exosomes外泌体实验方案
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外泌体分离提纯草案
By 朱旭峰
一、以超高速离心的方法来分离外泌体(细胞上清)
1.1细胞培养液(CM)是来自无菌的80%-90%的培植细胞,并用浓度比
1:1.000的蛋白酶抑制剂混合。(sigma)
1.2快速地将CM用0.22μm 的过滤筛(Millipore)过滤,来分离完整地
细胞和残渣。超速离心于120,000_g (Sorvall WX ULTRA SERIES, rotor
A-641) 4 ℃. 2 小时
1.3用1mL 冷的PBS 重悬和清洗小囊泡,再次超速离心120,000_g
(Sorvall WX ULTRA SERIES, rotor A-641) 4 ℃. 2 小时
1.4再用100μL 冷的PBS 重悬后转移到低粘附的管中
1.5快速地使用或置于-80℃中待用为检测外泌体的蛋白浓度,取2μL
的样品置于卡上,用Direct Detect™(Millipore)
2材料
a)细胞培养液
b)蛋白酶抑制(Sigma)
c)过滤筛(Millipore)
d)冷的PBS
e)低粘附的管
f)Direct Detect™(Millipore)
二、以超高速离心的方法来分离外泌体(人血浆)
1.1在提取外泌体之前应该向血浆里添加1;500浓度比的蛋白酶抑制剂
(Sigma)
1.2将上清液移至一个新的管中离心200*g 20分钟4℃
1.3小心地再将上清液移至新的管中离心10000*g 30分钟于4℃来
去除较大的囊泡、
1.4此阶段的样品可以
1.5将样品用0.22μm的注射器滤筛(Millipore)过滤并且离心110000g
(Sorvall WX ULTRA SERIES, rotor F65L) 2小时4℃
1.6用冷的PBS重悬后再次超速离心(110,000g, 1 h, 4 ℃).,
1.7将外泌体小心干燥并且用冷的PBS重悬
1.8外泌体应该立即使用或-80摄氏度冷藏
2.材料
a)蛋白酶抑制(Sigma)
b)过滤筛(Millipore)
c)冷的PBS
d)低粘附的管
e)Direct Detect™(Millipore)
三、ExoQuick TM化学沉淀法
1.1ExoQuick TM的使用要按照厂家提供的说明书来实行
1.2该试剂盒可以简单地提取CM,人血浆,和血清里的外泌体,只需用
倒相管按照所指示的量来加入ExoQuick TM试剂盒里的溶液
1.3溶液孵化过夜,在4℃温和的摇晃
1.4在流式细胞仪缓冲液中洗涤
1.5试剂盒里的带荧光的免疫磁珠已经被绑定,用流式细胞仪鉴定即可
(BD Biosciences) 配合使用CellQuest 的软件。
2材料
a)ExoQuick TM试剂盒
b)流式细胞仪
四、用ME TM分离外泌体
1.1样品(CM或人血清)要按照商品说明书(New England Peptide –
NEP)稀释
1.2样品要事先处理好,17,000g 7分钟来去除微粒物质
1.3然后用ME TM试剂来孵化样品(NEP peptide)并且用旋转震荡在室温
混合15分钟
1.4孵化完的样品要室温离心10000g 7分钟
1.5所有的样品要用PBS洗三次
1.6最后小囊泡要用合适的KIT缓冲液重悬
五、抗体
以下的外泌体有关的一抗和二抗是用作:Westen Blot,ELISA和FACS(流式细胞术)
1.1mAb aCD9, mAb aCD63, mAb aCD81, mAb aCD63-FITC, aCD81-PE, 来
自于Beckton Dickinson,
1.2mAb aCD63-biotin (BioLegend),
1.3mAb aAlix (Santa Cruz),
1.4mAb aTsg101 (Abcam),
1.5pAb aRab5 (Santa Cruz),
1.6mrAb aRab5 (Epitomics),
1.7mAb aCalnexin (Abcam),
1.8二抗是anti-Mouse和anti-Rabbit HRP-conjugated (Dako). 专门的
肿瘤外泌体(HBM1 and HBM2) 结合抗体由HansaBioMed R&D
team.提供
六、用Westen Blot 探测外泌体的蛋白
1.1将样品用合适容积的蛋白loading Buffer(Lonza)重悬在合适的浓度
下
1.2用SDS-page分离外泌体的蛋白质
1.3把蛋白转到硝酸纤维素膜上(GE Healthcare)
1.4一二抗体孵化
1.5信号要在暗室里用ECL附加
七、外泌体免疫捕捉和蛋白定量ELISA
1.1从已经加了不同抗体的96孔板(Nunc)里的细胞上清或者人血浆为
免疫捕捉而筛选外泌体结合抗体(96孔板的抗体用碳酸氢盐缓冲
液PH=9.6稀释,用0.5%BSA固定和1%的蔗糖稳定)
1.2PBS加入0.05% Tween-20(PBST)作为洗涤缓冲液,但如果有提示
说明,应该用PBS稀释样品
1.3将外泌体样本,CM,人血浆样本加入96板孔内(最终容积为100
μl),孵化4℃过夜或者室温2小时(可以使用商业化的exosomes
捕捉平板(HansaBioMed))
1.4传统上的protocol包含使用主要的抗体(aCD9或aCD63)在样品缓
冲液(0.5%BSA PBS)中稀释2小时于4℃。
1.5在大量的冲洗后,用辣根过氧化物酶二抗(BioRad),在需要的地方
用样品缓冲液1小时于4℃。
基于BM Blue POD Substrate辣根过氧化物酶的底物(Roche)反应的
光密度反应,在450nm的酶标仪下记录Infinite_M1000 (TECAN)
a)QuantaBlu Fluorogenic Peroxidase Substrate(Thermo Scientific)要用连
续的激发光束在325/425nm
b)SuperSignal West Femto Chemiluminescent Substrate (Thermo
Scientific)要先孵化1分钟然后在酶标仪化学发光模式读数
2.材料
a)96孔板
b)碳酸氢盐缓冲液PH=9.6
c)BSA PBS Tween-20 蔗糖
d)辣根过氧化物酶二抗