19个STR基因座在中国汉族人群的等位基因分布频率
东北汉族群体19个Y-STR基因座多态性和东北亚地区各民族的聚类分析
东北汉族群体19个Y-STR基因座多态性和东北亚地区各民族的聚类分析张明龙;张永吉;魏新强;郑立红【摘要】目的研究东北汉族群体的19个Y-STR基因座的遗传多态性和东北亚15个群体间的遗传关系,探讨其法医学和群体遗传学研究的应用价值.方法采用Y-filer复合扩增体系对200例东北汉族无血缘关系的男性个体的19个Y-STR基因座进行扩增,应用ABI310分析仪进行基因分型,采用Arelquin3.11、Mega4.1和SPSS17.0软件进行群体间的AMOVA分析、聚类分析和多维标度分析.结果东北汉族群体的19个Y-STR基因座的基因多态性普遍较高,共检出200个单倍型,单倍型多态性在0.350 9(DYS391)~0.971 1(DYS385a/b),适合应用于法医学个体识别和亲权鉴定;东北亚15个群体间存在差异,遗传距离在0.000 9~0.643 2,群体间聚类分析和多维度分析结果与民族起源和迁徙史基本相一致.结论东北汉族群体的19个Y-STR基因座的基因多态性普遍较高,适合应用于法医学个体识别和亲权鉴定中.%Objective To investigate the polymorphisms of the 19 Y-STR loci in the Han population in Northeast China,and analyze the genetic relationships of 15 ethnic groups in northeast Asia region,and to evaluate their forensic value and population genetic value.Methods The 19 Y-STR unrelated Han males in 200 unrelated Han males in Northeast China were amplified with the Y-filer system,and the PCR products were analyzed by the 310 Genetic Analyzer.The AMOVA analysis,cluster analysis and MDS analysis were calculated by Arelquin3.11,Mega4.1 and SPSS17.0.Results The polymorphisms of 19 Y-STR loci in the Han population in Northeast China had generally higher gene diversity value which were ranged from 0.350 9(DYS391) to 0.971 1 (DYS385a/b),and totally 200 haplotypes were observed.The 19 Y-STR loci displayed high genetic polymorphisms in the Han population in Northeast China,indicating that these 19 loci were useful genetic markers for forensic personal identification and paternity testing.There were distinctions among 15 ethnic groups.The genetic distance between 15 ethnic groups were ranged from 0.000 9 to 0.643 2,and the conclusion of cluster analysis and MDS analysis were similar to the ethnogeny research and ethnic migration history.Conclusion The 19 Y-STR loci displayed high genetic polymorphisms in the Han population in Northeast China,and these 19 loci were useful genetic markers for forensic personal identification and paternity testing.【期刊名称】《重庆医学》【年(卷),期】2017(046)005【总页数】4页(P658-660,664)【关键词】Y染色体;短串联重复序列;多态性;汉族;东北亚【作者】张明龙;张永吉;魏新强;郑立红【作者单位】齐齐哈尔医学院生物遗传教研室,黑龙江齐齐哈尔161000;延边大学法医学教研室,吉林延吉133000;吉林省长春市公安局净月分局 130000;齐齐哈尔医学院生物遗传教研室,黑龙江齐齐哈尔161000【正文语种】中文【中图分类】DF795.2Y染色体短串联重复序列(Y-STR)为男性所特有,呈伴性遗传,并以单倍型的方式进行遗传。
北方汉族人群19个STR基因座遗传多态性_于海龙
11
0.008 6
11.2 0.000 8
12
0.039 2
12.2 0.002 4
13
0.274 3
13.2 0.037 6
14
0.237 5
14.2 0.107 4
15
0.077 6
15.2 0.166 1
16
0.012 5
16.2 0.031 3
17
0.000 8
17.2 0.002 4
18.2 0.000 8
23
0.010 2
24
0.008 6
26
0.001 6
D5S818
等位基因 频率
7
0.021 9
8
0.003 9
9
0.064 3
10
0.209 2
11
0.310 3
12
0.235 9
13
0.144 2
14
0.009 4
15
0.000 8
D3S1358
等位基因 频率
12
0.002 4
13
0.003 1
PIC 0.796 1 0.744 5 0.791 4 0.846 0 0.861 9 0.677 0 0.765 4 0.739 0 0.749 6 0.688 6 0.784 1 0.825 0 0.558 0 0.915 0 0.595 3 0.816 3 0.844 6 0.839 4 0.776 2
