crystalmaker 教程
Crystal软件说明
软件介绍CrystalMaker：晶体和分子结构可视化软件探索晶体世界从金属到沸石，苯到蛋白质, CrystalMaker是了解晶体和分子结构的最简单方法。
什么是CrystalMaker?CrystalMaker软件是一款在创建、显示和操作各种晶体分子结构中屡获好评的软件。
CrystalMaker在生产力方面提供了一个流线型的工作流程，您只需把您的数据文件拖拉到程序中便可即时显示照片般逼真的色彩。
用鼠标就可以实时操作晶体结构。
多视角"bookmarks"和撤销次数鼓励您探索和发现——理想的教学和科研软件。
快速创建晶体和分子结构！使用CrystalMaker软件，您可以轻松快速创建任何晶体或分子结构。
内置的对称处理和美观的空间群浏览器可得到晶体的日志，并且该程序会自动生成所有的键和多面体。
CrystalMaker 提供了广泛的模式类型，包括传统的“ball-and-stick”, space-filling, polyhedral, wireframe 以及thermal ellipsoids模式。
使用photo-realistic simpler和line-art display选项，每种模式类型都可以被广泛地定制。
综合数据的输入和输出负载来自于超过15+ 格式的结构数据，包括Cambridge Structures Database, Protein Data Bank, CIF, GSAS, SHELX等。
您可以操作几乎无限的原子数量。
使用独特的"Depth Profiling"工具，快速扫描大规模结构中有用的，从而能从计算机模式中得到理想的特征结果。
大量的输出选项使您能跟其他程序共享数据、保存结构数据、键长、协调环境，甚至用您的数据创建网页。
出色的3D图片深度渐变和视角转换，加上优美的三维立体结构，使您能看到照片质量的图片。
高分辨率打印并把图片保存成各种文件格式，同时您还可以定义图片的大小。
CrystalMaker导出作图数据
CrystalMaker导出作图数据
1 File-New Crystal—选择所要用的空间结构和晶格系数—Transform—diffraction Patter---Powder画出图谱
2 File-export –export selected profiles(注意：导出的数据只是页面范围内的，如果图过大有可能导出数据不全)如图1—channel interval 选择步宽（图二），步宽越小做出的图谱越平滑，在本实验室XRD测试时步宽是0.02，所以可以选小一点例如0.01或0.005.---OK—直接保存
图一
图二
3 导出的数据先用Excel打开，并把文本形式转换成浮点形式右击----单元格式---数值
4 在KaleidGraph里读取数据进行画图（直接粘贴进去的数据无法作图，最好从File里读入）---space—Functions—stantistics里找出最大值，让B列整体除以Max进行归一化，然后放在C列，并在C列标出除的数值，这样做的原因是既可以保持原始数据，有可以一下看出所做的操作，方便以后查看。
如何用Diamond构建Polyhedral图
关于如何构建晶体结构，我们前期介绍了CrystalMaker这款软件。
下面几期内容我们将介绍另外一款常用的晶体结构软件“ Diamond ”。
本期内容将介绍如何用Diamond构建立体多边形结构（本期内容来自广州大学汤政斌同学的投稿，在此表示感谢）。
1. 导入晶胞：①把cif文件拖入diamond即可；或者open a file（直接打开）②打开后，弹出以下窗口，点击下一步，即可。
③继续点击下一步。
④当弹出picture design设置窗口时，建议把background颜色选白色（个人爱好）。
⑤按下一步，再按完成，即出现下图。
2. 添加与修饰多面体①点击工具栏的Build,选择Polyhedra——Add Polyhedra（添加多面体）。
②选择中心原子与对应配位原子，构成多面体。
(首先Al和O配位) 然后，点击Design。
③ a. 弹出polyhedra design 设置窗口（颜色选了turquoise，透明度调至0.6），然后点击Material。
b. 弹出Material settings 窗口如下图（Blue 调至0.3）个人觉得此处可以把多面体调亮一点，更有光泽。
c. 总体设置如下图。
d. 设置完上述步骤，即可点击Apply now。
e. Al 和O 配位的效果图如下。
④重复步骤二的① - ③，建立Lu和O的配位的多面体结构（红色、透明度：0.8；material setting——Red:0.50）。
即可得到如下效果图。
⑤添加骨架，点击工具栏的picture——Polyhedral Designs——把勾去掉添加骨架后的效果图⑥设置Al和Lu原子的颜色：工具栏——picture——atom design效果图3. ①选择其中一个Lu原子点击鼠标右键——copy②点击工具栏的Edit——Copy To New PictureCopy to new picture 后的效果图如下：③选中整个多面体结构，点击工具栏Build——Connect Atoms效果图④选中整个多面体，对着骨架右键，点击Add——Bond Labels弹出设置窗口如下图效果图如下⑤ a.为中心原子添加标签，右键中心原子，Add——Atoms Labelsb. 点击工具栏Picture ——Atoms Designs（设置中心原子颜色）效果图⑥ a.选择随便其中一个原子，右键——copy；再点击工具栏Edit——copy to new picture，得到新的图如下，把所有氧原子选中（按着Ctrl键，点击鼠标左键），再点击右键——destroy ——atoms.b. 对球体进行颜色编辑4. 导出图片。
