第一章 氨基酸与多肽化学
第一章、氨基酸的结构及性质
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一、氨基酸的结构通式
氨基酸是蛋白质水解的最终产物,是组成蛋白质的基本单位。从蛋白质水解物中 分离出来的氨基酸有二十种,除脯氨酸和羟脯氨酸外,这些天然氨基酸在结构上 的共同特点为:
(1). 与羧基相邻的α-碳原子上 都有一个氨基,因而称为α-氨 基酸 (2). 除甘氨酸外,其它所有氨基 酸分子中的α-碳原子都为不对 称碳原子,所以:A.氨基酸都具 有旋光性。B.每一种氨基酸都 具有D-型和L-型两种立体异构 体。目前已知的天然蛋白质中 氨基酸都为L-型。
● ● ● 酸性氨基酸(一氨基二羧基)及其酰胺
天冬氨酸 (Asp, D)
谷氨酸 (Glu, E)
Page 9
天冬酰胺 (Asn, N)
谷氨酰胺 (Gln, Q)
● ● ● ● 碱性氨基酸(二氨基一羧基)
赖氨酸 (Lys, K)
Page 10
精氨酸 (Arg, R)
杂环
组氨酸 (His, H)
2、芳香族氨基酸
大多数蛋白质含有这三种氨基酸 残基,所以测定蛋白质溶液280nm的光 吸收值是分析溶液中蛋白质含量的快速 简便的方法。
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芳香族氨基酸的紫外吸收
Page 34
Phe:max = 257nm,257 = 2.0×102 mol-1•L•cm-1 Tyr:max = 275nm,275 = 1.4×103 mol-1•L•cm-1 Trp:max = 280nm,280 = 5.6×103 mol-1•L•cm-1
杂环亚氨基酸
(二)按R基的极性性质的分类
1. 非极性氨基酸 2. 极性中性氨基酸 3. 酸性氨基酸 4. 碱性氨基酸
* 20种氨基酸的英文名称、缩写符号及分类如下:
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【高中化学】高中化学选修1 第一章 第三节 生命的基础----蛋白质(一) 教案

第一章关注营养平衡第三节生命的基础----蛋白质(一)教学目标:1、了解氨基酸、蛋白质的结构和性质特点了解肽键及多肽;了解蛋白质的组成。
2、通过学生动手实验培养操作技能与观察能力,使之正确进行实验分析,从而加深对概念的理解,并抽象形成规律性认识。
3、培养学生的辩证唯物主义的观点。
4、通过学生实验,使学生的科学态度、思想情趣得到陶冶;通过钟南山院士事迹、结晶牛胰岛素的成功合成激发学生爱国主义思想感情,民族自豪感。
教学重点:氨基酸、蛋白质的结构和性质特点。
教学难点:氨基酸、蛋白质的性质。
教学过程:蛋白质广泛存在于生物体内,是组成细胞的基础物质。
动物的肌肉、皮肤、血液、乳汁以及发、毛、蹄、角等都是由蛋白质构成的。
蛋白质是构成人体的物质基础,蛋白质是生命的基础,没有蛋白质就没有生命。
今天我们来学习生命的基础----蛋白质。
第三节生命的基础----蛋白质含有丰富蛋白质的食品:资料卡片蛋白质是一类非常复杂的化合物,由碳、氢、氧、氮、硫等元素组成。
蛋白质的相对分子质量很大,从几万到几千万。
例如,烟草斑纹病毒的核蛋白的相对分子质量就超过了两千万。
因此,蛋白质属于天然有机高分子化合物。
我们学习蛋白质组成和结构。
一、蛋白质组成和结构蛋白质的复杂结构:1、氨基酸组成了蛋白质蛋白质在酸、碱或酶的作用下能发生水解,水解的最终产物是氨基酸。
下面是几种氨基酸的例子:氨基酸特点,写出氨基酸的通式。
氨基酸分子中既有氨基(-NH2),又有羧基(-COOH),因此它既能跟酸反应,又能跟碱反应,具有两性。
通式:有氨基(-NH2),又有羧基(-COOH),因此它既能跟酸反应,又能跟碱反应,具有两性。
现在从动植物体内蛋白质水解产物中分离出来的氨基酸有几百种。
但是,构成主要蛋白质的氨基酸只有20多种。
什么是两性物质,推测氨基酸的性质有那些?既与酸反应又与碱反应,还能互相反应(从结构上去分析)2、多肽肽: 一分子氨基酸中的羧基和另一分子氨基酸中的氨基之间脱去一个水分子, 经缩合反应而生成的产物.肽键: -CO-NH-请完成下列化学方程式,指出生成物是什么,并标出肽键。
氨基酸_多肽
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肽键的平面特征
15
15.5 蛋白质的结构 蛋白质也是由氨基酸以酰胺键形成的大分子化合物。 蛋白质与多肽并无严格的界线,通常是将相对分子量在 10000以上的多肽称为蛋白质。在10000以下的称为多肽。 蛋白质的结构可分为四级: 一级结构:氨基酸的连接顺序。 二级结构:肽链的的构象及通过链内或链间的氢键形 成的α-螺旋、β-折叠等结构。 三级结构:是指在二级结构基础上,肽链相互扭在一 起或卷曲成其他形状。
∆ R CH2NH2 + CO2 R CH COOH 或脱羧酶 NH2
8 脱羧和脱氨基反应
(CH3)2CHCH2CHCOOH + H2O NH2 酶 (CH3)2CHCH2CH2OH + CO2 + NH3
11
二 多肽和蛋白质