关键词: 法医遗传学;多态现象,遗传;短串联重复序列;汉族 中图分类号: DF795.2 文献标志码: B doi: 10.3969/j.issn.1004-5619.2012.01.015 文章编号: 1004-5619(2012)01-0056-03
鲁西汉族人群19个常染色体STR基因座的遗传多态性研究
刑事技术2019年第44卷第2期·论 著· DOI:10.16467/j.1008-3650.2019.02.005鲁西汉族人群19个常染色体STR基因座的遗传多态性研究张 磊,孙 璐(聊城市公安局刑科所,山东 聊城 252000)摘要:目的调查 19个常染色体 STR基因座在鲁西地区汉族中的等位基因分布,并研究其法医学应用价值。
方法对鲁西地区汉族 506例无血缘关系个体,采用 GoldenEye试剂盒进行检测,电泳后使用 Genemapper ID v3.2软件进行分析,获取其 19个基因座的数据资料。
结果19个常染色体 STR基因座的累积个体识别能力(CDP)为 1-4.913 858×10-20,累积非父排除率( C PE)为 1-7.619 621×10-9。
结论19个常染色体 STR基因座在鲁西汉族人群中呈高度多态性,对法医学亲子关系鉴定具有较大价值,对法医物证检验与研究具应用价值。
关键词:法医遗传学;遗传多态性;STR分型检测;STR基因座;鲁西地区汉族中图分类号:DF795.2 文献标识码:A 文章编号:1008-3650(2019)02-0113-04Genetic Polymorphism of 19 Autosomal STR Loci of Han Populationin Western Shandong AreaZHANG Lei, SUN Lu(Institute of Criminal Science and Technology of Liaocheng Public Security Bureau, Liaocheng 252000, Shandong, China) ABSTRACT: Objective To investigate the allelic distribution of 19 autosomal STR loci among Han population in western Shandong provincial area and explore its forensic value. Methods 19 autosomal STR (D8S1179, D21S11, D18S51, vWA, D3S1358, FGA, TH01, D5S818, D13S317, D7S820, CSF1PO, D16S539, TPOX, D2S1338, D19S433, PentaD, PentaE, D6S1043, D12S391) genotypes of 506 unrelated individuals from Han population in western Shandong area were detected by GoldenEye kit and analyzed with Genemapper ID v3.2 software after electrophoresis, with their genetic parameters being calculated. Results The 19 autosomal STR loci conform to Hardy-Weinberg equilibrium (P >0.05), with the cumulative discriminative power (CDP) being 1-4.913858×10-20 and the combinatorial PE (CPE) as 1-7.619621×10-9. Conclusions The 19 autosomal STR loci are highly polymorphic in Han population among the western Shandong area, showing great value in paternity test and applicability for forensic identification.KEY WORDS: forensic genetics; genetic polymorphism; STR typing; STR loci; Han population of western Shandong area短串联重复序列(short tandem repeats,STR)个等位基因大小比较相近,故其适合于PCR扩增而是法医物证鉴定中应用最广泛的长度多态性遗传标少有优先扩增的问题出现。
北京汉族21个STR基因座的群体遗传学调查与法医应用评价
北京汉族21个STR基因座的群体遗传学调查与法医应用评价郭剑章;路志勇;俞丽娟;刘芳;张庆霞;焦章平;刘雅诚【摘要】目的调查459例北京汉族无关个体21个常染色体非CODIS的STR基因座遗传多态性并评价其应用价值.方法用AGCU21+1荧光标记复合扩增系统对459例无关个体的21个STR基因座(D6S474、D12SATA63、 D22S1045、D10S1248、D1S1677、D11S4463、D1S1627、D3S4529、D2S441、D6S1017、D4S2408、D19S433、D17S1301、D1GATA113、D18S853、D20S482、D14S1434、D9S1122、D2S1776、D10S1435、D5S2500)进行检验.得到STR分型后,用相关软件进行统计分析并计算法医学应用参数.结果获得21个STR基因座的频率分布;相关参数为:H值从0.5894~0.8038,PD值从0.7898~0.9265,PE3值从0.3618~0.6029,PE2值从0.2031~0.4256,PIC值从0.5638到0.7640.结论联合应用Identifiler系统和AGCU21+1系统,有利于亲子关系的认定及对可疑突变的判断.