质粒的提取酶切 实验报告

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实验一质粒的提取酶切

实验目的

掌握质粒小量快速提取法。用琼脂糖凝胶电泳法鉴定其纯度。

实验原理

质粒是一种染色体外的稳定遗传因子。大小在1~200kb之间,具有双链闭合环状结构的DNA分子。主要发现于细菌、放线菌和真菌细胞中。质粒具有自主复制和转录能力,能使子代细胞保持它们恒定的拷贝数,可表达它携带的遗传信息。他可独立游离在细胞质内,也可整合到细菌染色体中,它离开宿主的细胞就不能存活,而它控制的许多生物学功能却赋予宿主细胞的某些表型。

采用溶菌酶可破坏菌体细胞壁,十二烷基磺酸钠(SDS)可使细胞壁裂解,经溶菌酶和阴离子去污剂(SDS)处理后,细菌DNA缠绕附着在细胞壁碎片上,离心时易被沉淀出来,而质粒DNA则留在上清液中。用酒精沉淀洗涤,可得到质粒DNA。

在细胞内,共价闭环DNA(cccDNA)常以超螺旋形式存在。若两条链中有一条链发生一处或多处断裂,分子就能旋转而消除链的张力,这种松弛型的分子叫作开环DNA(ocDNA)。在电泳时,同一质粒如以cccDNA形式存在,它比其开环和线状DNA的泳动速度都快,因此在本实验中,质粒DNA在电泳凝胶中呈现3条区带。

限制性内切酶是一种工具酶,这类酶的特点是具有能够识别双链DNA分子上的特异核苷酸顺序的能力,能在这个特异性核苷酸序列内,切断DNA的双链,形成一定长度和顺序DNA片段。EcoR I和Bgl II的识别序列和切口是: EcoR I:G↓AATTC

Bgl II: A↓GATCT

G,A等核苷酸表示酶的识别序列,箭头表示酶切口。限制性内切酶对环状质粒DNA有多少切口,就能产生多少酶切片段,因此鉴定酶切后的片段在电泳凝胶的区带数,就可以推断酶切口的数目,从片段的迁移率可以大致判断酶切片段大小的差别。用已知分子量的线状DNA为对照,通过电泳迁移率的比较,就可以粗略推测分子形状相同的未知DNA的分子量。

实验步骤

(一)质粒的提取

ɑ的大肠杆菌接种于5ml含100μg/ml氨苄青(二)1.培养细菌将带有质粒DH

5

霉素的1×LB中,37℃培养过夜。

2.取液体培养菌液置塑料离心管中,10 000r/min离心lmin,去掉上清液。加入150μl溶液I,充分混匀,在室温下放置10min。

3.加入200μl新配制的溶液II,加盖后温和颠倒5~10次,使之混匀,冰上放置2min。

4.加入150μl冰冷的溶液III,加盖后温和颠倒5~10次,使之混匀,冰上放置10min。

5.用台式高速离心机,10 000r/min离心5min,将上清液移入干净的离心管中。

6.向上清液中加入等体积酚/氯仿(1:1,v/v),振荡混匀,转速10 000r/min,离心2min,将上清液转移至新的离心管中。

7.向上清液加5mol/LNaCl至终浓度为L,混匀,再加入2倍体积无水乙醇,混匀,室温放置2min,离心5min,倒去上清乙醇溶液,把离心管倒扣在吸水纸上,吸干液体。

8.加 70%乙醇,振荡并离心,倒去上清液,真空抽干或室温自然干燥。

9.加入50μl含RNase A 20μg/ml的TE缓冲液溶解提取物,室温放置30min

以上,使DNA充分溶解待用或置-20℃备用

(也可用试剂盒按操作步骤提取质粒)

10.将抽提出来的质粒进行琼脂糖凝胶电泳

(三)质粒的酶切和鉴定

质粒DNA酶切的加样

重组质粒 5μL

10× buffer 1μL

Bgl II 1μL

EcoR I 1μL

ddH2O 2μL

加样后的进行金属浴 4h ℃

再进行琼脂糖凝胶电泳

结果与分析

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