一个氨基酸分子的氨基与另一个氨基酸的羧基之间失 水形成的酰胺键称为肽键。
16
四级结构:是指由多条具有一、二、三级结构的肽链 通过非共价键连接起来的结构形式。
一 級 结 构
二 級 结 构
三 級 结 构
四 級 结 构
17
α-螺旋 多肽链中的各个肽平面围绕同一 轴旋转,形成螺旋结构,螺旋一 周,沿轴上升的距离即螺距为 0.54nm,含3.6个氨基酸残基;两 个氨基酸之间的距离为0.15nm; 肽链内形成氢键,氢键的取向几 乎与轴平行,第一个氨基酸残基 的酰胺基团的-CO基与第四个氨 基酸残基酰胺基团的-NH基形成 氢键。 蛋白质分子为右手α-螺旋。
6
2 与亚硝酸反应
R CH COOH + HNO2 NH2 R CH COOH + N2 + H2O OH
反应是定量进行的,可以根据放出氮气的量计算分子 中氨基的量。(范斯来克氨基测定法) 3 与醛反应
有机化学氨基酸、多肽、蛋白质
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6 种异构体 24种异构体
许多种氨基酸按照不同的排列顺序, 构成了自 然界中种类繁多的多肽和蛋白质。
命名多肽时以C-末端的氨基酸残基为母体, 由 N-端叫起, 依次称为某氨酰(基)某氨酸。
O
O
O
H2N CHC NH CH2C NH CHC OH
N-端
CH3
CH2
C-端
丙氨酸残基 甘氨酸残基 苯丙氨酸残基
利用蛋白质分子胶体颗粒大不能透过半透膜 的性质可将蛋白质分离提纯,这种方法称为透析 法(dialysis)。
(三)蛋白质的沉淀和变性
调节蛋白质溶液的pH值至等电点, 再加入适当的脱水剂除去蛋白质分子表 面的水化膜, 可使蛋白质分子聚集而从溶液中沉淀析出。
根据生成紫色化合物颜色的深浅程度,或根据放出
CO2气体的体积,可对 α-氨基酸 进行定量分析。 也常用于层析实验中氨基酸的显色。
第二节 肽肽ຫໍສະໝຸດ 氨基酸残基之间彼此通过酰胺键 (肽键)连 接而成的一类化合物。其通式为:
RO
R’ O
H2N C-C-OH + H N C-C-OH
H
HH
A氨m基ino酸acid
第十四章 氨基酸、蛋白质
第一节 氨基酸
一、氨基酸的分类、命名和构型
氨基酸的结构特点
①都是α-氨基酸(脯氨酸是
α–亚氨基酸); H N
COOH H
R CH COO- 内盐
NH3+
偶极离子
②除甘氨酸外,都是L-氨基酸(左旋);
③各氨基酸侧链R基团不同,氨基酸结构和性质有差异
1、分类
据化学结构:
任何一种蛋白质分子在天然状态下均具有独特 而稳定的构象,这是蛋白质分子在结构上最显著的 特点。为了表示蛋白质分子不同层次的结构,常将 蛋白质分子结构分为一级、二级、三级和四级。一 级结构又称为初级结构或基本结构,二级结构以上 属于构象范畴,称为高级结构。
氨基酸与多肽
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第一节氨基酸与多肽一、氨基酸的结构与分类1.氨基酸是蛋白质的基本单位2.构成人体蛋白质的氨基酸是L-α-氨基酸3.L-α-氨基酸含有不对称碳原子,甘氨酸除外记忆小窍门:甘氨酸,即甜味氨基酸4.氨基酸的分类(1)酸性氨基酸:谷氨酸和天冬氨酸(2)碱性氨基酸:赖、精和组氨酸(3)极性中性氨基酸:丝、苏、谷氨酰胺、天冬酰胺、半胱氨酸(4)非极性疏水性氨基酸:甘、丙、缬、亮、异亮、脯氨酸(5)芳香族氨基酸:苯丙、色、酪二、肽键与肽链肽键:氨基酸的氨基和羧基形成的酰胺键(1)氨基和羧基形成(2)一定程度的双键性质(3)维系蛋白质一级结构的主要力量第二节蛋白质的结构一、一级结构1.一级结构是氨基酸的排列顺序2.肽键是维系一级结构的主要力量。
除此以外,还有二硫键(两个半胱氨酸之间形成二硫键)。
3.蛋白酶水解是使蛋白质的肽键被水解,变成氨基酸残基。
二、二级结构1.二级结构是多肽链主链的空间结构,不涉及侧链2.氢键是维系二级结构的主要力量。
3.代表性结构:α-螺旋,β-折叠,β-转角4.α-螺旋:右手螺旋、3.6个氨基酸一圈、螺距是0.54nm三、三级结构1.三级结构是多肽链所有原子的空间排布2.疏水键、盐键、二硫键、氢键和范德华力量是维系三级结构的主要力量。
四、四级结构1.具有四级结构的蛋白质是有两条或者以上的肽链构成2.每一条肽链都有自己的一、二、三级结构,这条肽链叫做亚基。
3.亚基可以相同,也可以不同4.亚基的立体排布和相互关系叫做四级结构5.由亚基构成的蛋白叫做寡聚蛋白6.独立的亚基没有生物学活性第三节蛋白质的结构和功能的关系一、一级结构与功能的关系1.一级结构是空间构象的基础2.一级结构是功能的基础3.一级结构并不是决定空间构象的唯一因素4.蛋白质的一级结构与分子病镰刀红细胞贫血:一个氨基酸(谷→缬)的差异二、高级结构与功能的关系2.血红蛋白的空间构象变化与结合氧O2与Hb结合后引起Hb构象变化,进而引起蛋白质分子功能改变的现象,称为别构效应。
化生导论第一章 蛋白质2
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中C-N旋转角度由表示。 C-C间旋转角度由表示,它们被称为-碳原子的二 面角。