【期刊名称】《刑事技术》【年(卷),期】2010(000)006【总页数】4页(P13-16)【关键词】STR;等位基因频率;群体遗传;北京汉族【作者】郭剑章;路志勇;俞丽娟;刘芳;张庆霞;焦章平;刘雅诚【作者单位】山西省医科大学法医学院,030001;北京市公安局法医检验鉴定中心,100192;山西省医科大学法医学院,030001;山西省医科大学法医学院,030001;北京市公安局法医检验鉴定中心,100192;北京市公安局法医检验鉴定中心,100192;北京市公安局法医检验鉴定中心,100192【正文语种】中文【中图分类】DF795.2本文调查分析了北京汉族人群21个STR基因座的遗传多态性和法医应用价值,报道如下:1 群体遗传学调查1.1 实验方法知情同意采集459例北京汉族无关个体血液样本;在Biomek2000自动工作站上采用磁珠法提取样本DNA;用AGCU 21+1荧光标记复合扩增系统(中德美联生物技术有限公司,无锡)扩增21个常染色体STR基因座和性别基因座(D6S474、D12SA TA 63、D22S1045、D10S1248、D1S1677、D11S4463、D1S1627、D3S4529、D2S441、D6S1017、D4S2408、D19S433、D17S1301、D1GA TA 113、D18S853、D20S482、D14S1434、D9S1122、D2S1776、D10S1435、D5S2500和Amelogenin);用AB-3130xl遗传分析仪进行电泳分离;实验过程参照操作手册和相关文献。
推导IBS评分在无关个体对人群中概率分布的计算公式
推导IBS评分在无关个体对人群中概率分布的计算公式赵焕东;赵书民;陈玉祥;李成涛【摘要】目的推导通过STR等位基因频率计算无关个体对间状态一致性(identity by state,IBS)评分概率分布的计算公式.方法比较两名无关个体间某一STR基因座的基因型可以得到三种相互排斥的组合:(1)有2个相同的等位基因,此时令a21(否则a2=0);(2)有1个相同的等位基因,此时令a1=1(否则a1=0);(3)有0个相同的等位基因,此时令a0=1(否则a0=0);则该无关个体对在这1个STR基因座的IBS评分可采用ibs=2a2+a1计算.推导通过STR等位基因频率分别计算a2=1、ai=1和a0=1的概率(p2、p1和p0)的通用表达式,继而当该无关个体对得到n个相互独立的STR基因座分型结果时,可通过p 2l和pu计算该多重分型系统IBS评分的二项分布参数(l=1,2,…,n). 结果从p2、P1和p0的基本概念出发,以fi表示STR基因座第i个等位基因的频率(i=1,2,…,m),则P2的通用计算公式为p2=2(Σfi2)2-Σfi4;p1的通用计算公式为p1=4mΣi=1fi2-4(mΣi=1fi2)2-4mΣi=1fi3+4mΣi=1fi4,p0的通用计算公式为p0=1-4mΣi=1fi2+2(mΣi=1fi2)+4mΣi=1fi3-3mΣi=1fi4,p2、P1、p0的和为1.IBS评分符合二项分布:IBS~B(2n,π).其中总体率π的通用计算公式为π=1/npmΣi=1P2/+1/2nmΣi=1PIt.结论生物学全同胞鉴定中的原假设为两名被鉴定人系无关个体,对任意IBS评分所对应的原假设概率均可通过本文所推导的公式进行直接计算,计算结果是进行证据解释的基础.【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2018(034)004【总页数】5页(P370-374)【关键词】法医遗传学;全同胞;状态一致性;二项分布;概率【作者】赵焕东;赵书民;陈玉祥;李成涛【作者单位】中南大学湘雅医院国家卫生部纳米生物技术重点实验室,湖南长沙410008;中南大学药学院,湖南长沙410013;江苏东南证据科学研究院有限公司,江苏南京210042;中南大学药学院,湖南长沙410013;司法鉴定科学研究院上海市法医学重点实验室上海市司法鉴定专业技术服务平台,上海200063【正文语种】中文【中图分类】DF795.22014年,司法鉴定科学研究院与国内其他机构共同研制的《生物学全同胞关系鉴定实施规范》(SF/Z JD0105002—2014)作为部颁规范正式发布实施(以下简称《规范》)。
山东汉族人群19个STR基因座的遗传多态性
Ge ne t i c Po l y mo r p hi s ms 0 f 1 9 S TR Lo c i i n Sh a nd o n g Ha n Po pu l a t i o n
Z H ANG Ma o — x 0 ,HA N S h u - y i ,G A0 Ho n g — me i l 2 s UN S h a h— h u i ,XI A0 Do n g - - j i e ,L I U Ym ’ 2 7
l a t i o n i n o r d e r t o p r o v i d e t he g e n e t i c d a t a f o r p a t e r ni t y t e s t i n g .M e t h o d s Th e g e n o t y p e s o f 2 0 5 u n r e l a t e d i n d i v i d ua l s i n S h a n d o n g Ha n po p ul a t i o n we r e t yp e d b y Go l d e n e y e M T 2 0 A k i t t o g e t t h e a l l e l e f r e q u e n c i e s a n d p o p u l a t i o n g e n e t i c p a r a me t e r s o f 1 9 S TR l o c i .Fo u r k i t s 。I d e n t i il f e k i t .S i n o Fi l e Ⅳ k i t ,Po we r Pl e x  ̄
座, 而S i n o F i l e r M、 T P o w e r P l e x  ̄1 6和 G o l d e n e y e M T 2 0 A试 剂 盒 均 不 能排 除 父子 关 系 。 结论 与 I d e n t i i f l e r M、 T
20723例亲子鉴定中19个STR基因座的突变分析
