棉花DNA提取方法

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棉花DNA提取方法

DNA提取采用CTAB法(Paterson et al.,1993),并稍加修改,具体步骤如下:

(1)将1g冻叶(或鲜叶)放入预冷的研钵中,加入液氮研磨。分2次加入5ml新鲜配制的提取缓冲液(表3-2),转入10ml的离心管中,涡旋混匀,冰浴保存10min。10000rpm离心20min(4℃),弃上清;

(2)于沉淀中加入3ml 65℃预热的裂解缓冲液(表3-3),并用铜丝搅松,涡旋混匀,65℃水浴30min;

(3)加入3ml氯仿∶异戊醇(24:1)混合液,翻转50次以上,10000rpm离心20min(15℃),将上清转入10 ml的离心管中,加0.6体积的预冷的异丙醇,缓慢翻转30次,混匀,静置10min,10000rpm,离心10min(RT),弃上清,于沉淀中加入2 ml 70%的乙醇洗涤,并转入5 ml的离心管中,10000rpm离心5min。倒掉上清液,通风干燥20min;

(4)加2 ml TE缓冲液溶解,65℃培养10~30min,加等体积的氯仿∶异戊醇(24∶1),缓慢翻转50次,混匀,室温静置5min,10000rpm离心10min;

(5)上清液转入5ml离心管中,加0.1体积的3M醋酸钠(pH 5.2),加等体积的异丙醇后翻转30次,放置30min,10000rpm离心5min。弃上清液,加1 ml 70%乙醇洗DNA小团,转入1.5 ml的离心管中,10000rpm离心5min。弃上清液,自然通风干燥DNA小团;

(6)加200 l TE缓冲液(10mM Tris/HCl(PH 8.0),1mM EDTA(PH 8.0),PH 8.0)溶解DNA(4℃,30min以上),并保存。

表3-2 DNA提取缓冲液配制

Table 3-2 Extration solutions to extract DNA

工作液Working Solution ml ml 存储液Stock Solution

0.35M Glucose 34.68g 6.936g Glucose

0.1M Tris.HCl 50 10.0 1.0M Tris.HCl(pH 8.0)

5mM Na.EDTA 5 1.0 0.5M EDTA(pH 8.0) 2% PVP 100 20.0 10% PVP 1%(V/V)β-Me 5 1.0 Liquid dd Water 340 68.0

Total 500ml 100ml

表3-3 裂解缓冲液配制

Table 3-3 Lysis solutions to extract DNA

工作液Working Solution ml Ml 存储液Stock Solution

1.4M NaCl 40.908g 8.1816g Salt

0.1M Tris.HCl 50 10 1.0M Tris.HCl(pH 8.0)

20mM Na.EDTA 20 4 0.5M Na.EDTA(pH 8.0) 2%CTAB 100 20 10% CTAB

2% PVP 100 20 10% PVP 1%(V/V)β-Me 5 1.0 Liquid dd Water 225 45

Total 500ml 100ml

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