来,然后通过沉淀和洗涤来纯化RNA。
细胞破碎:细胞破碎的方法有多种选择,包括机械破碎、酶解和化学破碎等。
机械破碎可通过震荡或高压细胞破碎仪实现。
酶解法是利用酶消化细胞膜,促进RNA的释放。
化学破碎是利用化学物质,如氯仿、酚和乙酸酐等。
蛋白质沉淀:加入蛋白质沉淀剂(如酒精或异丙醇)可使蛋白质沉淀而RNA在上清液中。
RNA沉淀:加入RNA沉淀剂,通过离心将RNA从上清液中沉淀下来。
RNA沉淀后,上清液中的DNA和蛋白质会被除去。
洗涤:通过加入酒精或异丙醇溶液洗涤RNA,除去残留的污染物,如盐和酚。
在RNA提取过程中,需要注意一些关键点,以确保提取到高质量的RNA。
例如,实验过程中需注意酶和核酸酶的污染,使用无核酸酶的试剂和工具。
RNA的提取方法
RNA的提取方法RNA提取是生物学中一项非常重要的实验技术,它可以用于研究RNA在生物体内的表达以及功能调控。
RNA提取的方法有多种,下面将介绍一些常用的RNA提取方法。
1.总RNA提取:总RNA提取是最常用的RNA提取方法之一,它可以提取细胞或组织中的所有RNA种类,包括mRNA、rRNA和tRNA等。
总RNA提取的步骤包括细胞或组织的裂解、蛋白酶处理、RNA溶液的提取和纯化等。
提取时可以使用商业化的总RNA提取试剂盒,也可以自制试剂进行提取。
2.mRNA提取:mRNA是总RNA中占比相对较小的一部分,它包含了大部分的转录信息。
mRNA的提取主要是通过使用寡聚dT寡核苷酸的亲和浸润材料,富集含有poly(A)尾的RNA分子。
提取步骤包括细胞裂解、磁珠富集和纯化等。
3. miRNA提取:miRNA是一类长度较短的非编码RNA,具有多种生物学功能。
miRNA的提取相对较为复杂,步骤包括细胞裂解、蛋白酶处理、有机溶剂萃取、硅胶膜纯化和乙酸乙酯沉淀等。
商业化的miRNA提取试剂盒则简化了这一过程。
4.胚胎RNA提取:胚胎RNA提取主要适用于研究早期胚胎发育过程中的基因表达变化。
提取步骤包括选择合适的胚胎发育阶段、胚胎裂解、RNA的提取和纯化等。
在这个过程中,需要注意减少RNA的降解,因为胚胎RNA含有RNA酶。
5.组织RNA提取:组织RNA提取是为了研究不同组织中特定基因的表达差异。
提取组织RNA的步骤包括组织的裂解、蛋白酶处理、RNA的提取和纯化等。
组织RNA的含量通常较少,需要采取额外的措施来提高RNA的得率。
6.体液RNA提取:体液RNA的提取用于研究循环系统或分泌系统中的RNA信息。
体液RNA的提取步骤包括样本的离心、细胞裂解、RNA的提取和纯化等。
一般情况下,体液RNA的浓度较低,因此需要使用高敏感的RNA提取方法。
总的来说,RNA提取是RNA研究的基础,根据不同的研究目的和样本类型选择合适的RNA提取方法非常重要。
RNA提取——精选推荐
RNA 提取注意事项1迅速灭活内源的RNA酶,以防止RNA降解以下3个方法均可有效使内源RNA酶失活:1)用含离液(如胍盐)的细胞裂解液收获样品,并立即匀浆。
2)用液氮瞬间冻结样品。
值得特别注意的是:组织块必须保证足够小,在浸入液氮的瞬间就能冻结,以确保瞬间令RNA酶失活。
3)立即将样品置于RNAfixer无液氮RNA样品储存液中。
它是一种水相、无毒的收集试剂,能立即稳定并保护完整、未冻结的组织和细胞样品中的RNA。
关键要点是组织样品切片一定要够薄(<0.5 cm),这样RNAfixer才能在RNase破坏RNA之前迅速渗入组织块中。
2.使用正确的细胞或组织储存条件在样品用液氮瞬间冻结之后,应该储存在-80°C,千万不能解冻。
即使是置于含有胍盐的裂解液中作匀浆前的短暂解冻,也会导致RN A的降解和损失。
瞬间冻结的组织应该首先在超低温条件下先研磨成粉,然后置于裂解液中进行匀浆。
RNAfixer使样品储存更为便利。
储存在RNAfixer中的细胞或组织可在室温下稳定保存长达1个星期,在4°C可稳定保存长达1个月,或永久保存在-20°C。
3.破壁方法细胞或组织的彻底匀浆对RNA提取来说,是一个很关键的步骤,它能够防止RNA的损失和降解。
匀浆的方法应根据细胞或组织的类型来选择。