17
几个基本概念
肽单位的三个显著特征:肽平面、 -碳原子的二面角、反式结构。 一级结构的最小单位是氨基酸残基,高级结构的最小单位是肽单位。
四肽的结构
鹅膏鹅覃膏碱覃碱的的化化学结学构结构
22
Met-脑啡肽 Leu-脑啡肽
牛催产素(九肽)
短杆菌肽S(环十肽)
23
谷胱甘肽
-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸,简写为GSH,是广泛存在于动物和植物细胞中 的一种三肽,在生物体内发生的氧化还原反应中起重要作用。它有两种存 在形式,即还原型和氧化型:
氧化型
还原型
24
四、多肽的应用
目前对肽类物质的应用主要在以下3个方面: ①肽类试剂:纯度非常高,主要应用在科学试验和生化检测上,价格十分昂贵
25
四、多肽的应用
②肽类药物:目前已生产出近百种肽类药物,涉及到大部分疾病的临床治疗。
26
四、多肽的应用
③功能食品:具有一定功能的肽类食品,目前是国际上保健品行业研究、开发 的热门。日本、美国、欧洲已捷足先登,推出具有各种各样功能 的食品及添加剂,形成了一个具有极大商业前景的产业。
第二节 多肽
1
肽(peptide)是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。
肽键(peptide bond):是由一个氨基酸的-羧基与另 一个氨基酸的-氨基脱水缩合而形成的化学键。
2
O
NH2-CH-C +
H OH
甘氨酸
O NH-CH-C
H H OH
甘氨酸
-HOH
第一章蛋白质结构基础全篇
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39
蛋白质工程
活性位置
无生物活性
40
蛋白质工程
(5)复杂模体(complex motif)
两个相邻的β发夹型模体通过环链相连,构成更加复杂 的模体。组合方式有24种,只有8种被观察到。
41
蛋白质工程
4. 结构域(domain)
结构域:二级结构和结构模体以特定的方式组合连接,在 蛋白质分子中形成 2 个或多个在空间上可以明显 区分的三级折叠实体,称为结构域。
半胱氨酸
Cys
C
glutarmine 谷氨酰胺
Gln Glx
Q
glutarmic acid 谷氨酸
Gln Glx
E
glycine
甘氨酸
Gly
G
histidine
组氨酸
His
H
isoleucine 异亮氨酸
Ile
I
leucine
亮氨酸
Leu
L
lysine
赖氨酸
Lys
K
methionine 甲硫氨酸
Met
可用来鉴定蛋白质构象是否合理。
⑴实线封闭区域
一般允许区,非键合原子间的距离大于一般允许距离,此区域内任何二面角确定的构象都是允许 的,且构象稳定。
⑵虚线封闭区域
是最大允许区,非键合原子间的距离介于最小允许距离和一般允许距离之间,立体化学允许,但 构象不够稳定。
⑶虚线外区域
16 是不允许区,该区域内任何二面角确定的肽链构象,都是不允许的,此构象中非键合原子间距离
构象:组成分子的原子或基团绕单键旋转而形成的不同空 间排布。构象改变,无共价键的断裂和重新形成, 化学上难于区分和分离。
生物化学 第一篇 蛋白质的结构与功能

第一篇蛋白质的结构与功能(第一~四章小结)第一章氨基酸氨基酸是一类同时含有氨基和羧基的有机小分子。
组成多肽和蛋白质的氨基酸除Gly外,都属于L型的α- 氨基酸(Pro为亚氨基酸)。
氨基酸不仅可以作为寡肽、多肽和蛋白质的组成单位或生物活性物质的前体,也可以作为神经递质或糖异生的前体,还能氧化分解产生ATP。
目前已发现蛋白质氨基酸有22种,其中20种最为常见,而硒半胱氨酸和吡咯赖氨酸比较罕见。
非蛋白质氨基酸通常以游离的形式存在,作为代谢的中间物和某些物质的前体,具有特殊的生理功能。
22种标准氨基酸可使用三字母或单字母缩写来表示。
某些标准氨基酸在细胞内会经历一些特殊的修饰成为非标准蛋白质氨基酸。
氨基酸有多种不同的分类方法:根据R基团的化学结构和在pH7时的带电状况,可分为脂肪族氨基酸、不带电荷的极性氨基酸、芳香族氨基酸、带正电荷的极性氨基酸和带负电荷的极性氨基酸;根据R基团对水分子的亲和性,可分为亲水氨基酸和疏水氨基酸;根据对动物的营养价值,可分为必需氨基酸和非必需氨基酸。
氨基酸的性质由其结构决定。
其共性有:缩合反应、手性(Gly除外)、两性解离、具有等电点,以及氨基酸氨基和羧基参与的化学反应,包括与亚硝酸的反应、与甲醛的反应、Sanger反应、与异硫氰酸苯酯的反应和与茚三酮的反应等。
与亚硝酸的反应可用于Van Slyke定氮,与甲醛的反应可用于甲醛滴定,Sanger反应和与异硫氰酸苯酯的反应可用来测定N-端氨基酸。
只有脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色物质,其余生成蓝紫色物质,利用此反应可对氨基酸进行定性或定量分析。
多数氨基酸的侧链可能发生特殊的反应,可以此鉴定氨基酸。
不同氨基酸在物理、化学性质上的差异可用来分离氨基酸,其中最常见的方法是电泳和层析。
第二章蛋白质的结构肽是氨基酸之间以肽键相连的聚合物,它包括寡肽、多肽和蛋白质。
