动物组织块DNA的提取

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【实验目的】

(1)学习并掌握动物组织总DNA的提取方法及其原理。

(2)从肝脏组织中提取到一定量的纯净的DNA样品。

【实验原理】

DNA是一切生物细胞的重要组成成分,主要存在于细胞核中。通过研磨和SDS作用破碎细胞;苯酚和氯仿可使蛋白质变性,用其混合液(酚:氯仿:异戊醇)重复抽提,使蛋白质变性,然后离心除去变性蛋白质;RNase降解RNA,从而得到纯净的DNA分子。

【仪器、材料、试剂】

(一)仪器

1.高速离心机

2.烘箱

3.冰箱

4.水浴锅

5.微量移液器

6.高压灭菌锅

(二)材料

1.生理盐水

2.十二烷基硫酸钠(SDS)

3.三羟甲基氨基甲烷(Tris)

4.乙二胺四乙酸(EDTA)

5.饱和酚

6.氯仿

7.异戊醇

8.无水乙醇

9.75%乙醇

10.蛋白酶K

11.RNase酶

12.手术剪刀、镊子、吸水纸

13.微量取液器

14.研钵、1.5mL 离心管、一次性手套、1.5mL离心管架、记号笔

(三)试剂配制

1.Tris–HCL 1mol/L PH8.0 50ml

配制方法:

40ml双蒸水,6.057g固体Tris放入烧杯中溶解,用浓盐酸调PH值到8.0,转移到50ml 容量瓶中,加入双蒸水定容,摇匀后,转到准备好的输液瓶中,贴上标签,高压灭菌后,降至室温,4℃保存备用。

2.生理盐水: 0.85%NaCL 100ml

配制方法:

在20ml双蒸水中溶解0.85g固体NaCL,加水定容至100ml,摇匀后,转到准备好的输液瓶中,贴上标签,高压灭菌后,降至室温,4℃保存备用。

3.EDTA 0.5mol/L PH8.0 50ml

配制方法:

将9.08g的EDTA·Na2·2H2O溶解于40ml双蒸水,用1g的NaOH颗粒(慢慢逐步加入)调PH值到8.0,用50ml容量瓶定容,如果EDTA难溶,先加NaOH溶解,然后逐步加EDTA·Na2·2H2O。

4.TES缓冲液(释放DNA)100ml

配制方法:

将0.5844g的5 mol/lNaCl溶解于80ml双蒸水,在分别加入1ml的0.5 mol/l EDTA、0.2ml 的Tris-HCl (pH=8.0),加定容至100ml, 摇匀后,转到准备好的输液瓶中,贴上标签,高压灭菌后,降至室温,4℃保存备用。

5.10% SDS(变性剂破细胞壁)100ml

配制方法:

将10g的十二烷基硫酸钠(SDS)溶解于80ml双蒸水于68℃加热溶解,用浓HCl调至PH=7.2,定容至100ml,摇匀后,转到准备好的输液瓶中,贴上标签,4℃保存备用。6.蛋白酶K(降解蛋白质):20mg/mL 无菌三蒸水溶解。

7.RNA酶(降解RNA)

配制方法:

将胰RNA酶(RNA酶A)溶于10mmol/L的Tris·CL(PH7.5)、15mmol/LNaCL中,配成10mg/ml的浓度,于100℃加热15min,缓慢冷却至室温,分装成小份存于–20℃。8.氯仿:异戊醇=24:1 100ml

按24:1的比例加入氯仿、异戊醇,摇匀,转到准备好的瓶中,贴上标签,4℃保存备用。9.TE缓冲液(溶解DNA)PH8.0 50ml

配制方法:

将0.5ml 的10mmol Tris-HCl(PH8.0) 、0.1ml的0.5mol/l EDTA(PH8.0) 加入到50ml的容量瓶中,调PH8.0定容至50ml摇匀后,转到准备好的瓶中,贴上标签,高压灭菌后,降至室温,4℃保存备用。

【实验步骤】

1.组织块解冻,用生理盐水洗去血污,剪取约0.5g组织,放入1.5ml离心管中,剪碎。2.加入0.45ml TES混匀,再加入50ul SDS(10%),5.0ul蛋白酶K(20mg/ml),充分混匀后,于56°C保温4-6h,每2h摇1次。

3.放置到室温,加入等体积饱和酚(500ul),颠倒混匀,10000r/m,离心10m,分离水相和有机相,小心吸取上层含核酸的水相,到一个新的1.5ml离心管。

4.加入等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),颠倒混匀,10000r/m,离心10分钟,取上层转移到新的1.5ml离心管中。

5.加入等体积氯仿:异戊醇(24:1),颠倒混匀,10000r/m,离心10分钟,取上层清液到一个新的1.5ml离心管。

6.加入2.5倍体积的-20°C预冷的无水乙醇沉淀DNA,观察现象。

7.12000 r/m,离心10分钟,弃乙醇。

8.-20°C保存的75%乙醇洗涤,10000 r/m,离心5分钟,去乙醇,55°C干燥DNA。9.加入适量TE溶解DNA(具体依DNA的多少而定),-20°C保存备用。

【注意事项】

1.抽提每一步用力要柔和,防止机械剪切力对DNA的损伤。

2.取上层清液时,注意不要吸起中间的蛋白质层。

3.乙醇漂洗去乙醇时,不要荡起DNA。

4.离心后,不要晃动离心管,拿管要稳,斜面朝外。

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