水晶球软件初级教程
水晶球软件２０００专业版（ＣｒｙｓｔａｌＢａｌｌ２０００ＰｒｏｆｅｓｓｉｏｎａｌＥｄｉｔｉｏｎ）初级教程摘要加载在微软公司（Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ）的电子表格软件（Ｅｘｃｅｌ）上的水晶球软件２０００专业版（ＣｒｙｓｔａｌＢａｌｌ２０００ＰｒｏｆｅｓｓｉｏｎａｌＥｄｉｔｉｏｎ）是一个易于使用的软件。
它可以帮助你分析与你的电子表格模型相关的风险和不确定性。
这个软件包括蒙特卡洛模拟（水晶球）、时间序列预测（水晶球预言家）、最优选择（优化查询）和用来构造定制界面和程序的开发工具箱。
由于电子表格缺乏设计和分析可选方案的能力，所以仅用电子表格来估算一个事件发生的概率是不合适的。
而加载了水晶球软件的电子表格模型就能具备这样的功能，从而帮助用户洞察模型运行和结果产生的机制。
本初级教程通过一个媒体产业的实例来演示蒙特卡洛模拟和时间序列预测工具如何用于一个电子表格模型，为商业决策的内在风险提供更深入的了解和度量。
１序言１．１电子表格模型和风险分析风险就是不确定性，是指发生损失、危害和其它不愉快事件的可能性。
大多数人偏好低风险，期待成功、收益或其它形式获利的较高概率。
举例来说，如果下个月的销售超过一定数额（一种令人愉快的事件），那么这些订单会使存货减少，从而导致商品运送的延迟（一种令人不愉快的事件）。
反过来，商品运送的延迟则会导致订单的流失。
发生这种情况的可能性就代表了一种风险。
当使用电子表格模型时，分析家习惯将那些本来不确定的变量用其平均值或其最佳估计值来输入。
这是因为电子表格软件只允许他们在一个单元格内输入一个数值或一个公式。
这些确定的模型只能产生一个结果。
而模型结果将被用作商业或技术决策的根据。
为了把握模型中本身存在的那些不确定性，分析家只能通过手工方式来改变模型变量，分析它们对关键结果的影响，来简单地实现方案分析。
这种方法提供了可能结果的一定范围，但它无法使人得知那些特定结果出现的可能性。
管理者经常需要知道那些不确定变量分别取什么值的时候，方案会达到一个最佳情况；或在什么时候，方案会达到一个最差情况；又在什么时候，方案又会达到一个最可能情况。
CrystalMaker使用说明
第一章界面介绍第二章本章详细介绍了Crystalmaker的操作界面，便于用户选择操作命令和保存文件。
本章所有的图片都是在Mac OS X “Peopard”上获得的。
菜单介绍Crystalmaker (Mac version) 记录、应用文件，隐藏或退出程序File打开、创建、保存和关闭文件。
输出相关的文本和图片Edit编辑文本、结构和化学键；拷贝图片到剪切板，或者取消上步操作Selection选择原子相关的操作，例如标注、显示、隐藏原子Model选择结构模型显示的形式Rendering对模型的显示进行不同的设置Transform旋转、测量图片命令。
可以测量化学键角度，或者产生粉末/单晶衍射花样Window对Crystalmaker操作界面进行设置Help提供在线帮助和用户手册图片界面结构在图片界面中显示。
选择Window > Show Ruler可以添加标尺。
图片面板结构主要在图片面板中显示，在这里可以对结构进行旋转和测量操作，或者使用快捷键对其进行操作。
工具栏工具栏是对工具板的很好补充。
对于常用的命令还设置了快捷键。
打开或关闭工具栏：选择Winsow > Show/Hide ToolbarSidebar包括Site Browser和Notes pane打开/隐藏Sidebar的两种方法：(1) 点击Toolbar上的Sidebar;(2) 选择Window > Show/Hide Sidebar隐藏Notes pane的三种方法：(1) 点击Toolbar上的Notes pane来显示/隐藏Notes pane；(2) 双击Sidebrowser和Notes pane之间的分隔栏；(3) 把Sidebrowser和Notes pane之间的分隔栏拖动到最下面隐藏Site Browser的方法：(1) 把Sidebrowser和Notes pane之间的分隔栏拖动到最上面；Site BrowserSite Browser提供关于结构中原子的信息。
crystal maker 教程
crystal maker 教程crystalmaker教程第一章界面介绍本章详尽了解了crystalmaker的操作界面，易于用户挑选操作命令和留存文件。
本章所有的图片都就是在macosx10.5“peopard”上赢得的。
菜单介绍crystalmaker(macversion)记录、应用领域文件，暗藏或退出程序file关上、建立、留存和停用文件。
输入有关的文本和图片edit编辑文本、结构和化学键；拷贝图片到剪切板，或者取消上步操作selection选择原子相关的操作，例如标注、显示、隐藏原子model选择结构模型显示的形式rendering对模型的表明展开相同的设置transform旋转、测量图片命令。
可以测量化学键角度，或者产生粉末/单晶衍射花样window对crystalmaker操作界面进行设置help提供在线帮助和用户手册图片界面结构在图片界面中显示。
选择window>showruler可以添加标尺。
图片面板结构主要在图片面板中显示，在这里可以对结构进行旋转和测量操作，或者使用快捷键对其进行操作。
工具栏工具栏是对工具板的很好补充。
对于常用的命令还设置了快捷键。