大部分培养的细胞可以置于细胞裂解液中,通过简单的涡旋震荡来匀浆;而动物组织、植物组织、酵母和细菌、真菌则常常需要更加剧烈的方法,通常用液氮研磨。
比如说细菌(特别是革兰氏阳性菌)的细胞壁,就需要溶菌酶消化来实现彻底的细胞裂解和R NA的最大回收。
酵母和革兰氏阳性菌通常还需要液氮研磨过程中加入玻璃微珠帮助破壁,酵母提取也可以加入诸如Lyticase等破壁酶帮助破壁,再用TRIpure或RNApure进行提取。
4.选择最好的RNA分离方法现有众多的RNA分离方法也许令人难以取舍。
目前最简单也是最安全的方法是柱式分离,如RNApure 因为操作简单,时间短,纯度高而受到大家的喜爱,RNApure不需要DNA酶消化DNA,节省了时间,避免RNA的降解,从而提高了产量;相对非柱式分离(如TRIZOL),去除蛋白及其他杂质干净,提高了纯度,对于细胞、组织、一般植物均非常适合。
RNA抽提详细步骤[修改版]
第一篇:RNA抽提详细步骤RNA抽提指南(TRIZOL法) RNA抽提指南(TRIZOL法) 注意事项:* 全程佩戴一次性手套。
皮肤经常带有细菌和霉菌,可能污染RNA的抽提并成为RNA酶的来源。
培养良好的微生物实验操作习惯预防微生物污染。
* 使用灭菌的,一次性的塑料器皿和自动吸管抽提RNA,避免使用公共仪器所导致的RNA酶交叉污染。
例如,使用RNA探针的实验室可能用RNA酶A 或T1来降低滤纸上的背景,因而某些非一次性的物品(如自动吸管)可能富含RNA酶。
* 在TRIZOL 中,RNA 是隔离在RNA 酶污染之外的。
而对样品的后续操作会要求用无RNA 酶的非一次性的玻璃器皿或塑料器皿。
玻璃器皿可以在150°C 的烘箱中烘烤4 小时。
塑料器皿可以在0.5 M NaOH 中浸泡10 分钟,用水彻底漂洗干净后高压灭菌备用。
抽提步骤:1.匀浆化作用通过离心来沉淀细胞后,弃上清,用移液管加TRIZOL试剂反复吹打来裂解细胞至均一通亮的液态后,将匀浆样品在15—30°C 条件下孵育5 分钟以使核蛋白体完全分解。
(每5—10×106的动物细胞,植物或酵母菌细胞或每1×107 细菌加1ml的TRIZOL。
在加入TRIZOL前应避免洗涤细胞因为那样会增加mRNA降解的可能性。
)2.分离阶段每1 mlTRIZOL 加0.2 ml 氯仿。
盖紧样品管盖,用手用力摇晃试管15 秒并将其在30°C 下孵育2—3 分钟。
在2—8°C 下以不超过12,000×g 的离心力高速冷冻离心15 分钟。
离心后混合物分成三层:下层红色的苯酚-氯仿层,中间层,上层无色的水样层。
RNA 无一例外地存在于水样层当中。
水样层的容量大约为所加TRIZOL 容量的60% 3.RNA的沉淀将水样层转移到一干净的试管中,通过将水样层和异丙醇混合来沉淀RNA。
最初均化时的每1 mlTRIZOL 对应0.5 ml 异丙醇。
RNA抽提知多少
RNA抽提知多少我们在工作中时常遇到这种情况,千辛万苦取到了几个样本,兴高采烈地送去做测序,本以为很快就能拿到结果,结果辛辛苦苦抽提的RNA降解了。
今天小编带来满满的干货,RNA提取小课堂开课啦,我们就来聊一聊关于RNA抽提的那些事儿吧~希望对于正在进行实验的小伙伴们提供一些帮助,前排搬好小板凳,敲黑板划重点啦~RNA是以DNA的一条链为模板,以碱基互补配对原则,转录形成的一条单链,主要功能是使遗传信息能够翻译成蛋白行使生物学功能,是遗传信息向表型转化过程中的桥梁。
当我们研究基因的表达和调控时,第一步需要做的就是从组织或细胞中分离和纯化RNA。
1首先了解一下RNA提取的几个小原则1.保证RNA的完整性;2.获得高纯度的RNA;3.操作简便,稳定性强。
2明确抽提RNA的使用目的RNA用于不同的后续实验,其质量要求不尽相同。
cDNA文库构建要求RNA完整而无酶反应抑制物残留;Northern对RNA完整性要求较高,对酶反应抑制物残留要求较低;RT-PCR对RNA完整性要求不太高,但对酶反应抑制物残留要求严格。
因此,明确实验目的是进行后续实验的首要条件。
3Trizol法抽提Trizol是一种总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速裂解细胞,抑制细胞释放出的核酸酶活性。