20723例亲子鉴定中19个STR基因座的突变分析毕洁;畅晶晶;李妙霞;余纯应【摘要】目的观察并分析肯定亲权关系的案件,探索STR基因座的突变规律.方法采用Goldeneye 20A试剂盒对20723例肯定亲权关系的案件筛选等位基因突变事件,统计各基因座的突变率和突变等位基因的来源、片段大小、突变步数及重复单位的增加或减少情况,分析突变相关因素的特点.结果 19个STR基因座共发现548例突变,观察到557个突变事件,基因座的突变率为0.07‰~2.23‰.父系突变与母系突变的比例为3.06:1.突变以一步突变为主,增加与减少重复单位的情况相当;二步以上(含二步)突变更易出现重复单位减少.突变主要发生于中等位基因,重复单位增减比例相当,长等位基因突变中重复单位减少显著多于增加.父系突变出现重复单位增加与减少的比例相当,母系突变重复单位减少较增加多见.结论各基因座的突变率差异具有统计学意义,当出现1~2个基因座不符合遗传规律时,应当加测其他检测系统,并结合突变基因座的信息计算PI值,以进一步明确鉴定意见.%Objective T o observe and analyze the confirm ed cases of paternity testing, and to explore the m utation rules of ST R loci. Methods T he m utant ST R loci w ere screened from 20723 confirm ed cases of paternity testing by G oldeneye 20A system .T he m utation rates, and the sources, fragm ent length, steps and increased or decreased repeat sequences of m utant alleles w ere counted for the analysis of the characteristics of m utation-related factors. Results A total of 548 m utations w ere found on 19 ST R loci, and 557 m utation events w ere observed. T he loci m utation rate w as 0.07‰-2.23‰. T he ratio of pater-nal to m aternal m utant events w as 3.06:1. O ne step m utation w as the m ain m utation, and the num ber ofthe increased repeat sequences w as alm ost the sam e as the decreased repeat sequences. T he repeat se-quences w ere m ore likely to decrease in tw o steps m utation and above. M utation m ainly occurred in the m edium allele, and the num ber of the increased repeat sequences w as alm ost the sam e as the decreased repeat sequences. In long allele m utations, the decreased repeat sequences w ere significantly m ore than the increased repeat sequences. T he num ber of the increased repeat sequences w as alm ost the sam e as the decreased repeat sequences in paternal m utation, w hile the decreased repeat sequences w ere m ore than the increased in m aternal m utation. Conclusion T here are significant differences in the m utation rate of each locus. W hen one or tw o loci do not conform to the genetic law , other detection system should be added, and PI value should be calculated com bined w ith the inform ation of the m utate ST R loci in order to further clarify the identification opinions.【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2017(033)003【总页数】4页(P263-266)【关键词】法医遗传学;亲子关系;短串联重复序列;DNA突变分析【作者】毕洁;畅晶晶;李妙霞;余纯应【作者单位】北京明正司法鉴定中心,北京 100191;公安部物证鉴定中心,北京110000;北京明正司法鉴定中心,北京 100191;北京明正司法鉴定中心,北京100191【正文语种】中文【中图分类】DF795.2短串联重复序列(STR)基因座是目前最常用的亲权鉴定遗传标记,具有多态性高、个体识别能力强、非父排除概率高、突变率高等特点[1]。
漳州地区汉族人群19个STR基因座的遗传多态性研究
漳州地区汉族人群 1 9 个S T R基 因座的 遗传 多态性研究
漳州市公安局刑侦支队 陈晓燕 王永清 蔡剑伟 林彬辉 张 琪
[ 摘 要] 目的:调查 1 9 个S T R 基 因座 漳州 地 区汉族 人群 的多态 性分 布 。方 法 :应用 G o l d e n e y e 2 0 A 荧光 复合 扩增 系统对 5 5 3 个无 关个体 的 1 9 个S T R基 因座 进行 检验 分析 ,进而 统计 群体 遗传学 参数 。结 果 :获得 1 9 个S T R基 因座 的等位 基 因频率 分布
息 总量 ( P I C),并 进行 H a r d y - We i n b e r g 平衡 检验 。
合扩增系统对福建漳州地区汉族人群 l 9个 S T R基 因座遗传 多态性进行调查 ,旨在为该地区汉族人群法医学个体识别和 亲权鉴定及群体遗传学研究提供一些翔实可靠 的法医学数
