公共场所环境样品中嗜肺军团菌定量检验方法
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公共场所环境样品中嗜肺军团菌定量检验方法
1 范围
本标准规定了公共场所空气、水、土等不同类别环境样品中嗜肺军团菌的定量检测方法。
本标准适用于公共场所环境样品中嗜肺军团菌的定量检测,其他环境样品中嗜肺军团菌的定量检测可参照执行。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T 18204.3 公共场所卫生检验方法第3部分:空气微生物
GB/T 18204.5 公共场所卫生检验方法第5部分:集中空调通风系统
3 空气中嗜肺军团菌定量检测
3.1 原理
采用液体冲击法采样、叠氮溴乙锭(EMA)前处理结合定量聚合酶链反应(qPCR)方法定量检测室内空气和集中空调送风中存活的嗜肺军团菌。
3.2 仪器和设备
3.2.1 微生物气溶胶浓缩器:采样流量≥100L/min,3.0μm以上粒子的捕集效率≥80%(或浓缩比≥8)。
3.2.2 液体冲击式微生物气溶胶采样器:采样流量7L/min~15L/min,0.5μm以上粒子的捕集效率≥90%。
3.2.3 便携式冷藏箱。
3.2.4 冷冻离心机:温度4︒C。
3.2.5 恒温水浴锅或金属浴:温度范围50︒C~99︒C。
3.2.6 荧光定量PCR仪:非耦合6色激发光片和6色检测滤光片通道,4°C–100°C温度范围。
3.2.7 卤素灯:500W。
3.2.8 涡旋震荡器:调速范围0~3000 rpm。
3.3 材料和试剂
3.3.1 酵母浸出粉。
3.3.2 蒸馏水。
3.3.3 EMA固体粉:5mg/管。
3.3.4 无核酸酶去离子水。
3.3.5 矿物油,用于减少气溶胶采样时的吸收液蒸发。
3.3.6 核酸提取试剂盒:DNA产量15~30μg,A260/A280在1.7~1.9之间。
3.3.7 引物:上游引物5’-GAAAATAAAGTAAAAGGGGAAGCC-3’;
下游引物5’-ATCAATCAGACGACCAGTGTATTC-3’。
3.3.8 探针:5’-FAM-AGGCGTTGTTGTATTGCCAAGTGGTT-TAMRA-3’。
3.3.9 标准品质粒。
3.3.10 荧光定量PCR反应体系。
3.3.11 离心管:1.5mL透明离心管和1.5mL棕色离心管。
3.3.12 离心管:15mL,50mL。
3.4 样品的采集
3.4.1 采样吸收液成分:
酵母浸出粉12 g
蒸馏水1000 mL
3.4.2 采样吸收液制法:将酵母浸出粉(3.3.1)12g加蒸馏水至1000mL,121 ℃下高压灭菌15 min,每20mL采样吸收液分装于灭菌后的50mL离心管(3.3.12)中备用。
3.4.3 采样点:室内空气按GB/T18204.3中6.4.1规定,集中空调送风按GB/T18204.5 中9.5.1规定。
3.4.4 将装有采样吸收液的离心管置于便携式冷藏箱(3.2.3)中送到现场,开始采样前将采样吸收液(3.4.2)20mL倒入微生物气溶胶采样器(3.2.2)中,然后用吸管加入矿物油(3.3.5)1滴~2滴。
3.4.5 将微生物气溶胶浓缩器(3.2.1)与微生物气溶胶采样器(3.2.2)连接,按照微生物气溶胶浓缩器和微生物气溶胶采样器的流量要求调整主流量和浓缩流量。
3.4.6 按浓缩器和采样器说明书操作,每个气溶胶样品采集空气量1m3~2m3;并记录环境温度、大气压力和总采气体积或采样流量、采样时间。
3.4.7 采集的样品倒入离心管置于便携式冷藏箱中避光保存,4h内送实验室检验。
3.5 样品处理方法与条件
3.5.1 样品的离心浓缩:将采集的气溶胶样品(3.
4.7)于4℃下8000×g离心20min(3.2.4),小心吸取弃去上清,剩余1mL左右沉淀全部转移至1.5mL的透明离心管中,再次4℃下8000×g离心20min,弃去上清,剩余0.5mL沉淀。
3.5.2 EMA母液{ρ[C21H18BrN5]=10mg/mL}的制备:取1管5mg EMA固体粉(3.3.3),短暂离心后加入0.5mL灭菌无核酸酶去离子水(3.3.4)。颠倒混匀,短暂离心收集管壁液体,每100μl分装于1.5ml棕色离心管(3.3.11)中,-20℃避光保存。
3.5.3 EMA工作液{ρ[C21H18BrN5]=100μg/mL}的制备:取10μlEMA母液(3.5.2)加
990μl灭菌无核酸酶去离子水(3.3.4)。颠倒混匀,短暂离心收集管壁液体,置于1.5ml
棕色离心管中。每1000μl的EMA工作液可处理70份左右样品,EMA工作液现用现配,使用前计算好所需EMA工作液量。
3.5.4 样品避光孵育:取0.5mL经过离心浓缩的气溶胶样品(3.5.1)置于1.5mL透明离心管中,铝箔包裹以便避光。加入13μLEMA工作液(3.5.3),反复颠倒,混合均匀,短暂离心收集管壁液体,4℃避光孵育5min。
3.5.5 样品光照活化:去掉包裹离心管的铝箔,将离心管水平放置在碎冰上,调整样品与卤素灯(3.2.7)的距离,使其垂直距离为15cm,光照5min。光照阶段需混匀样品1次~2次,使光照均匀,防止样品过热。
3.5.6 样品存放:光照结束后,4℃保存样品,24h内提取核酸。
3.6 样品核酸提取
由于样品核酸提取的条件与操作步骤因使用试剂盒的不同而有差异,所以应根据所使用的核酸提取试剂盒的操作手册进行操作。附录A所列的空气中嗜肺军团菌核酸提取操作步骤是一个实例。
3.7 荧光定量PCR条件与扩增步骤
3.7.1 标准品系列制备:将标准品母液(3.3.8)以十倍梯度依次稀释,在107copies/mL~102copies/mL浓度范围内制备十倍梯度稀释的标准品系列。稀释方式举例如下:取10μL浓度为X×107copies/mL的标准品母液,编号为①,加入90μL无核酸酶去离子水轻柔混匀,浓度为X×106copies/mL,编号为②;取10μL浓度为②的标准品,加入90μL 无核酸酶去离子水轻柔混匀,浓度为X×105copies/mL编号为③;以此类推。
3.7.2 扩增体系:每次检测包括至少5个连续浓度标准品,每标准品至少进行3个复孔检测。每次检测包括阳性和空白对照各一个。样品进行3个复孔检测。
荧光定量PCR扩增体系(25μL):其中2×RealMasterMix 10μL,上下游引物(10μmol/L)各1.25μL,探针(10μmol/L)0.625μL,20×Probe Enhance Solution 1.25μL,模板2μL,ddH2O 8.625μL。
3.7.3 扩增条件:94℃预变性4min;然后94℃变性20s,60℃退火延伸60s,61s检测荧光信号,进行40个循环。
3.7.4 数据处理:标准曲线相关系数R2>0.99,标准曲线斜率在-3~-3.5之间,扩增效率E 在0.9~1.2之间。根据标准曲线和样品Ct值计算样品核酸中嗜肺军团菌浓度(copies/mL)。
3.8 结果报告
3.8.1 采气体积换算:按式(1)换算成标准状态下采气体积。