分子印迹渍介绍与分子杂交技术分析

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NL不具备)
--结合能力较NC膜低
--活化过程较复杂 4) 滤纸
结合能力较弱,但经济(基因文库粗筛的菌落原位杂交)
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转膜
是指将核酸,蛋白质等生物大分 子固定在纤维膜上的过程。将核酸或 蛋白质从电泳后的凝胶中转移到膜上 或直接将核酸点到膜上。
(1)物理吸印方法
(毛细虹吸 真空抽吸)
--杂交本底较高分子印迹渍介绍和分子杂交技术分析
3) 化学活化膜(chemical activatedБайду номын сангаасmembrane)
将虑膜用一定的化学物质处理后即形成化学活化膜 (如ABM和APT纤维素膜),这种化学活化膜经特殊处 理而活化,产生活化基团(重氮盐)与DNA或RNA分子 共价结合。
• DNA与膜共价结合,反复多次使用不会损耗太多。 •对不同大小的核酸片段都具有同等的结合能力(NC、
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Eastern Blot
(1982年Reinhart等用电转移法将等电聚焦 后的 蛋白质区带从凝胶转移到特定膜上,称Eastern 印迹。)
Dot Blot In situ hybridization
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固相核酸印迹杂交类型
Southern印迹杂交( southern blot ) Northern印迹杂交(Northern blot) 斑点杂交(Dot blot) 菌落原位杂交(Colony in situ
Northern Blot--RNA (Alwine等将类似方法用于RNA印迹,被戏称为 Northern印迹。)
Western Blot--Protein(immunoblotting) (1979年Towbin等设计了将蛋白质从凝胶转移到硝酸纤维素膜的装
置,将蛋白质转移到膜上,再与相应的抗体等配体反应,被戏称为 Western印迹,这种装置将膜和凝胶、滤纸等制成夹心饼干状,用低 电压完成转移。)
hybridization) 组织原位杂交(Tissue in situ
hybridization)可以确定探针的互补序 列在胞内的空间位置
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流程 1.将核酸分子酶切成 为多个片段 2.变性电泳(或者电 泳之后变性), 使各片段分离 3.将凝胶中的核酸片 段转移到固相支 持物上 4.预杂交 杂交 5.洗膜 6.检测
hybridization) 组织原位杂交(Tissue in situ
hybridization)可以确定探针的互补序列 在胞内的空间位置
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斑点杂交(Dot blot) 斑点杂交法是将被检标本点到膜上,烘烤固定。这种方法耗时 短,可做半定量分析,一张膜上可同时检测多个样品。为使点 样准确方便,市售有多种多管吸印仪(manifolds),如 Minifold I和II、Bio-Dot (Bio –Rad )和Hybri –Dot,它们有许多孔, 样品加到孔中,在负压下就会流到膜上呈斑点状或狭缝状,反 复冲洗进样孔,取出膜烤干或紫外线照射以固定标本,这时的 膜就可以进行杂交。
在其表面的探针分子洗脱掉。 5) 具有良好的机械性能,如柔软性,柔韧性。
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几种常用固相支持物
1)硝酸纤维素虑膜(nitrocellulose filter membrane)
• 具有较强吸附单链DNA和RNA的能力(高盐下达
80µ g/ cm2 ~ 100µ g/ cm2 )。
(2)电转印方法
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印迹(渍)技术
Southern Blot--DNA(由Edwin Mellor Southern 等人首次应用) (1975年,Southren创造了将DNA区带原位转移到硝酸基纤维素膜
(NC膜)上,再进行杂交的方法,被称为Southren印迹法。)
•真空烘干后,依靠疏水性相互作用。 •杂交本底较低。
--不易反复杂交和洗膜(结合力) --质地较脆,烘烤后更甚,小心操作 --与核酸结合依赖高盐,低盐结合不佳,
不易核酸电转
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2) 尼龙膜(nylon membrane)
• 结合单链DNA和RNA的能力比NC膜强(达 350µ g/
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固相支持物应具备的特点:
1) 具有较强的结合核酸分子的能力(>10µ g/ cm2 ) 2) 与核酸结合后,不影响其与探针分子的杂交反应。 3) 与核酸稳定牢固结合,能经受杂交、洗膜等操作
过程。 4) 非特异性吸附少,洗膜条件下能将非特异性吸附
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流程 1.将核酸分子酶切成 为多个片段 2.变性电泳(或者电 泳之后变性), 使各片段分离 3.将凝胶中的核酸片 段转移到固相支 持物上 4.预杂交 杂交 5.洗膜 6.检测
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固相核酸分子杂交类型
Southern印迹杂交( southern blot ) Northern印迹杂交(Northern blot) 斑点杂交(Dot blot) 菌落原位杂交(Colony in situ
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(1)DNA斑点杂交 ①先将膜在水中浸湿,再放到15×SSC中。 ②将DNA样品溶于水或TE,煮沸5min,冰中速冷。 ③用铅笔在滤膜上标好位置,将DNA点样于膜上。每
个样品一般点50μl(2~10μg DNA)。 ④将膜烘干,密封保存备用。
cm2 ~ 500µ g/ cm2 )。
•真空烘干后或紫外线照射可强化结合(短波UV照射后,
部分嘧啶碱基与其氨基交联,更加牢固)。
•微波处理和碱处理也可促结合,从而使细菌裂解、DNA
变性与固定一步完成(菌落原位杂交)。
• 韧性较强,操作方便。 • 能结合小分子核酸。 • 低盐也能很好结合(可用于核酸电转移)。 • 可反复杂交和洗膜。
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RNA斑点杂交: 1)与上法类似,每个样品至多加10μg总 RNA(经酚/氯仿或异硫氰酸胍提取纯化)。 2)将RNA溶于5μl DEPC水,加15μl甲醛 /SSC缓冲液(10×SSC中含0.15mol/l 甲醛) 使RNA变性。 3)然后取5~8μl点样于处理好的滤膜上,烘 干。
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