关上或停用工具栏：选择winsow>show/hidetoolbarsidebar包含sitebrowser和notespane关上/暗藏sidebar的两种方法：(1)页面toolbar上的sidebar;(2)选择window>show/hidesidebar暗藏notespane的三种方法：(1)点击toolbar上的notespane来显示/隐藏notespane；(2)双击sidebrowser和notespane之间的分隔栏；(3)把sidebrowser和notespane之间的隔开栏拖曳至最下面隐藏sitebrowser的方法：(1)把sidebrowser和notespane之间的隔开栏拖曳至最上面；sitebrowsersitebrowser提供更多关于结构中原子的信息。
crystal maker使用教程
CrystalMaker绘制晶体结构教程1.先打开CrystalMaker并创建晶体，过程是file——New Crystal，在弹出的窗口中，有一些项目需要填写。
因为是自动生成晶体的，所以你先得告诉计算机绘制晶体所需要的参数。
在这里从上到下依次要填写的是空间群、晶胞参数和原子坐标。
2.所以我们先到晶体数据库Findit中进行查询。
因为我用的Findit是09年试用非破解版的，所以我先把系统时间调到09年再打开它。
这里我们要绘制的晶体是尖晶石型的ZnCo2O4，在选择好左下的筛选方式后，分别点击Zn、Co、O，然后Search。
3.在结果中我们看到没有我们要的整数比的物质，但是明显这里只是部分Co代替了Zn的位置，因此原子坐标和空间群并没有改变，只是晶胞参数不能使用。
这里空间群是fd3m。
4.回到CrystalMaker，点Browse手动添加空间群。
5.输入晶胞参数，由于空间群已经选定了，所以软件只会让你填你能填的部分。
6.继续在Findit里面找到原子坐标。
在这里SOF是原子占位率，意思就是出现在该位置的原子的比率，显然这里Co和Zn有重叠，但我们画的是完美晶体，所以我们Zn取占位率0.79，而Co取0.9的那个。
7.用add添加项，把所有原子都输入进去，然后点ok。
8.结果是这个样子。
9.不好看就把原子半径调一下。
10.然后我们要告诉软件原子之间是怎么作用的，点Edit——Bonding，并用add添加项，改成Co-O键和Zn-O键。
11.键长请查手册，但是这里我们只是画图，所以可以随便指定，只要满足配位关系就可以了。
这里Co应该6配位，Zn应该4配位，把Info勾上，满足了配位关系，点ok。
12.键被加上去了。
13.但是这是球棍图，我们要的结果是立方体堆积的，所以点Model——Polyhedrel。
这样键就消失了。
14.然后把Co和Zn的模型改成半透明的立方块。
点apply确认。
15.之后是这个样子。
电子显微学进展教学大纲北京科技大学
2010-2011学年电子显微学进展教学大纲课程编号: M031037 中文名称: 电子显微学进展英文名称:一. 总学时: 27面授学时:其它学时:二.学分: 1.5三. 先修课程:电子显微学四. 教学目的:材料科学的中心概念是制备－结构－性能的相互关系，要对材料进行有效的设计和性能优化，在纳米和原子尺度的结构研究是必不可少的。
而电子显微学作为最有效的结构研究方法之一，一直是材料研究的重要组成部分。
国际上，以美国国家电镜中心为代表，先进电子显微学主要在两个方向迅速发展并获得广泛的应用。
一是由于球差校正器的突破性进展，电镜的空间分辨率快速提高，进入亚埃分辨率的阶段。
二是由于能量单色器和高分辨能量过滤器的使用，电子能量损失谱的能量分辨率也越来越高，目前已接近0.1 eV，堪与大型科学装置同步辐射媲美。
高能量分辨率结合高空间分辨率，使先进电子显微镜成为研究物质的原子和电子结构，以及材料物理行为的强有力的工具。
本课程从衍射、成像、谱学三方面帮助学生更好地理解透射电子显微学理论与实际材料应用的相互关系：透射电子显微镜充分利用电子束与材料的相互作用发出的各种信号，包括弹性与非弹性散射电子，实空间与倒空间分布，给出关于材料结构的全面的信息。
了解目前先进电子显微学特别是在高空间高能量分辨的原子结构及电子结构方面的发展状况以及其在材料科学中的应用。
激发学生的学习热情，培养学生对电子显微学研究的兴趣；引导学生了解材料领域微结构研究可进行哪些方面的工作，为学生今后研究工作的开展提供先期准备。
五. 考核方式：（请注明各种类型所占比例）平时成绩：30％。
其中课后作业25％；课堂点名5％课程总结报告：70％六. 课程主要内容：（请注明学时分配）1.电子显微学概述（2学时）：介绍电子显微镜主要是透射电子显微镜及电子显微学发展历史；简单回顾本课程将涉及到的电子光学内容。
透射电子显微镜充分利用电子束与材料的相互作用发出的各种信号，包括弹性与非弹性散射电子，实空间与倒空间分布，给出关于材料结构的全面的信息。
PROEprotoolmaker
ProfileMaker教程
ProfileMaker教程一：校正显示器ProfileMaker pro软件组有四个基本软件模块，分别是生成icc文件的ProfileMaker、观察编辑修改icc 文件的ProfileEditor、测量和计算平均icc的MeasureTool、查看各种实际颜色的ColorPicker。
其中，ProfileMaker软件在生成设备icc文件的时候，如果选择测量仪器（如分光光度仪），会启动MeasureTool的测量功能，我们就从ProfileMaker中直接启动显示器校正功能及icc文件生成。
显示器开启半小时以上，并关闭周围强烈的光线，最好使用显示器遮光罩，并关闭系统电源管理，关闭屏幕保护程序。
