动物组织基因组DNA的提取
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实验一动物组织基因组DNA的提取
一、实验目的
掌握从动物组织中提取总DNA的方法。
二、实验原理
DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,为了进行测序、杂交、基因表达、文库构建等实验,获得高分子量和高纯度的基因组DNA 是非常重要的前提,因此基因组DNA的提取也是分子生物学试验技术中最重要、最基本的操作之一。
染色体存在于细胞核中,外有核膜及胞膜。从组织中提取DNA必须先将组织分散成单个细胞,然后破碎胞膜及核膜,使染色体释放出来,同时去除与DNA结合的组蛋白及非组蛋白。
整个实验可分为细胞裂解、DNA分离与纯化和DNA的洗脱收集。1.细胞裂解:酶法(蛋白酶K)。2. DNA分离与纯化:细胞破碎后,常使用吸附材料结合方法去除杂质和纯化DNA,主要有硅基质材料、阴离子交换树脂和磁珠等。本实验采用TIANGEN血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒中的硅基质材料的离心吸附柱。硅基质材料吸附核酸的原理,主要利用DNA在高盐低pH值环境下与硅基质材料相结合,在低盐高pH值环境下与硅基质材料脱离的特征,高效、专一吸附DNA,可最大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。
三、材料、试剂和设备
1.材料:动物组织
2.试剂:TIANGEN血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒,无水乙醇等
3.设备:离心机,微量移液器等
四、实验步骤
1.处理材料:取动物组织10mg,尽量切碎,加200μl缓冲液GA,振荡至彻底悬浮。
2.加入20μl蛋白酶K溶液,混匀后56℃水浴,直至组织溶解(不同组织裂解时间不同,
通常需1-3小时即可完成)。简短离心以去除管盖内壁的水珠,再进行下一步骤。(细胞裂解)
3.加入200μl缓冲液GB,充分颠倒混匀,70℃放置10分钟,溶液应变清亮,简短离心以
去除管盖内壁水珠。(溶解DNA)
注意:加入缓冲液GB时可能会产生白色沉淀,一般70℃放置时会消失,不会影响后续实验。如溶液未变清亮,说明细胞裂解不彻底,可能导致提取DNA量少和提取出的DNA 不纯。
4.加入200μl无水乙醇,充分振荡混匀15s,此时可能出现絮状沉淀,简短离心以去除管
盖内壁的水珠。(沉淀DNA)
5.将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中,吸附柱放入收集管中,
12,000rpm(~13,400×g)离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。(吸附沉淀)
6.向吸附柱CB3中加入500μl缓冲液GD (使用前先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm
(~13,400×g)离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
7.向吸附柱CB3中加入700μl漂洗液PW (使用前先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm
(~13,400×g)离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
8.向吸附柱CB3中加入500μl漂洗液PW,12,000rpm(~13,400×g)离心30s,倒掉废液。
(6、7、8为漂洗)
9.将吸附柱CB3放回收集管中,12,000rpm(~13,400×g)离心2min,倒掉废液。将吸附
柱CB3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,漂洗液中乙醇的残留会影响后续的PCR等实验。
10.将吸附柱CB3转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50-200μl洗脱
缓冲液TE,室温放置2-5min,12,000rpm(~13,400×g)离心2min,将溶液收集到离心管中。(溶解洗脱DNA)
注意:采用硅基质膜吸附的DNA,可将DNA在低盐高pH值条件下洗脱下来。pH值在
7.0-8.5之间洗脱效率较高,pH值低于7.0则洗脱效率很低。
洗脱缓冲液体积不应该少于50μl,体积过小影响回收效率。为增加基因组DNA的得率,可将离心得到的溶液再加入吸附柱CB3中,室温放置2min,12,000rpm(~13,400×g)离心2min。
DNA产物应保存在-20℃,以防止DNA降解。