氨基酸是构成肽的基本单位。
线形肽链都含有N端和C端,书写一条肽链的序列总是从N端到C端。
浙江大学化学系生物有机课件(马成)
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生物有机化学Bioorganic Chemistry参考资料:1、古练权,马林,生物有机化学,高等教育出版社,19982、H. Dugas, Bioorganic Chemistry, 3rd Ed., Springer, 19953、刘育,尤长城,张衡益编著,超分子化学-合成受体的分子识别与组装,p385-400,南开大学出版社,20014、原始文献第一章绪论§1.1 生物分子与生物有机化学自然界中所有生物体的物质组成水生物分子金属离子(生物无机化学)蛋白质、核酸、糖、脂、维生素、激素等生物有机化学的研究对象、方法和结果生物分子和生物活性物质有机化学研究生物化学研究(结构测定,反应机制,(分离,提纯,生物功能化学合成,化学修饰)生物合成,基因研究)分子模型和实验室模拟研究设计合成新的生物分子与生物活性物质应用§1.2 生物大分子1、常见官能团2、基本结构单元3、立体结构的维系生物大分子中的重要官能团生物大分子中常见的其他基团2、基本结构单元一氨基一羧基酸一氨基二羧基酸、二氨基一羧基酸芳香及杂环氨基酸构成核酸的结构单元分子构成脂和糖的结构单元分子3、立体结构的维系共价键氢键配价键离子键疏水作用范德华作用力氢键及其典型的键长DNA碱基对中的氢键键酶的选择性结合(氢键)血红蛋白中的配价键酶中的离子键范德华力与距离的关系使蛋白质相互连接的作用(力)§1.3 生物体内发生的基本化学反应水解及缩合酯键,酰胺键,糖苷键的水解。
缩合是水解的逆反应如氧化和还原碳链增长反应DNA的烷基化及去烷基化磷酰化反应ATP(adenosine triphosphate),三磷酸腺苷分子重排反应异构化反应§1.4 生物有机化学的立体效应K 1/K 2=104一、邻基效应(proximity effect )二、潜手性中心与潜手性面的选择乙醛分子的潜手性面乙醛加氘生成手性醇的反应醇和辅酶NAD+作用NAD +(nicotinamideadenine dinucleotide ),即烟酰胺腺嘌呤二核苷酸N O氘代乙醇和辅酶NAD+的氧化还原反应YADH(yeast alcohol dehydrogenase)酵母乙醇脱氢酶还原三、生物分子的相互作用与超分子5‘●●●●●●●●●●●3’A T G C G T A T GT A C G C A T A C3’●●●●●●●●●●●5’DNA碱基对的识别。
人教版高中化学选修1 第一章 第三节 生命的基础-蛋白质练习含答案

第三节生命的基础——蛋白质氨基酸和多肽1.蛋白质的结构为什么这么复杂?提示:氨基酸是蛋白质的基本结构单元。
种类很多,组成蛋白质时种类、数量不同,排列的次序差异很大。
所以,蛋白质的结构很复杂。
►综合拓展一、氨基酸的化学性质氨基酸分子里含有羧基和氨基,羧基表现酸性,氨基表现碱性。
因此,氨基酸与酸或碱都能反应生成盐,具有两性。
1.与碱反应:2.与酸反应:3.脱水缩合反应:氨基酸分子中的氨基和羧基之间可以发生脱水缩合反应。
(1)两个氨基酸分子间脱去1分子水生成二肽,如:(2)两个氨基酸分子间脱去2分子水生成环状化合物,如:(3)多个氨基酸分子间缩合脱水(缩聚)生成多肽,如:蛋白质的性质2.什么是蛋白质互补?蛋白质互补遵循什么原则?提示:蛋白质互补就是两种或两种以上食物蛋白质混合食用,其中含有的必需氨基酸取长补短,相互补充,达到较好的比例,从而提高蛋白质的利用率。
其遵循的原则有:①食物的生物学种属越近越好;②搭配种类越多越好;③食用时间越近越好,同时食用最好。
►综合拓展二、盐析与变性的区别盐析变性加热、紫外线、X射线、强酸、强碱、重金属变化条件浓的无机轻金属盐盐以及甲醛、乙醇等部分有机化合物物理变化变化实质化学变化(蛋白质性质改变)(溶解度降低)变化过程可逆不可逆用途分离、提纯蛋白质杀菌、消毒1.下列关于蛋白质的叙述正确的是(B)A.加热会使蛋白质变性,因此生吃鸡蛋比熟吃好B.一束光线照射蛋白质溶液,产生丁达尔现象C.向鸡蛋清中加入食盐,会使蛋白质变性D.天然蛋白质中仅含C、H、O、N四种元素解析:蛋白质溶液是胶体,能产生丁达尔现象,B项正确;食盐不是重金属盐,不能使蛋白质变性,C项错误;蛋白质中含有碳、氢、氧、氮及少量的硫,有的还含有微量磷、铁、锌、钼等元素,D项错误。
2.波尔多液由CuSO4溶液和石灰乳混合而成,其防治病虫害的原因是(C)A.硫酸铜能使菌体蛋白质发生盐析而凝固B.石灰乳能使菌体蛋白质水解而推动生理活性C.铜离子在碱性条件下可使菌体蛋白质性质改变而发生聚沉D.蛋白质可以溶解在波尔多液中解析:波尔多液是硫酸铜和氢氧化钙的混合液。
生物化学第一章 蛋白质——结构与功能的关系

Arg
缩,有催产及排乳功能,并促进遗
Gly NH2
忘; 加压素:使血管平滑肌收缩,增加
牛加压素
血压,减少排尿,故又叫抗利尿素; 并增强记忆
(3)、神经肽
➢·脑啡肽
+H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Met-COO-