启动ProfileMaker软件后，选择MONITOR显示器，如图：选择你使用的显示器类型，纯平的CRT或液晶的LCD，如图：选择你的测量设备，支持eye－one、spectrolino、monitor optimizer，如图：这里使用是eye－one pro，它要求将测量仪放在它的机座的标准白点上，校准仪器的标准白，如图：选择确定，软件会提示你是不是执行显示器测量（会启动MeasureTool的显示器测量功能），如图：选择是，启动显示器测量功能，如图：首先，设定白点，白点有很多色温选项，如图：一般来说，会选择5000K或6500K，我国规定印刷标准使用光源是6500K，但国际使用标准是5000K，现在很多印厂都使用的是5000K，这里选择多少K，要根据实际印刷看稿光源来决定。
印刷和摄影推荐5000K 或6500K，网页推荐6500K。
如果要达到彻底模拟某一印刷品效果，也可以选择设定纸白，输入测量好的纸张白点XYZ值（不推荐常规校正这样做，因为纸白会因纸张品种品牌和生产日期不同有很大的差别）。
之后是设定GAMMA值，印刷推荐1.8，网页设计等推荐2.2。
（注：这里不是pc使用2.2或MAC使用1.8）如图：亮度推荐100％。
crystalmaker晶体软件教程
本节我们介绍如何创建、显示和保存一个新的晶体结构。我们将以和其他无机物结构类似MgAl2O4为例。
结构数据
在Crystalmaker中，可以使用数据编辑器来编辑晶体常数、对称性以及位置坐标。同时还可以编辑颜色、原子半径，定义化学键等。
使用以下结构数据：
输入结构数据
(1)选择File > New Crystal命令；
同时在Site Browser中，可以对原子的颜色、可见度、标注以及半径进行编辑，并对单个位置或者同元素的原子簇进行编辑。
Notes pane
在Notes pane中，可以保存关于结构的文本信息
Overview Window
Overview Window提供关于复杂结构的动画和视频制作、文件浏览以及结构输出的具体细节等信息，由Views, History, file和Log四部分构成。
添加文件到Files Pane：
(1)把一个或多个文件拖动到Files Pane中；
(2)或者点击Overview上的Add按钮，然后选择想要加载的文件。
把文件从Files Pane移除：
(1)右键点击文件缩略图，选择Remove命令；
(2)点击window’s Actions按钮，选择Clear Files List，移除所有文件。
(1)选择Edit > Bonding命令，出现Edit Bonding对话框：
(2)点击Add按钮，创建新的默认值的化学键。现在，我们来编辑这些数值。
(3)我们选择Al-O键，在From菜单中选择Al，在To菜单中选择O。
我们可以输入Al-O键的最小和最大健长，但是我们会要求程序在已知原子数据的基础上，选择合理的数值。
晶品科技雕刻机使用教程
晶品科技雕刻机使用教程
晶品科技雕刻机使用教程
简介
•晶品科技雕刻机是一款高精度的雕刻工具，适用于各种材料的刻画和切割。
•本教程将详细介绍晶品科技雕刻机的使用方法和操作步骤。
准备工作
•确保雕刻机的电源已连接并通电。
•检查雕刻刀具和工作台是否安装正确。
•确保材料已准备好，放置在工作台上。
步骤
1.打开雕刻软件
–在电脑上打开晶品科技雕刻机的软件，等待软件加载完成。
2.导入设计文件
–点击软件界面的”导入”按钮，选择要刻画或切割的设计文件，并点击”确定”。
3.调整刻画或切割参数
–在软件界面中，根据需要调整刻画或切割的参数，如速度、力度和深度等。
4.定位材料
–在软件界面中，点击”定位”按钮，确保雕刻机准确定位到材料的起始位置。
5.运行雕刻机
–点击软件界面的”开始”按钮，雕刻机将开始按照设定的参数进行刻画或切割。
6.监控雕刻过程
–在雕刻过程中，时刻观察雕刻机的运行状态，确保正常进行，如有异常情况及时停止。
7.完成雕刻
–当雕刻或切割完成后，点击软件界面的”停止”按钮，雕刻机将停止运行。
8.清理工作台
–将已完成的雕刻作品取下，并清理工作台上的材料残留物。
注意事项
•在操作过程中，注意安全，避免手部接近雕刻刀具。
•如遇到雕刻刀具损坏或异常情况，立即停止使用并联系相关人员进行维修。
•在清理工作台时，使用安全手套以免受伤。
以上是晶品科技雕刻机的使用教程，希望能对您有所帮助！。
MaterialsStudio绘制尖晶石晶胞教程
Materials Studio 绘制尖晶石(spinel/MgAI 2O 4)晶胞教程1.打开MS ,新建工作区，文件名需英文。
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可视化经典晶体软件crystalmaker10.2安装讲解教程（改）
可视化经典晶体软件crystalmaker10.2安装讲解教程（改）注：下载⽅式见⽂末，另本软件仅可⽤于交流学习使⽤，不得⽤于任何商业⽬的！另外，⽬前微信公众号推荐机制改版，为防⽌与⼤家失联，建议⼤家对公众号添加星标（右上⾓，“...”标记，选择设为星标），也建议⼤家看完⽂章后多点击⼀下右下⾓的 “在看”，感谢⼤家的⽀持！▼ 正⽂讲解 ▼准备⼯作1. 电脑默认开启的杀毒软件、360安全卫⼠和电脑管家等的⼀律先统统关闭，防⽌杀毒软件误报隔离了某些渲染器必备的⽂件。
2.“控制⾯板”-“⽹络和Internet”-“Internet 选项”-“⾼级”，将“检查服务器证书是否已吊销”的勾选去掉。
安装过程1. 下载软件包解压，双击“CrystalMaker v10.2.2.msi”程序安装软件，选择I accept接受协议，点击install开始安装软件；等待安装，点击Finish安装完成。
