眼遗传病基因诊断方法专家共识解读2018

测序方法的选择-NGS测序
NGS技术
目前，在众多基因组技术中二代测序（next-generation sequencing，NGS）技术尤以其特 有的优势在包括眼遗传病在内的单基因遗传病的研究中发挥着重要作用，并越来越多地用于 眼遗传病的分子检测。 然而，由于基因检测技术的应用和方法选择在技术层面有一定的难度，更由于眼遗传性疾病 有较大的基因突变异质性和临床表型异质性，在临床实践中我们发现对NGS的应用存在偏差， 给遗传性眼病诊断结果和患者成本-效益带来一定的问题。
该文对遗传病基因检测报告的原则、规范化和标准化提出了建议。 结合基本规范，针对眼遗传性疾病已知的相关致病基因采用相应的优化检测模块，选择对
外显子及已知内涵子突变全面覆盖的检测方法是提高检测结果可靠性的关键。
NGS测序技术的不足
每种技术的临床应用过程中都存在不足，NGS也存在着一些缺点。
总之，在了解NGS优缺点的基础上，使其在临床单基因遗传病的分子检测中得到更合理的应用是目前基因 检测过程中检测人员和临床医师面临的挑战。
基因检测在眼遗传病中的应用
随着人类基因组参考序列的完成、基因芯片 和高通量测序等技术的问世以及生物信息技 术对海量生物数据高效分析和处理技术的发 展，近几年来单基因遗传病的分子诊断效率 迅速提升，技术方法取得了很大的突破，为 患者和临床医师的遗传咨询提供了技术保障， 更为将来的基因治疗奠定了基础
WGS测序
WGS是对全基因组的序列进行测序，故没有 捕获这一步骤，可直接将基因组片段打断后 进行高通量测序。
测序方法的选择
NGS技术
您的正文已经经简明扼要，字字珠玑，但信息却 千丝万缕、错综复杂，需要用更多的文字来表述； 但请您尽可能提炼思想的精髓，否则容易造成观 者的阅读压力，适得其反。 正如我们都希望改变世界，希望给别人带去光明， 但更多时候我们只需要播下一颗种子，自然有微 风吹拂，雨露滋养。恰如其分的表达观点，往往 事半功倍。
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正如我们都希望改变世界，希望给别人带去光明， 但更多时候我们只需要播下一颗种子，自然有微 风吹拂，雨露滋养。恰如其分的表达观点，往往 事半功倍。
NGS测序技术操作规范
NGS技术对检测人员、实验室标准、试剂及项目选择、实验室质量管理等均有严格的要求， 具体可参照《中华病理学杂志》在2017年3月发表的“临床分子病理实验室二代基因测序 检测专家共识”。
临床基因检测报告作为连接受检者、实验室技术人员和临床医师的重要依据，其内容在国 内有也有了行业共识，具体可参考2018年2月《中华医学遗传学杂志》刊出的“临床基因 检测报告规范与基因检测行业共识探讨”。
由于技术局限，对基因 组鸟嘌呤和胞嘧啶所占
比率高（GC含量）的目 B
标区域捕获率达不到 100%。
测序错误率高于传统的 一代测序技术，需要增
加测序深度、提高覆盖 A
率等方法来补偿。
如果测序片段较短，高
C 重复区域检测准确度下
降。
NGS测序技术及应用
使用NGS技术可同时进行大量基因序列的平行测序
测序方法的选择
NGS分为靶向基因测序（target gene sequencing，TGS）（或称panel测序）、全基因外显子组测序 （whole exome sequencing，WES）和全基因组测序（whole genome sequencing，WGS）
这3种方法原理相似，但又有各自的特点。此外成本还存在差异，因而在应用范围上也各有优势。目前 panel测序和WES广泛用于单基因遗传病的分子检测。
Panel测序和WES
Panel测序和WES的基本流程为目标区域基 因片段的获得和富集、对捕获片段的扩增和 高通量测序、生物信息学分析及验证，最后 确定致病突变。
Leabharlann Baidu 眼遗传病基因诊断方法专家共识的出具
为规范基因检测在眼遗传病分子诊断中的应用，我们组织了有关专家根据目前我国的实际情 况，在深入分析及了解各种遗传性眼病表型的复杂性和致病基因变异复杂性的基础上进行反 复讨论，提出眼遗传性疾病基因分子诊断规范化推荐意见，以供眼科相关临床人员和实验室 检测人员在实践中参照应用。 本共识专家组成员由国内外人类眼遗传病专家和全国眼遗传病研究专家组成。共识的制定基 于人类遗传性疾病基因分子诊断技术方法的科学性和适用范围，总结相关的推荐意见和观点， 注重眼遗传性疾病基因分子诊断的临床实践可操作性和指导性。
共识的意义
NGS的技术特点、适用范围及其优势 01 和 潜 在 局 限 性 。
02 眼 遗 传 性 疾 病 如 何 遵 循 基 因 检 测 流 程 。
03 如 何 根 据 眼 遗 传 疾 病 的 临 床 特 征 合 理 选择基因检测方法。
04 眼 遗 传 病 基 因 分 子 检 测 的 目 的 及 意 义 。
临床常见的眼遗传病有视网膜变性、先天性青光眼、先天性白内障、遗传性视神经病变、 先天性眼外肌异常及累及眼部的一些综合征等。
遗传方式包括常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传、X性连锁遗传、双基因遗传及线粒 体遗传等。
此外，眼遗传病同样存在着等位基因异质性和基因座异质性。同时，不同地域、不同民族 之间的基因变异和表型均存在着较大的差异，这些因素为眼遗传病的临床诊断和分子检测 带来了巨大的挑战。
眼遗传病基因诊 断方法专家共识 解读（2018）
目录
1 眼遗传病概述 2 NGS测序及检测流程 3 常见眼遗传病
眼遗传病概述
眼遗传病是一组由于基因缺陷导致的眼部疾病
眼遗传病概述
2018年4月27日在人类孟德尔遗传在线数据库（Online Mendelian Inheritance in Man， O M I M ） （ h t t p : / / w w w. o m i m . o r g / ） 中 以 “ e y e ” 作 为 关 键 词 搜 索 疾 病 表 型 可 得 到 4 4 0 种 疾病条目。