➢·Leo脑啡肽
+H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-COO-
➢·有镇痛麻醉作用。
(2). 多肽类激素:
•种类较多,生理功能各异。主要见于 下丘脑及垂体分泌的激素。
Cys Tyr ILe Gln Asn Cys Pro Leu Gly
S S
NH2
牛催产素
Cys Tyr Phe Gln Asn Cys Pro Arg Gly
S S
NH2
牛加压素
催产素和加压素
Cys Tyr ILe S Gln S Asn Cys Pro Leu Gly NH2
第三节 肽
1. 肽的概念
一个氨基酸的羧基和另一个氨基酸的氨基脱水缩合而 成的化合物称为肽。其中的氨基酸单位称氨基酸残基。
肽键:肽分子中,一个氨基酸分子的α-羧基与另一个 氨基酸分子的α-氨基经脱水形成的键(-CO-NH),又 称为酰胺键(肽键)。
H2N
R1 O CC
OH
+
HN
R2 C
COOH
- H2O
4. 肽的物理和化学性质
• 短肽在晶体和水溶液中以偶极离子形式存在,酸碱性 质决定于末端的氨基和羧基以及可解离的侧链基团。
• 许多化学反应与氨基酸相似,与茚三酮发生呈色反应; 能发生双缩脲反应,形成紫红色或蓝紫色反应(氨基酸 不能) Pr特有的反应。
生化第一二章总结及习题
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第一章氨基酸一、名词解释1.氨基酸(amino acid):含有氨基和羧基的一类有机化合物的通称。
生物功能大分子蛋白质的基本组成单位,是构成动物营养所需蛋白质的基本物质。
是含有一个碱性氨基和一个酸性羧基的有机化合物。
氨基连在α-碳上的为α-氨基酸。
组成蛋白质的氨基酸均为α-氨基酸。
出现在蛋白质中的氨基酸称为蛋白质氨基酸,又名标准氨基酸,目前发现22种,其中20种较常见。
2.蛋白质氨基酸(proteinogenic amino acid):出现在蛋白质分子中的氨基酸。
3.亲水氨基酸(hydrophilic amino acid):亲水氨基酸的R基团有极性,对水分子具有一定的亲和性,一般能和水形成氢键。
4.疏水氨基酸(hydrophobic amino acid):疏水氨基酸的R基团呈非极性,对水分子的亲和性不高或者很低,但对酯溶性物质的亲和性较高。
5.必需氨基酸(essential amino acid):必需氨基酸指的是人体自身(或其它脊椎动物)不能合成或合成速度不能满足人体需要,必须从食物中摄取的氨基酸。
它是人体(或其它脊椎动物)必不可少,而机体内又不能合成的,必须从食物中补充的氨基酸,称必需氨基酸。
必需氨基酸共有十种:Lys,Trp,Phe,Met,Thr,Ile,Leu,Val,Arg和His。
人体虽然能合成Arg和His,但合成的量在特定阶段不能满足正常需要。
因此这两种氨基酸又称为半必需氨基酸(semi-essential amino acid)。
6.非必需氨基酸(nonessential amino acid):人体自身(或其它脊椎动物)自身可以进行有效的合成,它们是:Ala,Asn,Asp,Gln,Glu,Ser,Cys,Tyr 和Gly。
7.非蛋白质氨基酸(Non-protein amino acid):不存在于蛋白质分子中而以游离状态和结合状态存在于生物体的各种组织和细胞的氨基酸。
第一章氨基酸
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第一章氨基酸(amino acid)的结构与性质第一节氨基酸的结构与分类一、氨基酸的结构组成蛋白质的基本单位是氨基酸。
如将天然的蛋白质完全水解,最后都可得到约二十种不同的氨基酸。
从氨基酸的结构通式可以看出:构成蛋白质的氨基酸均为L—α—氨基酸。
除R 为H(甘氨酸)外,其余氨基酸均具有旋光性。
*在空间各原子有两种排列方式:L—构型与D—构型,它们的关系就像左右手的关系,互为镜像关系,下图以丙氨酸为例:二、氨基酸的分类:1.按氨基酸分子中羧基与氨基的数目分:酸性氨基酸:一氨基二羧基氨基酸,有天冬氨酸、谷氨酸;碱性氨基酸:二氨基一羧基氨基酸,有赖氨酸、精氨酸、组氨酸;中性氨基酸:一氨基一羧基氨基酸,有甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸、脯氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸。
2.按侧基R 基的结构特点分:脂肪族氨基酸芳香族氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸杂环氨基酸:脯氨酸、组氨酸3.按侧基R 基与水的关系分:非极性氨基酸:有甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸、脯氨酸;极性不带电氨基酸:天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸;极性带电氨基酸:天冬氨酸、谷氨酸、赖氨酸、精氨酸、组氨酸。