2. 安装完成，双击桌⾯快捷⽅式运⾏软件，点击help-Unlock进⼊激活页⾯；双击运⾏注册机软件“Keygen.exe”得到序列号；在激活⾯板内随意输⼊姓名，单位，及序列码，点击OK，即可破解；出现的界⾯点击“accept”接受协议；点击register later，此时则已经激活进⼊软件，查看“help-About CrystalMaker”，发现此时软件已经激活，可以正常使⽤（可以检查下软件是否可以导出dae格式⽂件）。
下载⽅式公众号后台输⼊“CrystalMaker”即可获得本教程及相应下载！精选回顾◀常见球体及衍⽣系列实例图绘制~◀论⽂排版系统讲解（告别AI）◀PPT默认分辨率设置及⾼清图⽚导出技巧（超实⽤）◀直⽅图的三维⽴体化（实⽤）◀⾓度测量（三种⽅法及神器下载）◀三维融合效果模型绘制◀综述类饼状⽰意图绘制⽅法（chem rev）◀各类晶体、蛋⽩结构查找及通⽤绘制⽅法（转换法）◀公式编写不⽤愁：超简单免费公式编写⽅法介绍-再补充（全、实⽤）◀烧杯、量筒、锥形瓶等各类伪三维图形通⽤画法◀多⾯体结构及球棍模型通⽤画法(伪三维)。
mercury教程
mercury教程一、File（文件）1、Open：打开一个新的cif文件2、Recent Files：最近打开的文件3、Save As：保存，可保存的格式有cif、txt、mol、mryx、res、jpg、pdf、png、tif等格式二、n（选择）1、Select All：选择全部原子2、Select：选择部分类型原子Select Hydrogen：选择全部氢原子Select Non-Hydrogen：选择全部非氢原子Select Carbons：选择全部碳原子Select Non-H，C：选择全部非氢非碳原子Select Meral Atoms：选择全部金属原子Select Non-Meral Atoms：选择全部非金属原子3、Deselect All：取消选择所有原子4、Deselect：取消选择部分类型原子，可以选择氢原子、非氢原子、碳原子、非氢非碳原子、金属原子、非金属原子等三、Display（显示）1、Styles：款式Wireframe：线框图Stick：棍图Ball and stick：球棍图Spacefill：空间填充图Ellipsoid：椭球图XXX：多面体图Stick settings：棍图设置XXX：球棍图设置XXX：空间填充图设置XXX：椭球图设置Polyhedral settings：多面体图设置Contact settings：联系设置Measurement settings：测量设置2、Labels：标签Atoms：原子Centroids：重心Planes：平面Label all：全部标签Clear all labels：清楚所有标签XXX：重置标签位置Label colour：标签颜色Label size：标签大小3、Colours（颜色）Atoms：原子Bonds：键Centroids：重心Planes：平面Contact：联系Element colours：元素颜色Labels：标签Background settings：配景设置4、Show/Hide：显示/隐藏Show hydrogents：显示氢原子XXX：隐藏氢原子Atoms：原子Centroids：重心Planes：平面Show all：显示全部5、Dispiay ns：显示选项6、Manage Styles：管理样式（可以设置自定义样式）7、View along：查看8、Toolbars：工具栏Dispiay ns：表现选项Graph Sets：图集XXX：分子间电位Searches：搜刮Post Search ns：发布搜刮选项Structure Navigator：结构导航器Picking Toolbar：选择工具栏Labels：标签Dispiay：表现XXX：样式管理器工具栏Atom XXX：原子选择工具栏Select by SMARTS：由SMARTS选择XXX：动画工具栏XXX：晶体定位操作XXX：对齐和定向操作4、Calculate（计算）1、Centroids：重心2、Planes：平面3、Packing/Slicing：堆积和切断4、Contacts：联系5、Molecular Shell：份子壳6、Powder Pattern：粉末谱图五、快速键Ctrl+A：全选原子Ctrl+D：取消选择所有原子Ctrl+Z：撤销操作Ctrl+左键：平移Shift+左键：平面旋转Alt+左键：圈选原子左键：任意角度旋转右键：放大或缩小若何修改原子、键、配景和标签的大小或色彩一、改变原子颜色1、改变某种元素的原子颜色Display→Colours→Element colours选择要改变颜色的元素，进入颜色修改界面，选择合适的颜色，OK→Close，即可改变元素的颜色2、改变一个大概几个原子的色彩选中这个或者这几个原子，右键→Colors→Color，进入颜色选择界面，选择合适的颜色即可二、改变原子和键的大小1、sticks（棍状）形式下改变键的大小Display→XXX→Stick settings滑动箭头所示按钮，即可改变键的粗细2、Ball and Stick（球棍）模式下改变原子和键的大小Display→XXX同上面一样滑动滑块改变大小Non-metals：改变非金属原子的大小Metals：改变金属原子的大小Bond Radius：改变的键的粗细三、改变背景和标签的颜色Display→Display ns选择Background，点击箭头所示的白色方块即可进入颜色编辑界面，选择合适的颜色即可选择Labels，便可进入标签修改界面。
crystalmaker组合结构
