胚胎和幼体的原位杂交
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胚胎和幼体的整体原位杂交方法
1. 主要溶液
大量DEPC处理过的重蒸水加入0.1%的DEPC,充分摇匀,放
置2小时以上,高压灭菌
3M 醋酸钠,pH5.2 DEPC处理,高压灭菌
NaPBS 0.9 % NaCl
20mM磷酸钠缓冲液pH7.4
(1M Na2HPO4 1.548mL, 1M
NaH2PO4 0.452mL, 加H2O至
100mL)
DEPC处理,高压灭菌
4%多聚甲醛—Na PBS溶液 4 %多聚甲醛溶于NaPBS
新鲜配制
NaPBSTw NaPBS加0.1% Tween-20,冻存0.1M三乙醇胺DEPC水配制,冻存Proteinase K 10mg/mL贮存液,DEPC水配制,
冻存
10%甘氨酸DEPC水配制,冻存
2mg/mL甘氨酸- NaPBSTw NaPBSTw溶液配制,冻存
20x SSC 3M NaCl
0.3M 柠檬酸三钠
DEPC处理, 高压灭菌,冻存
50×Denhardt’s溶液0.1g Ficoll 8000
0.1g PVP
0.1g BSA, 加DEPC水至10mL
杂交缓冲液50%去离子甲酰胺
100μL/L肝素,
5×SSC
0.1 % Tween-20
5mM EDTA
1×Denhendt’s
1mg/mL酵母总RNA
DEPC水配制, 分装1mL /支, 冻存洗涤液1 50%去离子甲酰胺
5×SSC
1%SDS
DEPC水配制, 分装50mL/管冻存
洗涤液2 50%去离子甲酰胺
2×SSC
1%SDS
DEPC水配制, 分装50mL/管冻存
洗涤液3 2×SSC
0.1% Tween-20
DEPC水配制,分装50mL /管冻存
洗涤液4 0.2×SSC
0.1%Tween-20
DEPC水配制, 分装50mL /管冻存
洗涤液5 NaPBS
0.1% Tween-20
2mg/mLBSA
DEPC水配制, 分装50mL /管冻存RNase贮存液10mg/mL RNaseA, TE配制
预煮沸10分钟, 冻存
绵羊血清55℃30分钟预处理, 1mL/管冻存
5M NaCl DEPC处理,高压灭菌
1M Tris, pH9.6 DEPC水配制,高压灭菌
1M MgCl2DEPC处理,高压灭菌
Levamisole 100mM(24mg/mL)贮存液,避光,冻存NBT/BCIP 贮存液18.75mg/mL NBT
9.4 mg/mL BCIP in 67% DMSO(v/v),
Boehringer Mannheim
2.胚胎和幼体材料的准备
定时收集早期发育各期的胚胎和幼体,4% 多聚甲醛-MOPS固定液室温固定30分钟或4℃过夜。固定后将胚胎转移至70%乙醇中,1小时或更长时间后换一次70%乙醇(或甲醇),-20℃保存。
3.胚胎和幼体的整体原位杂交
通过胚胎和幼体的整体原位杂交,确定表达区的位置。共设4个实验组:
A.反义RNA探针杂交实验组,用以检测表达;
B.正义RNA探针杂交阴性对照组;
C.无探针杂交阴性对照组;
D.无抗DIG抗体杂交阴性对照组。
所有器皿都经去RNase处理。实验的具体步骤如下:
第一天:
(1)选择胚胎和幼体:一般每个时期20个,未孵化胚胎要用眼科镊
去除受精膜。置于直径2~3cm的胚胎手术杯中(预先经DEPC处理并高压灭菌)。
(2)用NaPBSTw洗2-3次,每次5分钟,置摇床上,缓慢摇动。
(3)换液至200μL/每个胚胎手术杯7.5μg/mL蛋白酶K中,缓慢
摇动(新配:加1μL10mg/mL蛋白酶K至100μL NaPBSTw, 混匀,取75μL加入1mL NaPBSTw),24小时以下胚胎消化10分钟,1天至一周的幼体消化20分钟,时间要准确.
(4)向手术杯中(含200μL蛋白酶K溶液)加入4μL 10%甘氨酸贮存
液。
(5)迅速换液至2mg/mL甘氨酸(NaPBSTw配制)
(6)再迅速换液至4%多聚甲醛-NaPBS, 室温1小时,不要转动
(7)换液至0.1M三乙醇胺, 静置1分钟
(8)换液至0.1M三乙醇胺, 摇动5分钟
(9)吸去上清,于无菌离心管中加1mL 0.1M三乙醇胺, 2.5μL乙酸
酐, 混匀, 每杯加300μL, 静置5分钟
(10)于无菌离心管中加1mL 0.1M三乙醇胺, 5μL乙酸酐, 混匀, 每
杯再加300μL, 静置5分钟
(11)换液至NaPBSTw, 摇动5分钟, 水浴(37-60℃)加热一管杂交缓
冲液
(12)换液至100μL温热的杂交缓冲液, 室温摇动1分钟(小心:胚胎
在此溶液中变得透明, 极易丢失)
(13)换液至200μL新的杂交缓冲液, 于恒温摇床中60℃缓慢摇动1
小时或更长
(14)正义和反义RNA探针解冻, 在2个离心管中各加200μL预热
的杂交缓冲液,再各加2μL探针混匀,加热至60℃
(15)小心移去手术杯中的杂交缓冲液(越干净越好), 加入预热的含
探针杂交缓冲液, 盖上手术杯, 70℃水浴5分钟
(16)将手术杯用胶带密封好,于恒温摇床中60℃轻摇过夜.
第二天
(1)预热洗涤液1至60℃,洗涤液2-5解冻。
(2)移去杂交液,加0.8mL洗涤液1,60℃轻摇5分钟
(3)用洗涤液1洗3次, 60℃,5、15、15分钟
(4)换为洗涤液2,60℃轻摇5分钟,换至室温轻摇10分钟
(5)换洗涤液2,室温轻摇15分钟
(6)换为洗涤液3,并立即吸掉
(7)换洗涤液3,室温轻摇5分钟
(8)无菌离心管中加1mL洗涤液3、2μL RNaseA贮存液(10mg/mL), 混匀
(9)移去洗涤液,加RNase溶液, 37℃保温20分钟
(10)用洗涤液3洗2次,各20分钟, 室温摇动
(11)换至洗涤液4, 室温摇动20分钟
(12)用洗涤液5洗5分钟,同时配封闭液: 1mL洗涤液5加100μL 绵羊血清
(13)移去洗涤液, 加200μL封闭液, 室温摇动1小时或更长
(14)换为200μL碱性磷酸酶偶连抗DIG抗体(1:3000, 用成体粉预吸收), 封好手术杯, 4℃轻摇过夜。
第三天
(1)吸去抗体
(2)用NaPBSTw洗4次各20分钟, 室温摇动
(3)在最后一次洗涤中,配碱性磷酸酶缓冲液( 8.3mL无菌水,1mL 1M Tris(pH9.6), 500μL 1M MgCl2, 200μL 5M NaCl,10μL Tween-20)
(4)除去NaPBSTw, 加500μL碱性磷酸酶缓冲液, 涡旋, 再吸掉(会产生沉淀)