4. 按氨基酸是否能在人体内合成分:必需氨基酸:指人体内不能合成的氨基酸,必须从食物中摄取,有八种:赖氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、笨丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苏氨酸。
非必需氨基酸:指人体内可以合成的氨基酸。
有十种。
半必需氨基酸:指人体内可以合成但合成量不能满足人体需要(特别是婴幼儿时期)的氨基酸,有两种:组氨酸、精氨酸。
三、稀有氨基酸:参加天然蛋白质分子组成的氨基酸,除了上述20 种有遗传密码的基本氨基酸之外,在少数蛋白质分子中还有一些不常见的氨基酸,称为稀有氨基酸。
它们都是在蛋白质分子合成之后,由相应的常见氨基酸分子经酶促化学修饰而成的衍生物。
生物化学氨基酸和多肽
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氨基酸的酸碱性质
氨基酸的酸碱性质
结论:
❖净电荷为0时的pH值即为氨基酸的等电点,对 侧链不含解离基团的中性氨基酸: pI = (pK1’+pK2’)/2
氨基酸的酸碱性质
酸性氨基酸:谷氨酸的滴定曲线pI=(pK1’+pKR’ )/2
pK1’
pKR’
pK2’
氨基酸的酸碱性质
碱性氨基酸: 组氨酸的滴定曲线 pI=(pKR’+pK2’)/2
❖ 作为蛋白质结构单元的氨基酸均为L--氨基酸 (以D-甘油醛为参考物),某些蛋白质还含有若 干种不常见的氨基酸,它们都有是基本氨基酸的 衍生物。
氨基酸的结构和分类
3.2.1 氨基酸的结构和分类
除脯氨酸外,蛋白质氨基酸在结构上的共 同点是与羧基相邻的-碳上都有一个氨基,因 此称为 -氨基酸, 结构通式:
➢ 氨基酸 ➢ 多肽 ➢ 蛋白质 ➢ 蛋白质的结构 ➢ 多肽的化学合成
蛋白质功能的多样性
蛋白质是最重要的一类生物大分子, 存在于所有 的生物细胞中,是构成生物体最基本的结构物质和功 能物质, 参与了几乎所有的生命过程:催化作用、 生物调节、物质转运、免疫作用、运动、结构成分、 贮存等。
(1)催化 作为生物体新陈代谢的催化剂—酶,酶 是蛋白质中最大的一类,酶的催化效率远大于合成 的催化剂。酶催化的反应速率为非催化速率的1016 倍。
氨基酸的化学性质
(1) 与甲醛发生羟甲基化反应
COO-
COO-
CH2 pK2' CH2 + H+
NH3+
NH2
HCHO
COO- HCHO COO-
CH2
CH2
NHCH2OH
N(CH2OH)2
氨基酸与多肽的合成
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氨基酸的合成主要发生在细胞质中,而多肽的合成则主要发生在细胞核中。
氨基酸是构成多 肽的基本单位
多肽的合成需要 氨基酸的参与
氨基酸与多肽的 合成相互影响, 共同促进
氨基酸与多肽的 合成在生物体内 具有重要的生理 功能
氨基酸是构成多肽的基本单位 多肽的合成需要氨基酸作为原料 氨基酸的种类和数量决定了多肽的性质和功能 多肽的合成过程会影响氨基酸的消耗和利用
生物多样性的影响:氨基酸与多肽的合成多样性影响着生物体的结构和功能,以及生态 系统的稳定性和适应性
氨基酸是构成蛋白质的基本单位,对生物体的生长、发育和繁殖至关重要。
多肽是氨基酸通过肽键连接形成的链状结构,具有多种生物学功能,如酶、 激素、受体等。
氨基酸与多肽的合成对于生物体的适应性具有重要意义,如抵抗环境变化、 调节生理功能等。
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非必需氨基酸:人体可以自行合成,无需从食物中摄取 必需氨基酸:人体无法自行合成,必须从食物中摄取 半必需氨基酸:在某些情况下,人体需要从食物中摄取 氨基酸的合成方法:化学合成、生物合成、酶催化合成等
生物合成法:利用生物体中 的酶催化合成氨基酸
氨基酸与多肽是 生命的基础物质
氨基酸与多肽的 合成是生物进化 的重要环节
氨基酸与多肽的 合成促进了生物 多样性的形成
氨基酸与多肽的 合成与生物适应 性有关
氨基酸的多样性:20种常见氨基酸,每种都有其独特的结构和功能
多肽的多样性:由不同氨基酸组成的多肽具有不同的结构和功能
氨基酸与多肽的合成:通过转录和翻译过程,形成具有生物活性的多肽
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带电荷
据酸碱性质 分类
带正电荷(3种) 带负电荷(2种)
中性AA(一氨基一羧基) 碱性AA(二氨基一羧基) Lys、His、Arg 酸性AA (一氨基二羧基 )Glu、Asp
人体必需氨基酸
据营养 学分类
必需AA 非必需AA
Met Trp Lys Val Ile Leu Phe Thr 假 设 来 写 一 两 本 书
一、氨基酸的结构
氨基酸的结构通式
COO H3N
或
COOH H 2N C R
α
+
C R
α
H
H
氨基酸是含有氨基的羧酸,不同氨基酸的R基不同, (除脯氨酸、甘氨酸外)都为L-α-氨基酸。
什么是α-氨基酸?