crystalmaker组合结构Crystalmaker组合结构Crystalmaker是一款用于可视化和分析晶体结构的软件工具，可以帮助科学家、研究人员和教育工作者更好地理解和研究晶体的性质和行为。
Crystalmaker提供了一种直观的方式来呈现晶体的结构，使用户能够更深入地探索晶体的微观世界。
Crystalmaker的组合结构功能是其最重要和强大的特点之一。
通过将不同的晶体结构组合在一起，用户可以模拟新的晶体材料，并预测其性质和行为。
这对于材料科学领域的研究非常有价值，可以帮助研究人员设计和开发更先进的材料。
Crystalmaker的组合结构功能可以通过几个简单的步骤来实现。
首先，用户需要选择要组合的晶体结构。
Crystalmaker提供了一个广泛的晶体数据库，用户可以从中选择合适的晶体结构。
其次，用户需要将所选的晶体结构导入到Crystalmaker中，并将其放置在合适的位置。
用户可以通过移动、旋转和缩放晶体来调整其位置和大小。
最后，用户需要将不同的晶体结构连接在一起，形成一个完整的组合结构。
Crystalmaker提供了多种连接方式，用户可以根据需要选择合适的连接方式。
通过Crystalmaker的组合结构功能，用户可以模拟各种不同类型的晶体组合。
例如，用户可以将金属晶格和非金属晶格组合在一起，形成新的金属合金。
这对于研究金属合金的性质和行为非常有帮助，可以帮助研究人员设计更强硬、更耐磨的金属材料。
此外，用户还可以将不同的晶体结构组合在一起，形成多孔材料。
这对于研究多孔材料的吸附性能和分离性能非常重要，可以帮助研究人员设计更高效的吸附材料和分离膜。
Crystalmaker的组合结构功能还可以用于研究晶体的界面和缺陷。
通过将不同的晶体结构连接在一起，用户可以模拟晶体的界面。
这对于研究界面的结构和性质非常有帮助，可以帮助研究人员设计更稳定和可控的界面。
此外，用户还可以在晶体中引入缺陷，例如点缺陷、线缺陷和面缺陷。
晶体模型绘制Diamond3.2
晶体结构立体模型建构软件（Diamond）教程中国海洋大学材料科学与工程研究院晶体结构立体模型建构软件-Diamond的使用在使用Diamond软件构造晶体模型时，需要知道晶体的结构数据，即晶体的空间群、晶胞参数和原子坐标。
晶体结构数据可以手动输入，也可以直接从晶体信息文件中获得。
我们将通过几个例子来说明软件的使用方法。
一、NaCl晶体结构模型的构造下面我们以NaCl为例手动输入晶体结构数据。
NaCl晶体的结构数据为：空间群Fm-3m(225)；晶胞参数a=5.64Å；原子坐标Na:4a, Cl:4b。
我们将通过这个例子学会如下操作：1、学会手动输入晶体结构数据；2、学会晶体模型的构造；3、学会旋转晶体模型，从不同的角度观察；4、学会改变背景和原子及晶胞的颜色等参数；5、学会以一种原子为中心，另一种原子为配位原子构造配位多面体；6、学会多面体外观的设计。
打开软件，界面如下图所示：图1点击“File| New”，出现一对话窗口，如下图，选择第二个选项，按“OK”。
图 2结果生成一个名字为Diamond1的空白的页面，同时弹出一个名字为New Structure的对话窗口，点“下一步”，在新弹出的窗口中确认Crystal Structure with cell and Spacegroup被选中，在Cell length中输入5.64，如下图：图 3注意Space group（空间群）后是否我们需要的NaCl晶体的空间群Fm-3m(225)，如果不是，点击Browse 按钮，在弹出的对话窗口中选中Fm-3m(225)，即在Fm-3m(225)上点击使其变蓝色，如下图。
点“OK”回到前面的对话窗口。
中心对称图4点“下一步”（在出现的如下图的对话框中可以输入原子坐标，即在“Atomic parameters“中输入相应的元素符号和原子坐标值，但我们将在其他的地方做这个工作）图5点“下一步”，在出现的Completing the new structure Assistant窗口中有三个选项：Start structure picture; Launch the structure picture creation assistant; Create structure picture automaticly。
Crystal Ball 模拟基础教程
Crystal Ball 模拟基础教程利用Crystal Ball 进行计算机仿真学习目标13.2个案研究：佛莱迪报童问题（13.1节） 13.3–13.19竞标建设计划（13.2节） 13.20–13.24项目管理：信用建设公司（13.3节）13.25–13.32现金流量管理：沼泽地黄金岁月公司（13.4节） 13.33–13.37财务风险分析：久大发展公司（13.5节）13.38–13.42运输业收入管理（13.6节）13.43–13.48选择合适的分配（13.7节）13.49–13.68利用决策表做决策（13.8节） 13.69–13.84学习目标在读完本章后，你应该能够：1. 描述Crystal Ball在计算机仿真中的角色。
2. 利用Crystal Ball来解决Excel软件包所无法执行的各类基本计算机仿真。
3. 解释利用Crystal Ball于计算机仿真中的结果。
4. 在获得预期的准确度水平后，利用Crystal Ball的特色来停止计算机仿真。
5. 描述当使用Crystal Ball时可以搭配计算机仿真的机率分配之特色。
6. 利用Crystal Ball程序辨识出符合历史数据的连续分配。
7. 利用Crystal Ball的特色来产生一些帮助决策的决策表和趋势图。
报童佛莱迪佛莱迪在某大城市里主要市区经营一家报摊。
