酵母核糖核酸的提取及测定

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酵母核糖核酸的提取及测定

一、实验背景及目的

核糖核酸(RNA)和它的降解物核苷酸、核苷及其衍生物在生物化学、医药、食品添加剂、农业等领域有着广泛的应用。比如能够促进作物的生长,在水稻、小麦、柑橘及多种蔬菜生产中应用,取得了明显的增产效果。像鸟苷酸(GMP)和肌苷酸(IMP)还是强力助鲜剂,胞苷酸(CMP)和尿苷酸(UMP)可作为生产治疗癌症、肝炎及冠心病等药物的原料。而利用微生物资源提取氨基酸、核苷酸等生物小分子,具有成本低、非化学合成、无毒、无害的特点。[1] 随着啤酒等发酵行业的快速发展,产生了相应的大量发酵副产物,如何利用这些副产物,既做到不污染环境,还能产生良好的经济效益,一直是研究的热点。而啤酒废酵母中RNA含量达6%~8%,是生产RNA的较好原料,此外,抽提后的菌体蛋白质(占干菌体的50%)还具有很高的利用价值。所以利用啤酒废酵母生产RNA形成了非常有益的产业链。[2] 本实验目的就是学习从酵母中提取RNA的方法并掌握其测定手段。

二、实验原理

微生物是工.业上大量生产核酸的原料,其中以酵母最为理想,酵母核酸中主要是RMA (2.67~10.0%),DNA很少(0.03~0.516%),菌体容易收集,RMA也易于分离。RMA提制过程是先使RNA从细胞中释放,并使它和蛋白质分离,然后将菌体除去,再根据RNA等电点在pH2. 0~2.5的特点,将体系pH调至其等电点,使之沉淀,进行离心收集。

提取RNA的方法很多,在工业生产上常用的是稀碱法和浓盐法。稀碱法利用碱使细菌细胞壁水解,使RNA释放出来,浓盐法是在加热条件下,利用高浓度的盐改变细胞膜的通透性,使RNA释放出来,RNA 钠盐易溶于水,在含盐的菌体溶液中,RVA有较高的溶解度。二者均通过控制温度使蛋白质变性沉淀,通过离心将RNA及蛋白质和酵母菌体分离,进而在等电点沉淀RNA,从而达到提取目的。本实验采用浓盐法(10% NaCl),是食品医药卫生领域制备RNA 制剂的经典方案。[1][3]

核酸不论是DNA还是RNA,都是由核普酸组成的多聚核苷酸化合物,而核甘酸是由戊糖、碱基和磷酸构成,三个组份是以等分子比例存在。所以测定核酸的含员,只需测定组成核苷酸的任一成份,如磷、糖或碱基,便可相应计算山核酸的含量。

目前测定核酸含量的方法主要有:

1、定磷法,测量RNA和DNA:无机消化法。(蛋白质含量测定:凯氏定氮法)

2、戊糖测定法,测RNA: 苔黑酚法

3、脱氧戊糖测定法,测DNA:二苯胺法

4、紫外吸收法测定RNA和IDNA:碱基平面的共轭双键在紫外区具特异光吸收

后三种都是设计利用的比色法。

本实验采用紫外吸收法来测定并计算所获制品RNA的含量,再计算收率。

三、实验材料,仪器和试剂

1.材料:干酵母片粉

2.仪器:低温冷冻离心机(Eppendorf 5804R离心机)、恒温烘箱(202-2AB型,天津市泰斯特仪器有限公司)、电子天平(FA1004 上皿电子天平,上海精科)、紫外分光光度计(WFZ UV-2000型,尤尼柯仪器有限公司)、小台秤。(记录厂家及型号); pH计(本次实验:精密试纸pH0.5-5.0,精密试纸pH5.0-9.0)

主要器皿:移液器、研钵、三角瓶、容量瓶、烧杯

3.试剂: 10%NaCl、6MHCl、 95%乙醇(分析纯)、3~5%的氨水、RNA沉淀剂。

RNA沉淀剂:取0.5克钼酸铵,加水193ml,加7mL 70%过氯酸,总体积200ml. (70%过氯酸即高氯酸,原液浓度即是70%)。

四、实验步骤

浓盐法提取RNA工艺流程:

酵母液→盐处理→高温浸提→骤冷→离心分离→等电点沉淀→乙醇洗涤→干燥→纯度检测[4]

具体操作:

1.提取

称取7g酵母粉,置研钵中。量取50ml 10%NaCl溶液备用。加入适量NaCl于研钵中,充分研磨调和均匀,彻底悬浮无颗粒。转入三角瓶,用剩余的NaCl少量多次将研钵研杵洗涤干净并入三角瓶混匀。之后小心放入沸水浴中,开始加热时用玻棒搅拌一分钟左右使悬浮浸提体系迅速均匀升温至80C以上。浸提40分钟。

2.分离

将上述提取液取出,于冰浴中迅速冷却7分钟,转入离心管,4℃下, 4500转/分离心30分钟,使提取液及菌体残渣等分离。留取上清液。

3.沉淀RNA

将离心得到的上清液,小心倾倒于50mL小烧杯中,并置于冰浴上冷却,并于冰浴中,在搅拌下(注意不要过分剧烈)小心地用6MHCl调节pH至2.0~2.5。随着pH下降,溶液中白色沉淀逐渐增加,到等电点时RNA溶解度最低(注意严格控制pH),调好后继续于冰水中放置至少10分钟使沉淀充分,颗粒变大。

4.乙醇洗涤

上述悬浮液小心转入离心管,以3000转/分离心10分钟,得到RNA沉淀。小心倾去上清液,直接于离心管中用95%乙醇洗涤RNA沉淀三次,每次用10毫升乙醇,充分搅拌洗涤,然后以3000转/分离心5分钟。

5.干燥

用干燥药勺仔细将洗涤后的RNA沉淀从离心管内挖出涂布于事先将边缘折起成框的硫酸纸上(此硫酸紙要预先用分析天平称重并记录数据),涂布均匀后小心置于80℃烘箱内5分钟左右,使沉淀充分干燥。

将干燥后的RNA制品连同硫酸纸一齐准确称重,而后小心将RNA制品的绝大部分转移至一小烧杯中,将硫酸纸及残余RNA制品再次称重,记录下所有数据,以求得RNA总制品重量及定量样品重量,用以计算RNA含量。

6.含量测定(紫外分光光度法)

采用比消光系数法,比消光系数是指单位浓度的核酸溶液的消光值A260(1μg/mL RNA 的消光值),本实验给定A260 =0.022。

测定步骤:

将大部分制品转入匀浆器,加4mL蒸馏水小心沉稳将RNA匀浆,打匀后转入小烧杯,用12mL蒸馏水分三次洗涤匀浆器,并入小烧杯,调节pH7.0。最后转入25mL容量瓶,用蒸馏水定容混匀。

取2支试管,按下表操作:

表1.实验操作步骤

摇匀,冰浴20分钟,然后转入离心管3500转/分离心10分钟,小心留取上清液,各取0.5ml 分别至两个50ml容量瓶中,用蒸馏水定容,然后用B管做标准空白液在紫外分光光度计上

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