----C-C-C-C-COOH γ β α ----C-C-C-C(NH2)-COOH ----C-C-C (NH2)- C - COOH α-氨基酸 β-氨基酸
(二)、氨基酸的分析
1. 纸色谱
原理:组成层析系统的固定相和流动相具有相反的极性。 被分析的样品(如aa混合物)中的各组分依据其自身极性 的强弱,与此两相的亲和力不同。与固定相亲和力大者, 易留滞于原地,与流动相亲和力大者,易随流动相移动, 因而达到分离的目的。纸层析中的固定相为滤纸上的结 合水(极性),流动相为展层液(非极性有机溶剂)
生理功能
(1) L-α-氨基酸衍生物 L-瓜氨酸和L-鸟氨酸是合成精氨酸的中间产物 (2) D-α-氨基酸 D-丙氨酸存在于肽聚糖中,D-Phe是短杆菌肽S的组分 (3) β、γ、δ-氨基酸 β-丙氨酸是泛酸的前体,γ-氨基丁酸是传递神经冲动的 化学介质
三、氨基酸的性质
(一) 氨基酸的构型和紫外光吸收
----C-C (NH2)- C- C - COOH
γ-氨基酸
除脯氨酸外,其他均具有如下结构通式
COOH H2N C R
-氨基酸
不变部分
H
可变部分
COO
+
CH 3 R H
H
C
NH3
甘氨酸 丙氨酸 L-氨基酸的通式
除了甘氨酸外,其他均具有不对称碳原子,具有旋光性
二、基本氨基酸的分类
据R基团 化学结构 分类 据R基团 极性分类 极性R基团AA 脂肪族AA(16种) 芳香族AA (Phe、Tyr、Trp) 杂环AA (His、Pro) 非极性R基团AA 不带电荷
R CH COOH + + +H NH3
+OH+OH R CH COOR CH COO-
(pK´1)
NH3
+
+H+
(pK´2)
NH2
pH<pI
带电荷为正
完全质子化
pH=pI
带电荷为零
兼性离子
pH>pI
带电荷为负
完全去质子化
氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处溶液的酸碱度
等电点 (isoelectric point, pI)
3. 与苯异硫氰酸酯(PITC)的反应
H
N C S
O CH C R1 R2
H
O NH CH C
H N
H N C S: O R2
N C O
O NH CH C
N C
S
O CH C R2
HN CH C R1
NH2 NH C O CH
R1
C NH CH R1
S
用于N末端分析,由Edman于1950年首先提出,又称Edman试剂
② 丹磺酰氯法 (DNS法 ) 4. 与丹酰氯 (DNS-Cl) 的反应
丹磺酰-氨 基酸有很强 的荧光性质
a-氨基与a-羧基共同参加的反应-茚三酮反应:
脯氨酸产生黄色物质,其它为蓝紫色。在570nm(蓝紫色) 或440nm(黄色)定量测定(0.5-50μg/ml)
用途:常用于氨基酸的定性或定量分析
4. 侧链含有羧基或酰胺基(4种)
天冬氨酸 (Asp, D)
谷氨酸 (Glu, E)
天冬酰胺 (Asn, N)
谷氨酰胺 (Gln, Q)
5. 侧链含有碱性基团(3种)
组氨酸 赖氨酸 精氨酸 (His, H)
(Lys, K)
(Arg, R)
芳香族氨基酸
苯丙氨酸
酪氨酸
色氨酸
(Phe, F)
(Tyr, Y)
侧链基团参加的反应
半胱氨酸的氧化反应
-OOC-CH-CH
+NH 3 2-SH
+
HS-CH2-CH-COO+NH 3
-HH
-OOC-CH-CH
+NH 3
-S S-CH -CH-COO 2 2
+NH 3
胱氨酸
五、氨基酸的分离与分析
(一) 氨基酸的分离
1. 溶解度或等电点法
利用溶解度不同,将不同的氨基酸分开 各种氨基酸在等电点时,溶解度最小这一性质,可 以通过调节氨基酸溶液的pH值 ,将不同的氨基酸分开
自然界中组成蛋白质的氨基酸都是L-型 (Gly除外)
R H
紫外光吸收:
组成蛋白质的氨基酸中, Trp、Tyr和 Phe对紫外光有一定 的吸收,因为分子中含有苯环, 这三个氨基酸的光吸收都在280 nm附近。可以采用紫外分光光 度计在280 nm波长处测定最大 吸收来测定蛋白质的含量