佛莱迪贩卖各类的报纸和杂志，其中最贵的报纸为财经日报。
财经日报相关的成本资料：–每份报纸的成本为1.50美元–每份报纸的售价为2.50美元–没售出的报纸，每份报纸可以获得0.50美元的偿还金财经日报的销售资料：–佛莱迪每天的销售量介于40到70份之间。
–销售数量介于40到70份之间任何数值的频率相同。
运用仿真之电子表格模式Crystal Ball的应用利用Crystal Ball来进行计算机仿真有四个步骤：–定义随机输入栏。
–定义输出栏来预测。
–设定执行偏好。
–执行模拟。
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第一章界面介绍本章详细介绍了Crystalmaker的操作界面，便于用户选择操作命令和保存文件。
本章所有的图片都是在Mac OS X 10.5 “Peopard”上获得的。
菜单介绍Crystalmaker (Mac version) 记录、应用文件，隐藏或退出程序File打开、创建、保存和关闭文件。
输出相关的文本和图片Edit编辑文本、结构和化学键；拷贝图片到剪切板，或者取消上步操作Selection选择原子相关的操作，例如标注、显示、隐藏原子Model选择结构模型显示的形式Rendering对模型的显示进行不同的设置Transform旋转、测量图片命令。
可以测量化学键角度，或者产生粉末/单晶衍射花样Window对Crystalmaker操作界面进行设置Help提供在线帮助和用户手册图片界面结构在图片界面中显示。
选择Window > Show Ruler可以添加标尺。
图片面板结构主要在图片面板中显示，在这里可以对结构进行旋转和测量操作，或者使用快捷键对其进行操作。
工具栏工具栏是对工具板的很好补充。
对于常用的命令还设置了快捷键。
打开或关闭工具栏：选择Winsow > Show/Hide ToolbarSidebar包括Site Browser和Notes pane打开/隐藏Sidebar的两种方法：(1) 点击Toolbar上的Sidebar;(2) 选择Window > Show/Hide Sidebar隐藏Notes pane的三种方法：(1) 点击Toolbar上的Notes pane来显示/隐藏Notes pane；(2) 双击Sidebrowser和Notes pane之间的分隔栏；(3) 把Sidebrowser和Notes pane之间的分隔栏拖动到最下面隐藏Site Browser的方法：(1) 把Sidebrowser和Notes pane之间的分隔栏拖动到最上面；Site BrowserSite Browser提供关于结构中原子的信息。
可以按照元素、位置标注对列表进行重新排列、同时在Site Browser中，可以对原子的颜色、可见度、标注以及半径进行编辑，并对单个位置或者同元素的原子簇进行编辑。
Notes pane在Notes pane中，可以保存关于结构的文本信息Overview WindowOverview Window提供关于复杂结构的动画和视频制作、文件浏览以及结构输出的具体细节等信息，由Views, History, file和Log四部分构成。
View PaneView pane有以下用处：(1) 记录从特定视角观察晶体的图片；(2) 在统一界面中同时操作几个晶体；(3) 制作动画和视频创建操作结构的视图，方法有二：(1) 点击window toolbar中的Snapshot；(2) 选择File > Take Snapshot一张结构图片就会出现在View pane中。
从已有文件中创建视图：(1) 把一个或多个文件拖动到Views pane中。
每个文件就会加载到Graphics window中，缩略图会再在到Views pane中；(2) 当Views pane可视时，点击Add按钮，然后选择想要加载的文件。
加载一个视图：点击views pane中的视图，使用键盘上的箭头进行选择。
重新排列视图：点击并拖动视图，对其进行重排重命名视图：点击视图文件，输入新的文件名，按Return或enter键完成设置更新视图：用户可以重新生成一个视图，以匹配与现在显示的结构：右键单击要选择的视图，选择Replace with current view同步视图Crystalmaker强大之处在于它能快读的同步多个窗口。
这样，如果一个视图和另一个相关，用户可以对它们的显示进行设置，诸如原子颜色、渲染样式、位向、尺寸等。
使用同步命令：(1) 确保主视图在Graphics window的最前面，这个结构的设置将应用到所有的其他结构中；(2) 选择Transform > Synchronize命令；(3) 出现一个对话框，显示需要同步哪些视图；(4) 点击OK开始同步。
动画视图Overview Actions菜单上的Play命令，可以反复播放视图，同时还可以全屏播放或者结构旋转。
用户可以控制播放的速度。
按escape退出动画播放。
从视图中生成视频使用Overview Actions菜单上的Play命令，可以生成一个Quicktime视频。
这在展示结构行为和相转变时比较有用。
Files Pane用户可以在这个面板上管理最近的文件，并在快速的在不同的结构间进行切换。
新近打开的文件会显示在Files Pane的左上角。
用户也可以把未打开的结构加到Files Pane 中，并会显示为缩略图。
添加文件到Files Pane：(1) 把一个或多个文件拖动到Files Pane中；(2) 或者点击Overview上的Add按钮，然后选择想要加载的文件。
