基因组DNA的分离纯化提取方法综述

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基因组DNA的分离纯化提取方法综述

中西医结合学院摘要: DNA 的提取是分子生物学研究的基础技术, 提取的DNA 的纯度及结构完整性是进行基因工程各项研究所必需的条件。归纳基因组DNA提取的各个环节.同时对DNA提取过程中的常见问题、原因及应对策略作简要的分析综述。

关键词:基因组DNA;分离;纯化;提取

自20 世纪50 年代Watson 和Crick 提出DNA 双螺旋模型以来, 分子生物学在广度和深度上都获得空前的发展。核酸是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象。核酸样品的质量直接关系到分子生物学实验的成败。研究和应用DNA的基础是提取纯化结构完整的DNA,作为分子生物学研究的基础技术,至今建立了多样的提取纯化方法。本文针对DNA的分离纯化提取过程中所使用的不同方法进行综述。

实验的一般步骤为

1.破碎细胞.

2.DNA的提取

3.DNA的纯化

第一步中破碎细胞常用有三种方法

①机械法:主要通过机械切力的作用使组织细胞破碎的方法。

本实验常用的器械有玻璃匀浆器。将剪碎的组织置于管中,再套入研杆来回研磨,上下移动,即可将细胞研碎。匀浆器的研钵磨球和玻璃管内壁之间间隙保持在十分之几毫米距离。此法细胞破碎程度较高,适用于量少和动物脏器组织。

②化学法:有些化学药品可以改变细胞膜的通透性从而使内合物

有选择地渗透出来。例如某些有机溶剂(如苯、甲苯)、抗生素、表面活性剂、金属螯合剂、变性剂等。

实验中常用GA缓冲液,GA缓冲液中含有表面活性剂可以打开细胞的磷脂双分子层,增加通透性。且GA缓冲液是低渗溶液,细胞易吸水涨破,达到更好打开细胞的效果。

特点:作用比较温和

存在的问题:作用时间长,效率低;化学试剂毒性较强,同时对产物也有毒害作用,进一步分离时需要用透析等方法除去这些试剂。

③酶解法:利用各种水解酶,破碎细胞将细胞内含物释放出来。

常用蛋白酶K和十二烷基硫酸钠(SDS)消化破碎细胞。

此种方法的特点是:适用范围广;作用条件温和;内含物成分不易受到破坏。但其成本高,限制了大规模的利用且耗时较长。

以上三种破碎细胞的方法可结合使用,使细胞破碎完全,利于接下来的步骤。

第二步中DNA的提取有两种方法:

①沉淀法

实验常采用异丙醇或无水乙醇快速提取DNA

一般经典酒精标本DNA提取方法都会加入蛋白酶K,且在56℃条件下消化3h以上,以达到组织中蛋白质的完全消化。得到的提取液经RNA酶处理,酚、氯仿和异戊醇反复抽提,即可得较纯的DNA产物。

②介质吸附法

一般介质吸附法有三种吸附材料可供选择

Ⅰ.硅介质

硅介质纯化提取DNA原理是:在高盐低pH值条件下结合核酸,反复漂洗,后再低盐高pH值条件下洗脱。

Ⅱ.阴离子交换树脂

阴离子交换树脂纯化提取DNA原理是:在低盐高pH值条件下结合核酸,高盐低pH值条件下洗脱。

Ⅲ.磁珠

磁珠吸附的原理是:磁性微粒挂上不同基因可吸附并携带RNA 在第二步中DNA的提取的基础上进行第三步。

DNA的纯化分别在两种提取方法的基础上进行。

①沉淀法纯化

2种沉淀纯化方法的选取

Ⅰ.酚/氯仿抽提法:有机溶剂对操作人员损害较大;操作时间长Ⅱ.盐析法:操作经济,成本低但操作的时间比较长。

②介质吸附法纯化

反复用缓冲液漂洗后离心空甩2分钟,室温下晾干,用高pH低盐洗脱Buffer溶液洗脱。

常采用柱离心式纯化方法。其优点是抽提速度快,能有效去除影响下游实验的抑制物。但是这种纯化方法价格较贵。

上述即为一些常用DNA的分离纯化提取方法的综述,综合DNA的提取方法,各种提取方法也有很多相通之处,可以相互借鉴,相互结合,以达到更好的实验效果。随着生物技术的飞速发展,对这一技术的经验总结将会越来越多,更为简捷、高效的方法也必将出现,为生物技术提供更高纯度的DNA。

参考文献

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