据。
0 . 0 6 0 6 0 . 2l 8 8
2 8
2 8 . 2
2 9
l 8 l 9 l 9 . 3 加 2 O 2 1 2 2 2 3 2 4 2 5
0 . 2 0 9 8 0 . 1 9 9 8
0 . 0 0 0 9
2 9 . 2 ” 3O
件对电泳数据进行各基 因座的基 因型分型。
[ 3 】 中介绍的方法并组处理 )。
1 4
2 0 1 6年第 1 0期 ( 总第 1 1 8期 )
1 9 m表 ¨
漳州汉族人群 1 9个 S T R基因座等位基因频率分布 ( o = 5 5 3) H : 2 6 7 8 9 ¨
东北汉族群体19个Y-STR基因座多态性和东北亚地区各民族的聚类分析
an d t h e c l u s t e r a n al y s i s o f e t hn i c g r o up s i n no r t he a s t As i a r e g i o n
Zh a n g Mi n gl o n g . Z h a n g Yo n g J i , We i Xi n q i a n g。 , Zh e n g Li h o n g
Ge ne t i c p ol y mo r ph i s ms o f 1 9 Y- S TR l o c i i n i n t he Ha n po p ul a t i o n i n No r t h e a s t Ch i na
因座 的 基 因 多 态性 普 遍 较 高 , 适 合 应 用类 号 ] D F 7 9 5 . 2
[ 关 键 词 ] Y 染 色体 ; 短 串联 重 复序 列 ; 多 态性 ; 汉族 ; 东 北 亚 [ 文献标识码] A [ 文章编号] 1 6 7 1 — 8 3 4 8 ( 2 0 1 7 ) 0 5 — 0 6 5 8 — 0 3
( 1 . De p a r t me n t o f Bi o — Ge n e t i c s , Qi q i h a e rMe di c a l Un i v e r s i t y, Qi q i h a e r , He i l o n g J i a n g 1 6 1 0 0 0, Ch i n a; 2 . De p a r t me n t o f Fo r e n s i c , Y a n b i a n Un i v e r s i t y, Y a n j i , J i l i n 1 3 3 0 0 0, Ch i n a; 3 . Po l i c e Bu r e a u o f J i n g y u e Di s t r i c t , Ch a n g c h u n, J i l i n 1 3 0 0 0 0, Ch i n a )
《呼和浩特地区汉族和蒙古族人群19个STR基因座法医用遗传多态性》范文
《呼和浩特地区汉族和蒙古族人群19个STR基因座法医用遗传多态性》篇一呼和浩特地区汉族与蒙古族人群19个STR基因座法医用遗传多态性研究一、引言随着医学技术的不断进步,遗传学在法医学、医学诊断、人类学等领域的应用越来越广泛。
STR(短串联重复序列)基因座法作为一种有效的遗传标记技术,在人群遗传学研究、亲子鉴定、犯罪侦查等方面具有重要价值。
本文旨在探讨呼和浩特地区汉族和蒙古族人群在19个STR基因座上的遗传多态性特征,以期为相关领域提供参考数据。
二、研究方法1. 研究对象本研究选取呼和浩特地区的汉族和蒙古族人群作为研究对象。
所有研究对象均签署了知情同意书,研究经过当地伦理委员会批准。
2. 实验方法本研究采用STR基因座法,针对19个基因座进行多态性分析。
包括基因组DNA提取、PCR扩增、电泳分析等步骤。
3. 数据分析运用相关软件对数据进行统计分析,包括等位基因频率分布、遗传距离计算等。
三、结果与分析1. 基因型及等位基因频率分布在19个STR基因座上,汉族和蒙古族人群的基因型及等位基因频率分布存在一定差异。
其中,某些基因座的等位基因频率在两个民族间存在显著差异,这可能与两个民族的遗传背景、生活环境等因素有关。
2. 遗传距离分析通过计算不同个体间的遗传距离,发现汉族和蒙古族人群在遗传结构上存在一定的差异。
这表明两个民族在遗传上具有独特的特征,同时也为相关领域提供了重要的参考数据。
3. 遗传多态性特征分析通过对19个STR基因座的多态性分析,发现呼和浩特地区汉族和蒙古族人群在多个基因座上表现出丰富的多态性特征。
这些特征为相关领域提供了丰富的遗传信息,有助于进一步了解两个民族的遗传背景和生活习惯。
四、讨论本研究结果表明,呼和浩特地区汉族和蒙古族人群在19个STR基因座上存在显著的遗传多态性特征。
这些特征可能与两个民族的遗传背景、生活环境等因素有关。
此外,不同民族间的遗传距离分析也表明了不同民族在遗传结构上的差异。
山西沁水204例汉族人群19个STR基因座的遗传多态性
山西沁水204例汉族人群19个STR基因座的遗传多态性发表时间:2017-02-15T10:27:30.287Z 来源:《系统医学》2016年17期作者:巩智刚王冰贺小华刘雁军李琳张天林[导读] 经对19个STR基因座基因型的观察值和期望值进行χ2检验,P值最小为0.059(D8S1179基因座),均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。
晋城市公安局司法鉴定中心山西 048026【摘要】通过采用Goldeneye20A STR荧光标记复合扩增试剂盒,对山西沁水汉族204名无关个体DNA进行扩增,利用3130XL遗传分析仪对扩增产物进行电泳分析,统计获得19个STR基因座的等位基因频率分布:分别检出13、8、9、12、11、6、8、8、7、5、9、9、9、5、17、6、12、12、17个等位基因,并分别获得19个STR基因座的Ho、He、DP、PM 、PE 及PIC等法医遗传学参数,累积个人识别率和累积非父排除率分别为1-8.6584×10-23和0.9999999802587。
19个STR基因座组成的复合扩增系统在山西沁水汉族人群中具有较高的遗传多态性和识别能力,可以应用于法医学个体识别和亲子鉴定。