把文件从Files Pane移除：(1) 右键点击文件缩略图，选择Remove命令；(2) 点击window’s Actions按钮，选择Clear Files List，移除所有文件。
重新排列缩略图：点击拖动缩略图，对其进行重新排列。
使用Files Pane打开一个文件：(1) 点击文件的缩略图，在现在窗口中打开文件；(2) 右键点击缩略图，选择Open in New Window，在新窗口中打开文件。
显示Slideshows和Animations使用Views pane，我们可以使用Files pane中的文件来展示Animated slideshows。
选用Overview Actions 菜单。
History PaneCrystalmaker会跟踪文件修改，并把它们显示在History Pane中。
History Pane左上侧的缩略图为用户最近打开的文件；接下来的缩略图代表按时间顺序编辑过的文件。
点击缩略图，转到那个阶段的文件。
Log PaneOverview window上的Log Pane显示了状态信息和屏幕工具的操作结果和化学键搜索结果。
用户可以把Log Pane中的信息拷贝到其他程序中。
在Overview Actions 菜单中，选择Text Options可以对文本进行编辑。
工具面板(Tools Palette)工具面板中的屏幕工具，可以操作、测量和编辑结构。
测量工具加上旋转工具，可以对晶体进行精确位向操作。
用户可以在键盘上输入相应的字母来选择工具。
在工具面板的最上面，会显示晶体结构或单分子的彩色图片：这是显示是否在分子模式的快捷方法。
分子模式用来描述原子团以及其它没有长程对称的结构。
使用工具面板选择Window > Palettes显示工具面板。
所有窗口的大小和位置都在在上次退出程序时自动保存。
设定工作台选择Window > Workspace，在其子菜单中显示工作台。
全屏模式Crystalmaker支持全屏模式，便于用户专注于结构。
全屏模式下，Graphics window会自动调整以适应全屏的尺寸。
通过把鼠标移至屏幕的上部，用户仍然可以使用菜单命令。
进入全屏模式：点击window toolbar或者Tools palette上的Full Screen按钮，或者快捷键F。
退出全屏模式：(1) 按Escape键；(2) 或者点击Tools pallete中的Standard Screen，快捷键F。
在线帮助系统Crystalmaker的在线帮助可以通过以下途径获得：(1) 选择Help菜单；(2) 点击一些出口中左下角的Help；(3) 点击F1。
第二章软件预览本章分为三个连续的部分，分别介绍Crystalmaler的不同功能。
第一部分我们将建立一个新的晶体结构，包括对称性和化学键。
第二部分我们研究不同的显示选项，包括图形样式和不同的模型类型。
最后一部分我们将使用程序中的不同工具来测量结构、显示配位团，以及以文本文件和网页的方式输出数据。
第一节建立无机物晶体结构本节我们介绍如何创建、显示和保存一个新的晶体结构。
我们将以和其他无机物结构类似MgAl2O4为例。
结构数据在Crystalmaker中，可以使用数据编辑器来编辑晶体常数、对称性以及位置坐标。
同时还可以编辑颜色、原子半径，定义化学键等。
使用以下结构数据：输入结构数据(1) 选择File > New Crystal命令；(2) 出现以下Edit Crystal对话框：(3) 在Spacegroup栏中输入以下字符：F d 3 m [origin 2](字符间留空格)。
如果输入格式错误，Crystalmaker会提醒用户。
如果空间群符号输入正确，只有一个晶格常数会保留。
Crystalmaker识别出输入的空间群符号对应一个立方晶体，并且只需要a单胞参数。
(4) 按Tab键移至a栏，输入8.08，对话框如下：(5) 现在我们需要考虑晶体的非对称基元中的三个位置，对于每个位置，Crystalmaker需要以下信息：位置标注(最多六位字符，字符间不能有空格)；一个或多个化学符号以及它们的占位率值(Crystalmaker使用元素符号来决定其原子半径和原子颜色；元素符号可以是一个或两个字母)；每个位置的xyz位置坐标。
可以以分数(1/2)或小数(0.5)形式输入。
(6) 点击Add按钮，或者按回车键开始编辑一个新的位置；(7) 窗口中会出现包括默认的标注、位置坐标和占位率的条目。
我们对这些设置进行编辑；(8) 加亮位置位置标注。
输入一个新的标注(最多六位字符，不能包括空格)——我们选择Al(1)。
按Tal键移至下一个编辑栏；(9) 假定这个晶体有序，我们只需要输入单一的占位率值。
此例中我们输入“Al 1.0”；(10) 在x, y, z栏中输入0.5，编辑窗口如下：(11) 按Return键完成编辑该位置；(12) 现在，按照结构数据表给出的信息，分别输入Mg和O位置的数据。
使用Add按钮添加新位置，或使用Remove删除一个位置；(13) 当完成晶体数据输入后，对话框如下：显示晶体现在，所有的结构数据都以输入，接下来我们要显示一个单胞内的所有原子：(1) 点击以上Edit Crystal窗口的OK按钮；(2) Edit Crystal窗口消失，状态窗口出现。
在状态窗口中，使用输入数据建立的晶体就会出现。
这时，一个立方形外形，包括一组原子的结构就会出现。
改变原子的颜色和半径如果用户输入的元素符号被Crystalmaker识别，就会自动赋予它一个颜色和半径。
如果用户想要在晶体中包括其他元素类型，并且改变Crystalmaker的默认设置，使用Site Browser可以对原子的颜色和半径进行定义，如下：(1) 选择Window > Show Sidebar命令，出现Site Browser窗口。