目前常用Trizol法进行提取组织或细胞中的RNA。
1.Trizol作用原理在匀质化或溶解样品中,Trizol试剂可保持RNA的完整性,同时能破坏细胞及溶解细胞成分。
加入氯仿离心后,裂解液分层成水相和有机相。
RNA存在于水相中。
水相转移后,RNA通过异丙醇沉淀回收。
移去水相后,用乙醇可从中间相沉淀得到DNA,加入异丙醇沉淀可从有机相得到蛋白质。
2.标准Trizol提取步骤液氮研磨--加入Trizol裂解混匀--加入氯仿抽提--离心--加入异丙醇沉淀--离心--酒精洗涤--离心--无酶水重溶。
3.具体实验步骤(1)实验准备RNase free的枪头、EP管、PBS、Trizol、氯仿、异丙醇、75%乙醇、RNase free水;(2)样本处理对取下的新鲜组织(50mg)用PBS快速清洗表面附着物,放入离心管,加入1ml Trizol匀浆。
RNA提取——精选推荐
RNA提取1.吸除medium(培养基),PBS洗1次。
2.胰酶消化,离心,PBS洗后再离心。
3.吸除PBS,少量PBS残留无碍。
4.准备冰盒,无酶枪头,EP管,异丙醇,氯仿,RNAiso Plus。
5.加入裂解液(RNAiso Plus)1ml,立即移至无RNase(RNA水解酶)的1.5ml EP管中,反复吹吸,至裂解液中无明显沉淀。
6.涡旋使细胞充分裂解,然后冰上放置。
预冷离心机4o C,12000g。
7.加氯仿(1/5体积的RNAiso Plus,氯仿吸取时先吸取一次打出再吸取,就不会滴漏)200ul,盖紧离心管,混合至溶液乳白色(上下颠倒混匀),冰上置5min。
8.12000g(注意是离心力不是rpm),4o C离心15min,小心取出,匀浆分为三层,无色上清(含RNA),中间白色Pr层(大部分DNA),及下层有机相。
9.小心吸取400ul(防止吸取到下层的液相)上清置另一EP管中。
10.向上清中加入400~500ul(0.5~1倍RNAiso Plus与上清等体积)体积的异丙醇,上下颠倒离心管,充分混匀后,冰上静置10min。
11.12000g,4o C离心10min,离心后,试管底部会出现RNA沉淀。
12.小心弃上清,切勿触及沉淀,少量异丙醇残留无碍,加入500ul(与RNAiso Plus等量)的75%EtoH(750ul乙醇+250ulDEPC水),轻弹混匀,7500g,4o C离心5min,小心弃上清。
13.打开管盖,超净台干燥1分钟,沉淀干燥后,加入10~15ul (视RNA沉淀含量)DEPC水溶解沉淀,吹吸混匀,-80o C冻存。
PCR预变性(initial denaturation)变性:90~96o C,双链DNA氢键断裂成单链DNA。
引物退火(Rimer annealing):25~65o C,系统降温,引物与DNA模板结合,成局部双链。
引物延伸(Extension):70~75o C,Taq酶(72o C左右活性最佳)作用下,以dNTP为原料从引物3’端→5’端延伸,合成互补DNA。
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1. 使用正确的细胞或组织储存条件
在样品用液氮瞬间冻结之后,应该储存在-80℃,千万不能解冻。
即使是置于含有胍盐的裂解液中作匀浆前的短暂解冻,也会导致RNA的降解和损失。
瞬间冻结的组织应该首先在超低温条件下先研磨成粉,然后置于裂解液中进行匀浆。
RNAfixer使样品储存更为便利。
储存在RNAfixer中的细胞或组织可在室温下稳定保存长达1个星期,在4℃可稳定保存长达1个月,或永久保存在-20℃。
2. 消除环境RNase的污染
为了得到完整的、高品质RNA,在整个RNA制备过程中,当RNA离开强蛋白变性剂(如离液裂解液或酚)的保护时,避免引入新的RNase污染就非常关键。
由于RNase几乎是无所不在,所以必须确保与纯化的RNA接触的每一样东西都是无RNase污染的。
所有的表面,包括移液器、工作台、玻璃器皿和制胶设备,都必须用表面去污净化溶液如RNase喷雾清除剂来处理过,去除各种溶液或者反应缓冲液中可能存在的RNase污染,可以用RNAsafe.必须保证一直使用无RNase的枪头、试管和溶液,手套也应经常更换。