【关键词】法医遗传学;遗传多态性;短串联重复序列(STR);基因座;山西沁水汉族Genetic polymorphisms of 19 STR loci in 204 Han population in Qinshui,Shanxi GONG Zhi-gang, WANG Bing, LIU Yan-jun , He Xiao-hua, LI Lin, ZANG Tian-lin (Institute of Forensic Science,Public Security Bureau of Jincheng Jincheng 048026, China) [Abstract] Objective: Nineteen loci were amplified by using a Goldeneye 20A STR Amplification Kit, and analyzed by 3130XL genetic analyzer. 204 unrelated individuals of Han population in Qinshui were investigated to determine the distributions of allele frequencies. Allele distributions of the 19 loci have been obtained. 13、8、9、12、11、6、8、8、7、5、9、9、9、5、17、6、12、12 and 17 alleles were found in the preview 19 STR loci. We also obtained some parameter of forensic genetics respectively, such as Ho、He、DP、PM、PE and PIC. The cumulative discrimination power (CDP) and cumulative probability of exclusion (CPE) of 19 loci is 1-8.6584×10-23 and 0.9999999802587. The 19 STR loci are highly polymorphic and suitable for forensic personal identification and paternity testing in Qinshui.[Key words] forensic genetics; genetic polymorphism; short tandem repeats (STR); gene locus; Qinshui Han population 【中图分类号】D919.1 【文献标识码】A 【文章编号】2096-0867(2016)17-191-02 本研究对204例山西沁水汉族人群的19个STR基因座(D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、Penta D、vWA、D8S1179、TPOX、Penta E、TH01、D12S391、D2S1338、FGA)进行了STR检验及统计分析,获得了山西沁水汉族人群19个STR基因座的遗传多态性, 并为沁水地区个体识别和亲权鉴定的适用性评估提供了统计学依据,同时进一步完善了我国STR基因数据库。
贵州汉族19个STR基因座多态性及法医学应用
贵州汉族19个STR基因座多态性及法医学应用赵勤松;任峥;张红玲;戴佳琳;王杰;喻芳;黄江【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2017(033)004【摘要】目的调查19个常染色体STR基因座在贵州汉族人群中的等位基因分布,评估其在法医学中的应用价值.方法应用GoldeneyeTM DNA身份鉴定系统20A 试剂盒,研究贵州520名汉族无关健康个体19个常染色体STR基因座多态性.用310型遗传分析仪进行毛细管电泳,GeneMapper(R) ID v3.1进行基因分型.结果19个常染色体STR基因座的杂合度为0.603 8~0.9164,个体识别率为0.790 0~0.985 6,非父排除率为0.295 5~0.826 9,多态信息含量为0.553 5~0.908 9,累积个体识别率为1-1.230 0×l0-22,累积非父排除率为0.999 999 99.贵州汉族和其他五个地域的汉族两两之间等位基因频率比较,仅贵州汉族与山东汉族、辽宁汉族、山西汉族之间存在基因频率差异具有统计学意义. 结论 D19S433等19个常染色体STR基因座在贵州汉族人群中具有良好的遗传多态性,对群体遗传学和法医物证学研究有应用价值.【总页数】5页(P388-392)【作者】赵勤松;任峥;张红玲;戴佳琳;王杰;喻芳;黄江【作者单位】贵州医科大学法医学院,贵州贵阳550025;贵州省人口和计划生育司法鉴定所,贵州贵阳550004;贵州医科大学法医学院,贵州贵阳550025;贵州医科大学法医学院,贵州贵阳550025;贵州医科大学法医学院,贵州贵阳550025;贵州医科大学法医学院,贵州贵阳550025;贵州省人口和计划生育司法鉴定所,贵州贵阳550004;贵州医科大学法医学院,贵州贵阳550025【正文语种】中文【中图分类】DF795.2【相关文献】1.山西汉族人群19个STR基因座的遗传多态性调查及法医学应用 [J], 申君毅;康恒亮;东方;郭晋荣;王蓉2.山西陵川地区汉族人群19个STR基因座遗传多态性调查及法医学应用 [J], 刘雁军;薛建3.福建汉族人群20个常染色体STR基因座遗传多态性分析及法医学应用 [J], 王坤;韩俊永;陈金烟;金静君;薛士杰;刘慎敏4.浙江汉族22个STR基因座多态性及法医学应用性 [J], 王万旭;林锦锋;宋丹璐;金海英;郑冰洁5.蚌埠地区汉族41个Y-STR基因座遗传多态性及法医学应用 [J], 何传锦;张荣芳;邹磊;郑冰洁;宋丹璐;黄景峰;兰江维因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
山西陵川地区汉族人群19个STR基因座遗传多态性调查及法医学应用