(二)氨基酸的两性解离及等电点
第一章 氨基酸与多肽化学
本章内容
第一节 第二节 氨基酸 多肽
第一节 氨基酸
氨基酸是蛋白质水解的最终产物,是组成蛋
白质的基本单位(构件分子)。从各种生物体内
发现的氨基酸已有180多种,但参与蛋白质组成的
常见氨基酸只有20种,这20种氨基酸称为常见氨 基酸或基本氨基酸
amino acid, aa 或 AA
Ca
的肽键平面可以作
相对旋转
一个具有生物活性的蛋白质多肽链在一定条件下往往只 有一种或很少的几种构象。主要是因为肽链结构的高度 共振稳定性
二、多肽的性质—类似于氨基酸性质
(一) 旋光性 (二) 两性解离及等电点 (三) 化学反应
双缩脲反应:含有两个或两个以上肽键的化合物与碱性 硫酸铜作用,生成蓝紫色的复合物,肽键越多颜色越深, 受蛋白质特异性影响小,可用于肽和蛋白质定量测定及 测定蛋白质水解程度
pK1+pK2 pI = ———— 2
pK2+pK3 或( pI = ————) 2
氨 基 酸 的 酸 碱 滴 定
酸性氨基酸,以Asp为例:
碱性氨基酸,以Lys为例:
五、氨基酸的特征化学反应
氨基酸的化学反应主要是指它的α-氨基和α-羧基以及侧 链上的功能团所参与的那些反应 成盐成酯反应 成酰氯反应 脱羧基反应 叠氮反应
O C N H
Gln H C COO
-
C CH2 OH
N- 端
CH2 C- 端 CH2 CONH2 COOH
CH3 CH3 肽键 OH
CO 2H
多肽链有两端 N 末端:多肽链中有自由氨基的一端 C 末端:多肽链中有自由羧基的一端 氨基酸的顺序是N 端→C 端的排列顺序。如上述五肽可表示为: Ser-Val-Tyr-Asp-Gly 丝氨酰缬氨酰酪氨酰天冬氨酰谷氨酸
单向纸色谱
迁移率:Rf
双向纸色谱
2. 薄层色谱
主要用于氨基酸的定性 鉴定
由于分离程度与各氨基 酸显色的不同,区别不 同氨基酸
3. 高效液相色谱
能够迅速简便分析微量样品,高精度,高再现性
4.离子交换色谱
原理:在一定的pH条件下,不同氨基酸,由于pI不同所 带的净电荷不同,与离子交换树脂结合的能力也不同。 洗脱过程中将依次被从柱上洗出。洗脱之后的氨基酸通 过与一定的显色剂反应实现定量分析
HO N H COOH
H2NCH2CHCH2CH2CHCOOH OH NH2
5- 羟基赖氨酸 I CH3NHCH2CHCH2CH2CHCOOH HO CH2CHCOOH NH2 NH2 I 6-N- 甲基赖氨酸 3,5- 二碘酪氨酸
4- 羟基脯氨酸
非蛋白质氨基酸:存在于生物体内,但不组成蛋白质 的呈游离或结合态的氨基酸,约150种,具有多种
(一)肽键
O NH2-CH-C H
甘氨酸
+
OH
O NH-CH-C H H
甘氨酸
OH
-HOH
O O NH2-CH-C-N-CH-C H
肽键
HH
OH
甘氨酰甘氨酸 甘氨酰甘氨酸
(二)肽链
Ser H H3N
+
O C N H
Val H C CH
O C N H
T yr H C CH2
O C N H
Asp H C CH2
– 在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势 及程度相等,成为兼性离子,呈电中性,在电场中既不向 阳极也不向阴极移动。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等 电点
– 氨基酸在等电点时的特点:
1. 净电荷数等于零,在电场中不移动; 2. 此时氨基酸的溶解度最小
氨基酸等电点的确定:
根据pK值(该基团在此pH一半解离)计算: 等电点等于两性离子两侧pK值的算术平均数
5.氨基酸自动分析仪
原理:在离子交换色谱基础上发展起来。一般氨基酸分
析仪用的是强酸性阳离子交换树脂
六、氨基酸的一般生产方法
(一) 水解法
1. 酸水解法
采用6-10M盐酸,110-120℃,12-24h
2. 碱水解法
采用4-6M氢氧化钠或2-4M氢氧化钡,100-110℃,6-24h
3. 酶水解法
NADP+
GSH还原酶
2H2O
GSSG