3.迅速灭活内源的RNA酶,以防止RNA降解
以下3个方法均可有效使内源RNA酶失活:
1)用含离液(如胍盐)的细胞裂解液收获样品,并立即匀浆。
2)用液氮瞬间冻结样品。
值得特别注意的是:组织块必须保证足够小,在浸入液氮的瞬间就能冻结,以确保瞬间令RNA酶失活。
3)立即将样品置于RNAfixer无液氮RNA样品储存液中。
它是一种水相、无毒的收集试剂,能立即稳定并保护完整、未冻结的组织和细胞样品中的RNA.关键要点是组织样品切片一定要够薄(<0.5 cm),这样RNAfixer才能在RNase破坏RNA之前迅速渗入组织块中。
4. 选择合适破壁方法
细胞或组织的彻底匀浆对RNA提取来说,是一个很关键的步骤,它能够防止RNA的损失和降解。
匀浆的方法应根据细胞或组织的类型来选择。
大部分培养的细胞可以置于细胞裂解液中,通过简单的涡旋震荡来匀浆;而动物组织、植物组织、酵母和细菌、真菌则常常需要更加剧烈的方法,通常用液氮研磨。
比如说细菌(特别是革兰氏阳性菌)的细胞壁,就需要溶菌酶消化来实现彻底的细胞裂解和RNA的最大回收,酵母提取时加入破壁酶帮助破壁,再用TRIpure或RNApure进行提取。
5. RNA提取少走弯路--不同材料如何选择最适RNA提取试剂
现有众多的RNA分离方法也许令人难以取舍。
目前最简单也是最安全的方法是柱式分离,如RNAp ure 因为操作简单,时间短,纯度高而受到大家的喜爱,RNApure不需要DNA酶消化DNA,节省了时间,避免RNA的降解,从而提高了产量;相对非柱式分离(如TRIzol),去除蛋白及其他杂质干净,提高了纯度,对于细胞、组织、一般植物均非常适合。
植物RNA的提取比较难抉择,植物RNA提取受酚、多糖、蛋白杂质、次生代谢物含量的影响,一般用TRIzol提取纯度不高,而且很多植物用TRIzol提取不出来。
这时候可以选择多糖多酚植物总RNA提取试剂盒(水仙、辣椒、胡萝卜、玉米、百合、小麦、西红柿、花菜、油菜等)和通用植物RNA提取试剂盒(适合绝大多数植物提取,包括:各种中草药、植物种子、苹果、葡萄、草莓、香蕉、龙眼、荔枝、草坪植物、松树、杉树、白桦、紫松果、彩叶草、一品红、夹竹桃、垂叶榕、紫罗兰、月季、天竺蓝、牵牛花等);非常值得一提的是血液(包括血清、血浆、脑脊液、各种拭子或其他液体含量高的样本)RNA的提取用TRIzol和红细胞裂解的方法效果都不好,因为红细胞裂解液不含有RNA酶的抑制成分,这个过程RNA很容易降解,推荐使用TRIpure LS (RP1101)或者血液总RNA提取试剂盒(RP4001),该方法适用于表达谱芯片实验中RNA的提取,并成为博奥生物芯片北京国家工程研究中心的推荐方法:/newsf/2009-5/2009515134112578.htm。
6. 低浓度RNA的沉淀
纯化得到的RNA可能需要通过沉淀来浓缩,以满足一些下游应用的需要。
醋酸铵(NH4OAc)沉淀(加0.1体积的5M 醋酸铵、2-2.5体积的无水乙醇,-20℃放置25分钟以上)可以很好地回收RNA.如果需要定量回收低浓度的RNA(ng/ml),可以采用共沉淀(如linear acrylamide糖原glycogen,、酵母y east RNA )的方法。
核酸助沉剂是linear acrylamide,当RNA用于RT-PCR分析时,线性的丙烯酰胺和DNase处理的糖原都可以作为理想的共沉淀剂,因为它们都不含DNA污染,糖原含量高会抑制PCR 反应,应注意控制浓度,核酸助沉剂对PCR无影响,成为病毒核酸提取的首选。
酵母RNA和未处理的糖原会给样品带来核酸污染,有可能影响RT-PCR的结果。
沉淀后,注意避免RNA沉淀过分干燥,因为这可能导致很难重新溶解。
7. 提取好的RNA如何储存
如果只是短期储存,重悬的RNA应放置于-20℃;如果是长期储存的话,就应该放置于-80℃。
储存RNA 时,可以加入少量的RNA酶抑制剂(RP5601),避免RNA的降解,RNA可以直接做下游实验。
如果要长期保存RNA,可以加入RNAlong。
我们推荐将RNA溶液分装在几支管中。
这会避免反复冻融损伤RNA,并预防偶然的RNase污染。