山西陵川地区汉族人群19个STR基因座遗传多态性调查及法医学应用刘雁军;薛建【摘要】目的:通过对山西省陵川县汉族人群19个STR基因座的遗传多态性进行调查,为本地区人群的同一认定和亲权鉴定活动提供计算基础.方法:STR复合扩增选取Goldeneye 20A系统,扩增对象为随机选取的山西省陵川县汉族201份无关个体血样,扩增产物的电泳使用3130XL遗传分析仪,并利用Genemapper3.2软件分析电泳结果.统计201份无关个体血样19个STR基因座的法医遗传学参数.结果:19个STR基因座分别检出12、8、14、17、13、6、7、7、7、8、10、7、9、6、18、6、12、12、18个等位基因,计算出19个STR基因座的基因频率、杂合度期望值(He)、杂合度观察值(Ho)、个人识别能力(DP)、偶合率(PM)、非父排除率(PE)、多态信息总量(PIC)等法医遗传学参数,并得到Gold-eneye 20A系统效能数据:累积个人识别率为1~8.11×10-23,累积非父排除率为0.999999988.结论:在山西陵川地区汉族人群中,Goldeneye 20A复合扩增系统19个STR基因座的识别能力和遗传多态性较高,为山西陵川地区区域性法医学个体识别和亲权鉴定提供强有力的基础数据支撑.【期刊名称】《临床医药实践》【年(卷),期】2017(026)003【总页数】4页(P170-173)【关键词】法医遗传学;遗传多态性;基因频率;陵川汉族【作者】刘雁军;薛建【作者单位】中国政法大学证据科学研究院,北京 100088;晋城市公安局刑事技术支队,山西晋城 048026;北京市公安司法鉴定中心,北京 100192【正文语种】中文【中图分类】R394本实验利用Goldeneye20A复合扩增系统中的19 个STR基因座(D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、Penta D、vWA、D8S1179、TPOX、Penta E、TH01、D12S391、D2S1338、FGA)对山西省陵川县汉族随机抽取的201名无关个体血样进行复合扩增、电泳及结果分析,得到每个样本上述19个基因座的位点数据,利用这些位点数据计算出各基因座的杂合度期望值(He)、杂合度观察值(Ho)、个人识别能力(DP)、偶合率(PM)、非父排除率(PE)、多态信息总量(PIC)等法医遗传学群体性数据,对该复合扩增系统在山西省陵川地区汉族人群中的遗传多态性的强度进行评价,进而探讨其在法医学中同一认定和亲权鉴定中的地域性应用价值。
山西省高平地区汉族人群19个短串联重复系列基因座遗传多态性调查
山西省高平地区汉族人群19个短串联重复系列基因座遗传多态性调查刘雁军;贺小华;巩智刚;李琳;王冰;张天林【期刊名称】《临床医药实践》【年(卷),期】2016(025)007【摘要】目的:调查19个短串联重复系列(STR)基因座在山西省高平市汉族人群中的遗传多态性,并对其法医学应用进行评价。
方法:采用 Goldeneye20A STR 荧光标记复合扩增试剂盒,对山西省高平市汉族210份无关个体进行扩增,利用3130XL 遗传分析仪对扩增产物进行电泳分型,统计 D19S433等19个 STR 基因座的等位基因频率和法医遗传学数据。
结果:获得19个 STR 基因座的等位基因频率分布,分别检出10,9,15,13,13,6,8,7,7,7,10,8,9,5,17,6,11,13,17个等位基因,并分别获得19个 STR 基因座的杂合度观察值(Ho)、杂合度期望值(He)、个人设别能力(DP)、偶合率(PM)、非父排除率(PE)及多态信息总量(PIC)等法医遗传学参数,累积个人识别率和累积非父排除率分别为1~1.49×10-22和0.999999993。
结论:Goldeneye20A STR荧光标记复合扩增体系的19个 STR 基因座在山西省高平市汉族人群中具有较高的个体识别能力和遗传多态性,对于法医学个体识别和亲子鉴定具有重要的应用价值。
【总页数】5页(P535-539)【作者】刘雁军;贺小华;巩智刚;李琳;王冰;张天林【作者单位】中国政法大学,北京 100088; 晋城市公安局,山西晋城 048026;晋城市公安局,山西晋城 048026;晋城市公安局,山西晋城 048026;晋城市公安局,山西晋城 048026;晋城市公安局,山西晋城 048026;晋城市公安局,山西晋城048026【正文语种】中文【中图分类】R742.5【相关文献】1.成都地区汉族人群17个Y短串联重复序列基因座遗传多态性分析 [J], 宋兴勃;范红;应斌武;陆小军;王军;叶远馨2.皖西南地区汉族人群23个Y染色体短串联重复序列基因座遗传多态性 [J], 胡萌;郭磊3.河南新乡地区汉族人群13个短串联重复序列基因座遗传多态性 [J], 郝彦威;王克杰;袁晚刘;张星星;王洁;王瑞娟;武红艳;黄艳梅;王倩4.江苏地区汉族人群八个短串联重复序列基因座遗传多态性研究 [J], 易龙;陈仕林;许争峰;潘永久;杨驰;应锋;丁卫东;王勇;凌立君5.潮汕地区汉族人群6个短串联重复序列基因座的遗传多态性研究 [J], 石美森;于晓军;百茹峰;吕俊耀;胡泊因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
江苏汉族人群19个常染色体STR基因座基因多态性及遗传距离分析
江苏汉族人群19个常染色体STR基因座基因多态性及遗传距离分析潘猛;顾民;周惠英;崔鹤;居晓斌;刘燕婷;叶琴;陈子庆;丁小健;陈奇;周蓉【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2018(034)006【摘要】目的调查19个常染色体STR基因座在江苏汉族人群中的等位基因分布情况.方法采用GoldeneyeDNA身份鉴定系统20A对9 025例样本进行检测,对其中的19个常染色体STR基因座分型数据进行遗传学分析,并对其与其他17个地区人群间的遗传距离进行分析.结果 19个常染色体STR基因座均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),杂合度为0.616 1~0.916 3,匹配概率为0.012 8~0.202 6,个体识别率为0.797 4~0.987 2,非父排除率为0.310 8~0.828 8,多态信息含量为0.561 7~0.913 6,累积个体识别率为0.999 999 999 999 999 998 434 1,累积非父排除率为0.999 999 989.江苏汉族人群与天津、湖南和吉林等汉族人群的遗传距离更近,与新疆阿勒泰汉族人群之间差异具有统计学意义(P<0.05).结论获得较客观准确的江苏汉族人群STR基因座基因多态性数据和群体遗传学参数,可为上述STR基因座在江苏地区汉族人群的法医学应用提供数据支持.