《细菌分类与鉴定》PPT课件

种和亚种指定模式菌株（type strain）；
亚属和属指定模式种（type species）；
属以上至目级分类单元指定模式属（type genus）；
模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。
美国典型培养物保藏中心（ATCC）
德国微生物及细胞保藏中精选心课件（ppt DSM）
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细菌分类命名权威杂志:国际系统与进化微生物学杂志 （International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology,IJSEM）
任何分离鉴定的新细菌的有关论文应在该杂志发表
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二、 原核微生物分类系统
（一）《伯杰氏鉴定细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology)
美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey)(1860-1937)
伯杰氏手册: 是目前进行细菌分类、鉴定的最重要参考书， 其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行 鉴定所需做的实验的具体方法。
微生物的分类和鉴定
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地球上的物种估计大约有150万， 其中微生物超过10万种，而且其数目还 在不断增加。
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生物分类的二种基本原则：
a）根据表型(phenetic)特征的相似程度分群归类，这种 表型分类重在应用，不涉及生物进化或不以反映生 物亲缘关系为目标。
b）按照生物系统发育相关性水平来分群归类，其目标 是探寻各种生物之间的进化关系，建立反映生物系 统发育的分类系统。
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五、微生物分类鉴定的方法
生物分类的传统指标 分子生物学指标 微型、简便、快速或自动化鉴定技术 细菌的数值分类
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生物分类的传统指标
形态学特征 生理学特征 生态学特征
从不同层次，用不同学科的技术方法来研究和比较 不同微生物的细胞、细胞组分或代谢产物，从中发现的 反映微生物类群特征的资料。
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四、微生物分类鉴定的依据
根据微生物分类学中使用的技术和方法， 可把它们分成四个不同的水平： • ①细胞形态和行为水平； • ②细胞组分水平； • ③蛋白质水平； • ④基因组水平。 • 在微生物分类学发展的早期，主要的分类 鉴定指标是以在细胞形态和习性为主，可 称为经典的分类鉴定法
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伯杰氏细菌鉴定手册
1923年以来已出至第九版(1994)； 第九版伯杰氏细菌鉴定手册设立35个群，将古细菌部 改编为5个群，全书描写了约500个属。 划分为四大类：
第一类 具细胞壁的革兰氏阴性真细菌 第二类 具细胞壁的革兰氏阳性真细菌 第三类 无细胞壁的真细菌 第四类 古细菌
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（二）伯杰氏系统细菌学手册 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology)
第一版 1984年问世，至1989年出齐，共4卷。 第二版 由George Garrity主编分为5卷，将从2000年起 陆续出版。这一版纳入了研究核糖体RNA测序所产生 的许发育)分类系统。
从进化论诞生以来，已经成生物学家普遍接受的分类原则
精选课件ppt 生物系统学(systematics3 )
一、分类单元及其等级
界 （Kingdom） (Regnum)
门 （Phylum） (Phylum) 纲（Class） (Classis) 目（Order） (Ordo) 科（Family） (Familia)
Salmonella spp.
• 亚种用subsp.（正体）表示
Pasteurella multocida subsp. septica
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Fra Baidu bibliotek
由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准， 为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱， 细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念”
Salmonella pullorum (S. pullorum)
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几种不同的书写情况：
• 属名重复出现，可缩写
如：E.coli （大肠杆菌）； S. pullorum（鸡白痢沙门氏菌）
• 只确定属名，未确定种名的某一株细菌
Salmonella sp.
• 只确定属名，未确定种名的若干菌株
属（Genus） (Genus)
种（Species） (Species)
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常用的细菌分类学术语：
1）培养物(culture)：一定时间一定空间内微生物的细 胞群或生长物。如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物
等。 2）菌株(strain)：从自然界中分离得到的任何一种微生
物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株；对不同
来源的同一种细菌称为该菌的不同菌株。同一种细菌
可有许多菌株，其主要性状应该完全相同，次要性状
可稍有差异，通常用地名或动物名的缩写加编号作菌
株名。
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3）型(form或type)：常指亚种以下的细分。当同种或同
亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以 细分为不同的型。（如不同血清型、噬菌型等）
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一、形态学特征
培养特征、 细胞形态及其染色特性、
特殊的细胞结构、 运动性、 等等
微生物分类和鉴定的重要依据：
a）易于观察和比较，尤其是真核微生物和具有特殊 形态结构的细菌；
b）许多形态学特征依赖于多基因的表达，具有相对 的稳定性；
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二、细菌的命名
细菌的命名依据“国际细菌命名法规” 的规定， 学名用拉丁文，遵循“双名法”。所谓“双名法” 就是每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部 分构成，属名第一个字母必须大写，其余均应小 写（即使种名以人名或地名命名）。整个属名及 种名在出版物中应排成斜体。
如：Escherichia coli 属名+种名
菌株与型的区别： 菌株之间不存在鉴别性特征的差异，命名不同的菌株无需分 类学依据，不同型的细菌之间存在鉴别性特征的差异，命名 或鉴定不同的型必需有分类学依据。
4）种（species）： 物种，生物分类中基本的分类单元
微生物的种：具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群与其
他类群的菌株有很明显的区别。
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