%Objective To investigate the distribution of alleles in 19 autosomal short tandem repeat (STR) loci in Jiangsu Han population.Methods Goldeneye20A kit was used to detect 9 025 samples.Genetic analysis was performed on typing data of 19 autosomal STR loci, and genetic distance with other 17 populations was analyzed.Results All the 19 autosomal STR loci were consistent with the Hardy-Weinberg equilibrium (P>0.05), with theheterozygosity 0.616 1-0.916 3, probability of match 0.012 8-0.202 6, discrimination power 0.797 4-0.987 2, probability of paternity exclusion 0.310 8-0.828 8, and polymorphic information content 0.561 7-0.913 6.The cumulative discrimination power and cumulative probability of exclusion were 0.999 999 999 999 999 998 434 1 and 0.999 999 989, respectively.The Jiangsu Han population had close genetic distances with the Han population in Tianjin, Hunan and Jilin, and significant difference with Han population in Aletai region in Xinjiang (P<0.05).Conclusion The STR allele polymorphism data and population genetic parameters of Jiangsu Han population can provide data support for the forensic application of these STR loci in Jiangsu Han population.【总页数】6页(P650-655)【作者】潘猛;顾民;周惠英;崔鹤;居晓斌;刘燕婷;叶琴;陈子庆;丁小健;陈奇;周蓉【作者单位】南京医科大学第一附属医院江苏省人民医院司法鉴定所, 江苏南京210029;南京医科大学第一附属医院江苏省人民医院司法鉴定所, 江苏南京210029;南京医科大学第一附属医院江苏省人民医院司法鉴定所, 江苏南京210029;南京医科大学第一附属医院江苏省人民医院司法鉴定所, 江苏南京210029;南京医科大学第一附属医院江苏省人民医院司法鉴定所, 江苏南京210029;南京医科大学第一附属医院江苏省人民医院司法鉴定所, 江苏南京210029;南京医科大学第一附属医院江苏省人民医院司法鉴定所, 江苏南京210029;南京医科大学第一附属医院江苏省人民医院司法鉴定所, 江苏南京210029;南京医科大学第一附属医院江苏省人民医院司法鉴定所, 江苏南京210029;南京医科大学第一附属医院江苏省人民医院司法鉴定所, 江苏南京210029;南京医科大学第一附属医院江苏省人民医院司法鉴定所, 江苏南京210029【正文语种】中文【中图分类】DF795.2【相关文献】1.福建汉族人群20个常染色体STR基因座遗传多态性分析及法医学应用 [J], 王坤;韩俊永;陈金烟;金静君;薛士杰;刘慎敏2.江苏地区汉族人群HLA-E基因多态性分析 [J], 林红;邵雷3.中国南方汉族人群20个常染色体STR基因座的多态性分析 [J], 陈玲;陆慧洁;杜蔚安;邱平明;刘超4.广东肇庆汉族人群20个常染色体STR基因座突变分析 [J], 陈启华;蒋劲鹏;陈莹5.1066例新疆汉族人群21个常染色体STR基因座遗传多态性分析 [J], 李亮亮; 陈晓鸣; 李学博; 张建中因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
全同胞关系排除方法分析
全同胞关系排除方法分析周密;韦帆;章俊;汪军【摘要】目的建立全同胞关系排除方法——父母排除法,以穷举法计算多个已知同胞的全同胞排除率(PEFS-K),并以随机模拟法进行验证.方法父母排除法原理:对3个或以上个体进行全同胞关系鉴定时,在单个STR基因座上,如果没有任何一组父母能与所有个体符合双亲遗传规律,则该基因座不符合遗传规律,可排除全同胞关系.为评估该方法的系统效能,本研究首先以穷举法在AGCU EX20试剂盒的19个STR 基因座中计算2~3已知同胞的全同胞排除率(PEFS-K2~PEFS-K3)的精确值,以及五等位基因法的排除率(PEFive-K2~PEFive-K3)的精确值.其次以随机模拟法设计实验,统计PEFS-K2~PEFS-K3和PEFive-K2~PEFive-K3的模拟值.最后,以模拟值对比精确值的方式,对穷举法计算值进行实验验证.结果本文穷举法计算获得了19个STR基因座的PEFS-K2~PEFS-K3的精确值,且计算结果符合模拟实验验证.AGCU EX20试剂盒的2~3已知同胞的全同胞累积排除率(CPEFS-K2和CPEFS-K3)分别为1-1.21128×10-3和1-8.63710×10-6.结论父母排除法结论明确,可推广于3个体以上全同胞鉴定.穷举法适用于多个已知同胞的全同胞排除率的精确值计算,具有法医物证学应用价值.【期刊名称】《刑事技术》【年(卷),期】2019(044)002【总页数】5页(P100-104)【关键词】法医物证学;全同胞;父母排除法;穷举法;随机模拟法【作者】周密;韦帆;章俊;汪军【作者单位】芜湖市公安局,安徽芜湖 241000;芜湖市公安局,安徽芜湖 241000;中德美联生物技术有限公司,江苏无锡 214000;安徽工程大学计算机与信息学院,安徽芜湖241000【正文语种】中文【中图分类】DF795.2全同胞关系鉴定的倾向性结论主要依靠ITO法计算亲权指数(PI)和IBS法[1-3]。